mrcFFTSpectrum

From EosPedia
Jump to: navigation, search

mrcFFTSpectrum is Eos's Command that outputs FFT spectrums from each specified angle.


List of option

Main option

Option Essential/Optional Description Default
-i Essential Input: mrcImage(FFT) NULL
-o Optional Output: spectrum: ASCII stdout
-n Optional n-division: 2PI/n 1
-axis Optional axis 0.0
-c Optional ConfigurationFile NULL
-m Optional Mode 0
-h Optional Help  


-m details

Value Description
0


-o 's format

R	F1	F2	...	Fn
.	.	.	...	.
.	.	.	...	.
.	.	.	...	.

It outputs spectrum at each R and each angle.

Execution example

Input file's image

Input-mrcFFTSpectrum.png

Min

Max
Mean
SD

SE

5.8388e-05 (34, 19, 25)

269.463 (0, 0, 0)
0.184947
0.853561

0.00121937

Example of options only essential

              0         72610.2 
     0.00285714         9403.77 
     0.00571429          424.22 
     0.00857143         72.3162 
      0.0114286         53.0119 
      0.0142857         16.8282 
      0.0171429         5.76959 
           0.02         6.58468 
      0.0228571         3.23293 
      0.0257143         1.55617 
      0.0285714          1.6768 
      0.0314286         1.20942 
      0.0342857        0.906873 
      0.0371429        0.818493 
           0.04        0.641874 
      0.0428571        0.463089 
      0.0457143        0.443777 
      0.0485714        0.361395 
      0.0514286        0.330671 
      0.0542857        0.206129 
      0.0571429        0.236484 
           0.06        0.159589 
      0.0628571        0.126009 
      0.0657143        0.155259 
      0.0685714        0.133023 
      0.0714286       0.0925122 
      0.0742857        0.116136 
      0.0771429       0.0917471 
           0.08        0.071327 
      0.0828571       0.0729114 
      0.0857143       0.0688022 
      0.0885714       0.0585575 
      0.0914286       0.0579214 
      0.0942857       0.0547112 
      0.0971429        0.051852 
            0.1       0.0563705 

Option -n

Case: n=2

              0         72610.2               0 
     0.00285714         9540.94         9321.47 
     0.00571429         377.685         457.459 
     0.00857143         71.7113         72.7867 
      0.0114286         54.4599         51.7342 
      0.0142857         17.2292         16.4807 
      0.0171429         5.97049         5.58782 
           0.02         6.90724         6.29284 
      0.0228571         3.37276         3.10428 
      0.0257143         1.59725         1.51744 
      0.0285714         1.71636         1.63995 
      0.0314286         1.22438         1.19526 
      0.0342857        0.889703        0.923062 
      0.0371429        0.817146        0.819779 
           0.04        0.632989        0.650364 
      0.0428571        0.465223        0.461054 
      0.0457143        0.442187        0.445312 
      0.0485714        0.367417        0.355584 
      0.0514286        0.336318        0.325222 
      0.0542857        0.209724        0.202656 
      0.0571429        0.239088        0.233972 
           0.06        0.161831        0.157409 
      0.0628571        0.127638        0.124426 
      0.0657143        0.153156        0.157304 
      0.0685714        0.132966        0.133078 
      0.0714286       0.0932153       0.0918257 
      0.0742857        0.117086        0.115208 
      0.0771429        0.091885       0.0916127 
           0.08       0.0720596       0.0706101 
      0.0828571       0.0735423       0.0722951 
      0.0857143       0.0691698       0.0684419 
      0.0885714       0.0585733       0.0585419 
      0.0914286       0.0584944       0.0573604 
      0.0942857       0.0551845       0.0542469 
      0.0971429       0.0509491       0.0527389 
            0.1       0.0558718       0.0569212 

Option -axis

Case: axis=1, n=2

              0         72610.2               0 
     0.00285714         9403.77         9403.77 
     0.00571429          424.22          424.22 
     0.00857143         72.3162         72.3162 
      0.0114286         53.0119         53.0119 
      0.0142857         16.8282         16.8282 
      0.0171429         5.76959         5.76958 
           0.02         6.58468         6.58468 
      0.0228571         3.23293         3.23293 
      0.0257143         1.55617         1.55617 
      0.0285714          1.6768         1.67679 
      0.0314286         1.20942         1.20942 
      0.0342857        0.906873        0.906873 
      0.0371429        0.818492        0.818492 
           0.04        0.641874        0.641874 
      0.0428571        0.463089        0.463089 
      0.0457143        0.443778        0.443777 
      0.0485714        0.361395        0.361395 
      0.0514286        0.330671        0.330671 
      0.0542857        0.206129        0.206129 
      0.0571429        0.236484        0.236484 
           0.06        0.159589        0.159589 
      0.0628571        0.126009        0.126009 
      0.0657143        0.155259        0.155259 
      0.0685714        0.133023        0.133023 
      0.0714286       0.0925122       0.0925122 
      0.0742857        0.116136        0.116136 
      0.0771429       0.0917471       0.0917472 
           0.08        0.071327        0.071327 
      0.0828571       0.0729114       0.0729114 
      0.0857143       0.0688022       0.0688022 
      0.0885714       0.0585574       0.0585574 
      0.0914286       0.0579214       0.0579214 
      0.0942857       0.0547111       0.0547112 
      0.0971429        0.051852        0.051852 
            0.1       0.0589118       0.0535082