mrcImageUnbentROI

mrcImageUnbentROIとは２次元画像からのスプライン曲線に則った切り出しを行うEosのコマンドである。例えば、曲がったフィラメント画像を真っ直ぐにして解析したい場合等に使用する。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage	NULL
-o	必須	出力ファイル: mrcImage	NULL
-r	選択	roiLine: 可変入力: (x0, y0, x1, y1, ...)	NULL
-x	必須	幅: Source	1.0
-y	選択	高さ: Source	1.0
-W	選択	幅: Dst	1.0
-H	選択	高さ: Dst	1.0
-cor	選択	Correlation Window along Y-axis: [A]	360.0
-S	選択	When inputfile is shrinked	1
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

-rはスプライン曲線を決めるために入力が必要である。

モードの詳細

モード	説明
0

実行例

入力ファイルの画像

サイズ モード 最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

( 50, 80, 1) mrcFloatImage 0 (0, 0, 0) 178250 (35, 57, 0) 14921.9 30087.2 475.72

オプション　-x, -r

x=50, r=(30, 15, 25, 40, 45, 75)で実行

サイズ モード 最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

( 50, 65, 1) mrcFloatImage 0 (0, 0, 0) 178250 (28, 46, 0) 17170 31431.7 551.348

以降はx=50, r=(30, 15, 25, 40, 45, 75)で実行

オプション　-y

y=50で実行

サイズ モード 最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

( 50, 50, 1) mrcFloatImage 0 (0, 0, 0) 178250 (28, 46, 0) 20439.3 33908.1 678.161

オプション　-W

W=65で実行

サイズ モード 最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

mrcFloatImage 0 (0, 0, 0) 178250 (37, 47, 0) 17321.9 31658.9 487.06

オプション　-H

H=65, y=50で実行

サイズ モード 最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

( 50, 65, 1) mrcFloatImage 0 (0, 0, 0) 178250 (28, 60, 0) 20492.4 34038.3 597.072

オプション　-cor

cor=20で実行

サイズ モード 最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

( 50, 65, 1) mrcFloatImage 0 (0, 0, 0) 178250 (24, 48, 0) 18472.8 31551.4 553.448