「cryoSPARC」の版間の差分

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(インストールと使い方)
(勉強)
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== 勉強 ==
 
== 勉強 ==
youtubeでワークショップの録画が公開されています。10時間以上に及ぶたいへん長いビデオですが、[https://cryosparc.com/docs/reference/jobs cryoSPARCリファレンス]には書いていないパラメータの詳細まで説明されているので、視聴が望ましいと思います。
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youtubeでワークショップの録画が公開されています。10時間以上に及ぶたいへん長いビデオですが、cryoSPARCを使うならば視聴が望ましいと思います。
  
 
https://guide.cryosparc.com/processing-data/tutorial-videos
 
https://guide.cryosparc.com/processing-data/tutorial-videos

2020年7月16日 (木) 15:11時点における版

勉強

youtubeでワークショップの録画が公開されています。10時間以上に及ぶたいへん長いビデオですが、cryoSPARCを使うならば視聴が望ましいと思います。

https://guide.cryosparc.com/processing-data/tutorial-videos

インストールと使い方

公式の説明にまずは従い、失敗したらディスカッションフォーラムで類似ケースを頑張って探します。それでも無理ならフォーラムで質問します。

こちらも要チェックです→ https://web.chaperone.jp/w/index.php?cryoSPARC

単一の計算機にインストールする場合は、Single workstationモードでのインストールにならえばよいです。

cryoSPARCはRELIONのような独立したGUIアプリではなく、ウェブブラウザからHTTPでアクセスして使うアプリになっています。遠隔から使うにはsshポートフォワードの設定などが必要になる場合もあると思います。

Single workstationモードで利用できるDockerfileを試験的に作ってみました( https://github.com/yasunaga-lab/docker )。こちらの使用方法はリポジトリのREADMEに執筆予定です。