「RELION tips」の版間の差分
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(→円筒マスクの作成) |
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− | > relion_helix_toolbox --cylinder --spherical_mask --cyl_outer_diameter <円筒の直径> --angpix <ピクセルサイズ Å/pix> \ | + | > relion_helix_toolbox --cylinder --spherical_mask --cyl_outer_diameter <円筒の直径> --angpix <ピクセルサイズ Å/pix> --o <出力ファイル名> \ |
--boxdim <ボックスサイズ pix> --sphere_percentage <ボックスサイズに対する球面マスクの直径の比率> --width <コサイン型ソフトエッジの幅> | --boxdim <ボックスサイズ pix> --sphere_percentage <ボックスサイズに対する球面マスクの直径の比率> --width <コサイン型ソフトエッジの幅> | ||
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* --cylinderで円筒マスクの作成を指定。 | * --cylinderで円筒マスクの作成を指定。 | ||
* --spherical_maskで円筒マスクを球マスクで削り、長さを調整。 | * --spherical_maskで円筒マスクを球マスクで削り、長さを調整。 |
2020年6月24日 (水) 02:21時点における版
マスク
円筒マスクの作成
relion_helix_toolboxを用います。
> relion_helix_toolbox --cylinder --spherical_mask --cyl_outer_diameter <円筒の直径> --angpix <ピクセルサイズ Å/pix> --o <出力ファイル名> \ --boxdim <ボックスサイズ pix> --sphere_percentage <ボックスサイズに対する球面マスクの直径の比率> --width <コサイン型ソフトエッジの幅>
- --cylinderで円筒マスクの作成を指定。
- --spherical_maskで円筒マスクを球マスクで削り、長さを調整。