「cryoSPARC」の版間の差分

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(インストールと使い方)
(インストールと使い方)
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== インストールと使い方 ==
 
== インストールと使い方 ==
 
[https://cryosparc.com/docs/reference/install 公式の説明]にまずは従い、失敗したら[https://discuss.cryosparc.com ディスカッションフォーラム]で類似ケースを頑張って探します。それでも無理ならフォーラムで質問します。
 
[https://cryosparc.com/docs/reference/install 公式の説明]にまずは従い、失敗したら[https://discuss.cryosparc.com ディスカッションフォーラム]で類似ケースを頑張って探します。それでも無理ならフォーラムで質問します。
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こちらも要チェックです→ https://web.chaperone.jp/w/index.php?cryoSPARC
  
 
単一の計算機にインストールする場合は、[https://cryosparc.com/docs/reference/install#quick-install Single workstationモードでのインストール]にならえばよいです。
 
単一の計算機にインストールする場合は、[https://cryosparc.com/docs/reference/install#quick-install Single workstationモードでのインストール]にならえばよいです。

2020年7月14日 (火) 22:51時点における版

勉強

youtubeでワークショップの録画が公開されています。10時間以上に及ぶたいへん長いビデオですが、cryoSPARCリファレンスには書いていないパラメータの詳細まで説明されているので、視聴が望ましいと思います。

https://guide.cryosparc.com/processing-data/tutorial-videos

インストールと使い方

公式の説明にまずは従い、失敗したらディスカッションフォーラムで類似ケースを頑張って探します。それでも無理ならフォーラムで質問します。

こちらも要チェックです→ https://web.chaperone.jp/w/index.php?cryoSPARC

単一の計算機にインストールする場合は、Single workstationモードでのインストールにならえばよいです。

cryoSPARCはRELIONのような独立したGUIアプリではなく、ウェブブラウザからHTTPでアクセスして使うアプリになっています。イメージ的にはJupyter Notebookが近いです。遠隔から使うにはsshポートフォワードの設定などが必要になる場合もあると思います。

Single workstationモードで利用できるDockerfileを試験的に作ってみました( https://github.com/yasunaga-lab/docker )。こちらの使用方法はリポジトリのREADMEに執筆予定です。