「cryoSPARCトラブルシューティング」の版間の差分
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2020年9月24日 (木) 05:11時点における版
依存ライブラリ関係
OSError: cublas library not found
signle workstationインストール(Docker)ではこのようなエラーは出なかったが、docker swarmでクラスタを構築してmasterとworkerに分けて使った場合に生じたエラー。cryoSPARCのインストール方法が異なるだけで、Dockerイメージとしては同じものを使っているので、理解に苦しむ挙動。
[CPU: 190.1 MB] Traceback (most recent call last): File "cryosparc2_worker/cryosparc2_compute/run.py", line 72, in cryosparc2_compute.run.main File "cryosparc2_compute/jobs/jobregister.py", line 337, in get_run_function runmod = importlib.import_module(".."+modname, __name__) File "/net/fs10/work02/csparc/cryosparc2_worker/deps/anaconda/lib/python2.7/importlib/__init__.py", line 37, in import_module __import__(name) File "cryosparc2_worker/cryosparc2_compute/jobs/abinit/run.py", line 15, in init cryosparc2_compute.jobs.abinit.run File "cryosparc2_compute/engine/__init__.py", line 8, in <module> from engine import * File "cryosparc2_worker/cryosparc2_compute/engine/engine.py", line 12, in init cryosparc2_compute.engine.engine File "cryosparc2_worker/cryosparc2_compute/engine/gfourier.py", line 6, in init cryosparc2_compute.engine.gfourier File "/net/fs10/work02/csparc/cryosparc2_worker/deps/anaconda/lib/python2.7/site-packages/skcuda/fft.py", line 20, in <module> from . import misc File "/net/fs10/work02/csparc/cryosparc2_worker/deps/anaconda/lib/python2.7/site-packages/skcuda/misc.py", line 25, in <module> from . import cublas File "/net/fs10/work02/csparc/cryosparc2_worker/deps/anaconda/lib/python2.7/site-packages/skcuda/cublas.py", line 56, in <module> raise OSError('cublas library not found') OSError: cublas library not found