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(円筒マスクの作成)
(円筒マスクの作成)
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relion_helix_toolboxを用います。
 
relion_helix_toolboxを用います。
 
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> relion_helix_toolbox --cylinder --spherical_mask --cyl_outer_diameter <円筒の直径> --angpix <ピクセルサイズ Å/pix> \
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> relion_helix_toolbox --cylinder --spherical_mask --cyl_outer_diameter <円筒の直径> --angpix <ピクセルサイズ Å/pix> --o <出力ファイル名> \
 
       --boxdim <ボックスサイズ pix> --sphere_percentage <ボックスサイズに対する球面マスクの直径の比率> --width <コサイン型ソフトエッジの幅>
 
       --boxdim <ボックスサイズ pix> --sphere_percentage <ボックスサイズに対する球面マスクの直径の比率> --width <コサイン型ソフトエッジの幅>
 
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* --cylinderで円筒マスクの作成を指定。
 
* --cylinderで円筒マスクの作成を指定。
 
* --spherical_maskで円筒マスクを球マスクで削り、長さを調整。
 
* --spherical_maskで円筒マスクを球マスクで削り、長さを調整。

2020年6月24日 (水) 11:21時点における版

マスク

円筒マスクの作成

relion_helix_toolboxを用います。

> relion_helix_toolbox --cylinder --spherical_mask --cyl_outer_diameter <円筒の直径> --angpix <ピクセルサイズ Å/pix> --o <出力ファイル名> \
      --boxdim <ボックスサイズ pix> --sphere_percentage <ボックスサイズに対する球面マスクの直径の比率> --width <コサイン型ソフトエッジの幅>
  • --cylinderで円筒マスクの作成を指定。
  • --spherical_maskで円筒マスクを球マスクで削り、長さを調整。