RELION tips

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マスク

円筒マスクの作成

relion_helix_toolboxを用います。

> relion_helix_toolbox --cylinder --spherical_mask --cyl_outer_diameter <円筒の直径> --angpix <ピクセルサイズ Å/pix> \
      --boxdim <ボックスサイズ pix> --sphere_percentage <ボックスサイズに対する球面マスクの直径の比率> --width <コサイン型ソフトエッジの幅>
  • --cylinderで円筒マスクの作成を指定。
  • --spherical_maskで円筒マスクの両端をまるくする。