mrcFETnormalizeBySD

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mrcFETnormalizeBySDとはEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイルリスト: ASCII NULL
-is 選択 入力ファイルリスト: [SDcalc用] NULL
-o 選択 出力ファイル: mrcImage NULL
-rSD 選択 FETSDfile読み出し: mrcImage NULL
-wSD 選択 FETSDfile書き込み: mrcImage NULL
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  
-is  :[inputsample] is FileList for SDcalculation.
           use when the inputFileList is large
-rSD : to use SDdata(without calculate) mrc format
-wSD : write out the SDdata as mrc format
       this file can be used next normalize with "-rSD"command.
-o   : save all normalized data into one mrcImage.
       do not use when the inputFileList is large


モードの詳細

モード 説明
0


-i のフォーマット

FETファイル1
FETファイル2
.
.


-wSD のフォーマット

以下のフォーマットでmrcImageを作成する
幅の平均        歪度の平均         尖度の平均
幅の標準偏差  歪度の標準偏差  尖度の標準偏差


実行例

入力ファイル

-i のデータ
Input-1VOM-2D-FET.radon
Input-1VOM-Rot-2D-FET.radon
Input-1VOM-Rot3-2D-FET.radon


      0.0533889        0.309261         2.42345 
      0.0535469        0.316717         2.42278 
      0.0537852        0.328374         2.42103 
       0.054231        0.323276         2.40269 
      0.0542998        0.329251         2.40747 

-中略-

      0.0524661       -0.297861         2.44797 
      0.0529934       -0.293378         2.42465 
      0.0531624       -0.301725         2.42459 
      0.0533889       -0.309261         2.42345 
      0.0535469       -0.316717         2.42278 

-中略-

       0.052111        0.276049         2.44385 
      0.0523056        0.288111         2.44664 
      0.0524661        0.297861         2.44797 
      0.0529934        0.293378         2.42465 
      0.0531625        0.301725         2.42459 


      0.0296636      -0.0427556         1.98361 
      0.0295906      -0.0384619         1.97451 
      0.0294273      -0.0328908         1.96459 
      0.0293268      -0.0282282         1.95575 
      0.0292469      -0.0232475         1.94798 

-中略-

      0.0301512       0.0511498         2.02086 
      0.0300728       0.0476488         2.01232 
      0.0300809       0.0480092         1.99483 
      0.0299709       0.0427557         1.98361 
      0.0298862        0.038462         1.97451 

-中略-

      0.0304165      -0.0592456         2.04089 
      0.0301904      -0.0554404         2.03163 
      0.0299399      -0.0511498         2.02086 
      0.0298144      -0.0476488         2.01232 
      0.0297851      -0.0480091         1.99483 


      0.0553769        0.289028         2.36296 
      0.0546224        0.299151         2.37506 
      0.0541597        0.296936         2.36456 
      0.0537064        0.294374         2.35207 
      0.0532336        0.291347         2.34144 

-中略-

      0.0562323       -0.273584         2.39666 
      0.0559653       -0.274274          2.3896 
      0.0554794       -0.276069         2.38097 
      0.0553769       -0.289028         2.36296 
      0.0546224       -0.299152         2.37506 

-中略-

      0.0567532        0.269964         2.41348 
      0.0565171        0.272261         2.40528 
      0.0562323        0.273584         2.39666 
      0.0559653        0.274274          2.3896 
      0.0554794        0.276069         2.38097 


オプション必須項目のみの場合

出力結果
0.046142  0.011605
0.176595  0.159164
2.266799  0.193134


オプション -o, -wSD

-o のファイルをmrcImageMakeDumpで見た場合
        0.80458        0.624979        0.591161 
       -1.40951        -1.41115        -1.40819 
       0.604928        0.786169        0.817027 


-wSD のファイルをmrcImageMakeDumpで見た場合
      0.0116049        0.159164        0.193134 
      0.0461423        0.176595          2.2668