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  1. $HOME/.Eos/Display2
  2. (検証)リモートのDockerコンテナからVirtualGLでOpenGL飛ばせるのか
  3. 2D classificationジョブのSTARファイル
  4. 3D auto-refineのSTARファイル
  5. 3D classificationのSTARファイル
  6. 3次元再構成
  7. API
  8. API集
  9. ASCII
  10. ActorMaker(API)
  11. Anaconda覚書
  12. Array(API)
  13. Bashによる統合
  14. CCP4
  15. CTF
  16. CTF estimationジョブのSTARファイル
  17. CTF補正
  18. CUDA
  19. CheckCommonLineData
  20. CheckOfOrientation
  21. CheckOrientationByDegree
  22. Cluster(API)
  23. Command Line Tools
  24. CommonLineCalculation
  25. CommonLineRankCalc k
  26. Contour(API)
  27. Crystal(API)
  28. CtfDetemine
  29. Cufft
  30. DCDFile(API)
  31. DMフォーマット
  32. DataBase(API)
  33. DataBaseCorbaBank(API)
  34. DataBaseCorbaImpl(API)
  35. DataBaseCorbaManager(API)
  36. DataBaseJournal(API)
  37. DataBaseMaker(API)
  38. DataBaseNote(API)
  39. DataSearcher(API)
  40. DataStore(API)
  41. Descartes2Polar
  42. Display2
  43. Display2による粒子抽出
  44. DisplayListNumber(API)
  45. DockerでJupyterLab
  46. DockerでPythonによるデータ分析環境を作る
  47. DockerでRELION
  48. DockerでcryoSPARCクラスタ
  49. DockerとNVIDIA Dockerのインストール
  50. Dockerのインストール
  51. Dockerコマンド備忘録
  52. Dockerトラブルシューティング
  53. Docker関連
  54. EMAN2プロセッサ
  55. EMAN2関連
  56. EMPIAR
  57. EMPIARからのデータダウンロード方法
  58. Eos
  59. Eos(API)
  60. Eos/PIONE
  61. Eos/PIONE/Zephyr/WITs/VEM システム
  62. Eos/src/Objects
  63. Eos/src/Tools
  64. EosCuda
  65. EosEnvSet
  66. EosOnCUDA
  67. EosOnLinux
  68. EosOnMac
  69. EosPThread
  70. Eos env
  71. Eospediaの編集で使用しているツール
  72. EosのTIPS
  73. Eosのインストール
  74. Eosのコマンド
  75. Eosの構造
  76. Eosの開発
  77. Eosの開発におけるTIPS
  78. Eos関連ソフトウェアのTIPS
  79. EvaluateCorrelationMapwithCommonLine
  80. FAQ
  81. FEIの制御
  82. FETOrientationSearchByAnnealing
  83. FETOrientationSearchByFeatureAlignment
  84. FETmapOrientationSearchBySimultaneousFitting
  85. FETsmallMapSetCreate forSimultaneousMinimization
  86. FRET解析
  87. FigureFactory(API)
  88. File(API)
  89. File Formats and Other Documentation
  90. GITHUB/PIONE
  91. GITの使い方
  92. GNU parallel
  93. GPGPU
  94. Gaussian
  95. Gaussian Checkpoint Files
  96. Gautomatch
  97. Gctf
  98. Git
  99. Gitコマンド備忘録
  100. HDF5
  101. HDFView
  102. HomologyStore(API)
  103. IMAGIC(API)
  104. IMOD/ETomo
  105. Imaris
  106. Integration Tools
  107. JSON
  108. JavaScript
  109. JavaScriptのTIPS
  110. JupyterLab
  111. JupyterLab設定
  112. LCalculationForOrientationSearch
  113. LD LIBRARY PATH
  114. LINDA
  115. LINUXに関連したソフトウェアのTIPS
  116. LVMの使い方
  117. Linuxコマンド備忘録
  118. Linux関連
  119. LoGピッキングのSTARファイル
  120. MPI(massage passing interface)
  121. MTF
  122. MTF無しでPostProcessing
  123. MacOSでAnaconda3を用いてEMAN2仮想環境を構築する
  124. MacOSでsshセッションが途切れる問題
  125. MacOSのzsh設定
  126. MachineIndependent
  127. Make
  128. Makefile
  129. Makefileによる統合
  130. Makegeneral
  131. Makeobj
  132. Maketool
  133. Map2D(API)
  134. Markdown
  135. Matplotlib tips
  136. Matrix3D(API)
  137. Memory(API)
  138. MicroED
  139. Moodle関連
  140. Motion correctionジョブのlogfile.pdf
  141. Motion correctionジョブのstarファイル
  142. MrcImage.h
  143. MrcImageBinarization
  144. MrcImageDensityConversion
  145. MrcImageTransepose
  146. NAMD
  147. NVIDIA Dockerのインストール
  148. NeuralNet(API)
  149. NoMachineでリモートデスクトップ
  150. Numpy tips
  151. OSXに関連したソフトウェアのTIPS
  152. OptionControlFile
  153. PDB
  154. PIONE
  155. PIONE Webclient
  156. PIONE Webclientチュートリアル
  157. PIONEによる統合
  158. PIONEのTIPS
  159. PIONEのインストール方法
  160. PIONEの式
  161. PIONEの起動方法
  162. PIONEコマンドのTIPS
  163. PIONEコマンド一覧
  164. PIONEチュートリアル
  165. PIONEチュートリアル-PNML
  166. PIONEチュートリアル-XES
  167. PIONEチュートリアル-package
  168. PIONE定義書
  169. PIONE定義書のTIPS
  170. PNML
  171. PSF
  172. PVM(API)
  173. Pandoc
  174. Particle extractionジョブのSTARファイル
  175. PickedDataStore(API)
  176. Polar2Descartes
  177. Polish後の3D auto-refineの標準出力
  178. ProM
  179. ProMの使い方
  180. Production system
  181. ProjectionDirectionMapCreate
  182. Property(API)
  183. PropertyTcl(API)
  184. ProtoObjectMethodCreate
  185. Pthread
  186. Python
  187. Python on Windows10
  188. Python tips
  189. PythonのためのVisual Studio Code設定覚書
  190. Pythonトラブルシューティング
  191. RELION
  192. RELION2のCentOSへの導入
  193. RELION2のScientificLinux7への導入
  194. RELION2のUbuntuへの導入
  195. RELION3.1チュートリアル
  196. RELION3のMacへの導入
  197. RELION3チュートリアル
  198. RELION tips
  199. RELIONのMacへの導入
  200. RELIONのSTARファイル
  201. RELIONの定義済みラベル
  202. RELIONチュートリアル
  203. RELIONトラブルシューティング
  204. RELIONビルド時のCMakeCache.txt
  205. RELIONビルド時のエラー1
  206. RELION備忘録
  207. RELION実装
  208. RELION理論
  209. ROI
  210. Random(API)
  211. Ref
  212. Ruby
  213. RubyのTIPS
  214. SBF-SEMからの３次元再構成
  215. SGDのアニーリングについて
  216. SIRT
  217. SerialEM
  218. ShapeMaker(API)
  219. Sinatra
  220. Small Tools
  221. Socket(API)
  222. SpecialNumber(API)
  223. String(API)
  224. Support
  225. Tcl/Tk
  226. Test
  227. Topaz
  228. UbuntuでAnaconda3を用いてEMAN2仮想環境を構築する
  229. VEM
  230. VEM/WITs
  231. VNCでリモートデスクトップ(CentOS-MacOS編)
  232. VNCでリモートデスクトップ(Ubuntu-MacOS編)
  233. Vector(API)
  234. VirtualGLでリモートのOpenGLアプリをぬるぬる動かす
  235. Visual Studio Code
  236. Visual Studio CodeでPythonデバッグ実行
  237. Visual Studio CodeでRuby開発
  238. Visual Studio Codeでリモート開発
  239. Visualmake
  240. WITs
  241. WITs-CLEM
  242. WITs-CLEM チュートリアル
  243. WITsの実行例
  244. WITsの構成
  245. WITsの環境
  246. WSLでEMAN2
  247. WeightCalculationOfCommonLineSearch
  248. WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogram
  249. WoPeD
  250. XES
  251. XML Schema
  252. XQuartz
  253. Xcode
  254. Zephyr
  255. angleMatchTest k
  256. anglediffchk
  257. array2mrc
  258. arrayPCA
  259. avsFile(API)
  260. bin2mrc
  261. bmp2mrc
  262. bmpFile(API)
  263. bmpFileInfo
  264. cgi
  265. chimera
  266. chimerax
  267. chimeraのTips
  268. clusterLog2ToLog
  269. clusterLogASCII2Binary
  270. clusterShow
  271. coordRotation
  272. cryoDRGN
  273. cryoSPARC
  274. cryoSPARC tips
  275. cryoSPARCトラブルシューティング
  276. ctfDeterminationFromMultiImage
  277. ctfDeterminationFromPhaseComparison
  278. ctfDeterminationFromPhaseComparison(API)
  279. ctfDeterminationFromThonRing
  280. ctfDetermine
  281. ctfDisplay
  282. ctfEnvelopFunction
  283. ctfEnvelopFunctionEstimate
  284. ctfFunction
  285. ctfInfo(API)
  286. ctfInfoSet
  287. ctfInfoWrite2(API)
  288. ctfMultiFunction
  289. ctfWeightMapCreation
  290. ctfZeroPoint
  291. ctfZeroPoint(API)
  292. cufft
  293. dataAnalysis kayabuki
  294. defocusDeterminationFromThonRing
  295. dm2mrc
  296. dmInfo
  297. dos2unix
  298. dsn6File(API)
  299. e2boxer.py
  300. e2display.pyによる単粒子サイズ計測
  301. eTomoチュートリアル
  302. electronWaveLength
  303. emData(API)
  304. emData2mrc
  305. energyTransferModelCheck
  306. energyTransferModelResultCheck
  307. eosAlsa(API)
  308. eosAxisSource(API)
  309. eosCuda(API)
  310. eosDataPicker(API)
  311. eosFunc(API)
  312. eosInteractorMyStyle(API)
  313. eosInteractorStyleStereo(API)
  314. eosList(API)
  315. eosMathAverage
  316. eosMathMedian
  317. eosMathSorting
  318. eosOpenGL(API)
  319. eosPThread(API)
  320. eosPoint(API)
  321. eosPointProjector
  322. eosPointRotation
  323. eosStereoRenderer(API)
  324. eosStereoWindow(API)
  325. eosTclNewCommandCreate(API)
  326. fftn(API)
  327. genUtil(API)
  328. gifFile(API)
  329. god
  330. hf2000(API)
  331. hostCondition
  332. html
  333. imagesView
  334. imodst2mrc
  335. instamatic
  336. ip2mrc
  337. ipyvolumeでインタラクティブ3Dプロット
  338. khorosData(API)
  339. lCommonLineCalculation(API)
  340. lDescartesIntoPolar(API)
  341. lEvaluateCorrelationMapwithCommonLine(API)
  342. lFETOrientationSearchByAnnealing(API)
  343. lFETOrientationSearchByFeatureAlignment(API)
  344. lFETmapOrientationSearchBySimultaneousFitting(API)
  345. lFETsmallMapSetCreate forSimultaneousMinimization(API)
  346. lFRET(API)
  347. largeIP(API)
  348. largeIPInfo
  349. larray2mrc(API)
  350. lastigmatismDetection(API)
  351. lctfDetermination(API)
  352. lhf2000LenzCurrent(API)
  353. lhf2000SpecimenPosition(API)
  354. ll2ltlg
  355. llData(API)
  356. llDataAverage
  357. llDataAxisSearch
  358. llDataCompare
  359. llDataContributionCalcDifferentN
  360. llDataDump
  361. llDataEquatorAdd
  362. llDataExtract
  363. llDataFit
  364. llDataInfo
  365. llDataLowPassFiltering
  366. llDataMultiCTFCompensation
  367. llDataNEstimation
  368. llDataNormalization
  369. llDataPrint
  370. llDataRescaling
  371. llDataResolutionCheck
  372. llDataSelectionEstimation
  373. llDataWeightSet
  374. llDatarMaxLimit
  375. llExtract
  376. llExtractCtfinfFileCreate
  377. llExtractCtrlFileCreate
  378. llExtractWithLayerSeparation
  379. llExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreate
  380. llExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreateMyosin
  381. llExtractWithLayerSeparationFilamentInfo
  382. lldb
  383. lll2ltlg(API)
  384. lllDataAxisSearch(API)
  385. lllDataCTF(API)
  386. lllDataCTFCompensate(API)
  387. lllDataCTFCompensation(API)
  388. lllDataCompare(API)
  389. lllDataContributionCalcDifferentN(API)
  390. lllDataDifferenceCalc(API)
  391. lllDataEquatorAdd(API)
  392. lllDataExtract(API)
  393. lllDataFit(API)
  394. lllDataFitAndAverage(API)
  395. lllDataFitParamInverse(API)
  396. lllDataLowPassFiltering(API)
  397. lllDataMergeDifferentN(API)
  398. lllDataRescaling(API)
  399. lllDatarMaxLimit(API)
  400. lllExtract(API)
  401. lllExtractCtfinfFileCreate(API)
  402. lllExtractdYEstimate(API)
  403. lltlg2mrc(API)
  404. lmolvie(API)
  405. lmolvieProteinStatus(API)
  406. lmrc2Dto3D(API)
  407. lmrc3Dto2D(API)
  408. lmrcFETnormalizeBySD(API)
  409. lmrcFFTExpression(API)
  410. lmrcFFTInfo(API)
  411. lmrcFSInfoScatteringAngularDistributionAverageSection(API)
  412. lmrcImage3DPad(API)
  413. lmrcImage3DWindowing(API)
  414. lmrcImageAddValue(API)
  415. lmrcImageAsProbability(API)
  416. lmrcImageAverage(API)
  417. lmrcImageBilateralFilter(API)
  418. lmrcImageBinarization(API)
  419. lmrcImageBoundaryInfo(API)
  420. lmrcImageCTFCompensation(API)
  421. lmrcImageCTFDetermination(API)
  422. lmrcImageCalcArea(API)
  423. lmrcImageCentre(API)
  424. lmrcImageClusterAnalysis(API)
  425. lmrcImageCommonLine(API)
  426. lmrcImageConnection(API)
  427. lmrcImageConnectivityNumberCalc(API)
  428. lmrcImageContourSurface(API)
  429. lmrcImageContourSurfaceCreate
  430. lmrcImageCorrelation(API)
  431. lmrcImageCrystalCreate(API)
  432. lmrcImageDataMaxAndMinGetByImage(API)
  433. lmrcImageDataStraightCopy(API)
  434. lmrcImageDeconvolution(API)
  435. lmrcImageDensity(API)
  436. lmrcImageDensityInverse(API)
  437. lmrcImageDensityNormalizationByImage(API)
  438. lmrcImageDistanceConversion(API)
  439. lmrcImageEdge(API)
  440. lmrcImageEdgeAverage(API)
  441. lmrcImageEdgeEnhancement(API)
  442. lmrcImageFOMCalc(API)
  443. lmrcImageFeatureExtraction(API)
  444. lmrcImageFileListAndEulerAngleDataRead(API)
  445. lmrcImageFilterCreate(API)
  446. lmrcImageFirstNoiseReductionByRelaxation(API)
  447. lmrcImageFloating(API)
  448. lmrcImageFourierNeighborCorrelation(API)
  449. lmrcImageFourierShellCorrelation(API)
  450. lmrcImageHoughTransform(API)
  451. lmrcImageLabeling(API)
  452. lmrcImageLogic(API)
  453. lmrcImageMasking(API)
  454. lmrcImageMirroring(API)
  455. lmrcImageModeChange(API)
  456. lmrcImageModelCreate(API)
  457. lmrcImageMontage(API)
  458. lmrcImageMorphology(API)
  459. lmrcImageMove(API)
  460. lmrcImageMultiplying(API)
  461. lmrcImageNoiseCreate(API)
  462. lmrcImageNormalizing(API)
  463. lmrcImageOneLineSimilarityCalc(API)
  464. lmrcImageOrientationSearchBySimultaneousMinimization(API)
  465. lmrcImagePad(API)
  466. lmrcImagePixelSummationOfProbabilityGetByImage(API)
  467. lmrcImagePosterization(API)
  468. lmrcImagePrint(API)
  469. lmrcImageProjection(API)
  470. lmrcImageProportionalDensityLevelSetByImage(API)
  471. lmrcImageROI2D(API)
  472. lmrcImageROI3D(API)
  473. lmrcImageRadialDistribution(API)
  474. lmrcImageRhoFiltering(API)
  475. lmrcImageSSDA(API)
  476. lmrcImageSamplingUnitChange(API)
  477. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxation(API)
  478. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationDijDimensionSet(API)
  479. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationDijValueCalculate(API)
  480. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationDijValueSet(API)
  481. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationQValueSet(API)
  482. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationRValueSet(API)
  483. lmrcImageShapePCA(API)
  484. lmrcImageSigmaCalculate(API)
  485. lmrcImageSinogram(API)
  486. lmrcImageSinogramFFT(API)
  487. lmrcImageSolventFlattening(API)
  488. lmrcImageSpatialFrequencyFilter(API)
  489. lmrcImageSphere(API)
  490. lmrcImageSplit(API)
  491. lmrcImageStudentCalculate(API)
  492. lmrcImageSubtractionCalc(API)
  493. lmrcImageSummationCalculate(API)
  494. lmrcImageSymmetryFind(API)
  495. lmrcImageTone(API)
  496. lmrcImageTransformDescartesIntoPolar(API)
  497. lmrcImageTriming(API)
  498. lmrcImageVolumeCalc(API)
  499. lmrcImageWindowing(API)
  500. lmrcImagesStatDataGet(API)

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