mrcImageFloating

提供: Eospedia
2015年3月11日 (水) 06:09時点におけるKinoshita (トーク | 投稿記録)による版

(差分) ←前の版 | 最新版 (差分) | 次の版→ (差分)
移動: 案内検索

mrcImageFloatingとはmrcImageをフローティングするEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 必須 出力ファイル: mrcImage NULL
-v 選択 入力: Value: 実数(平均値として設定する値) 0.0
-rmax 選択 入力: rmax: 実数 rmax=MIN(Nx,Ny[,Nz])
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  


モードの詳細

モード 説明
0 All Mean
1 Sphere Surface Mean (rmax)
2 Cylinder Surface Mean (rmax)
3 Edge Pixels


実行例

入力ファイルの画像

Input-B120-N.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-50.1272 (73, 46, 0)

270.385 (49, 32, 0)
20.9833
49.3141

0.616426


オプション必須項目のみの場合

Outdata-mrcImageFloating.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-71.1105 (73, 46, 0)

249.402 (49, 32, 0)
-3.2678e-07
49.3141

0.616426

デフォルトでは平均値を0としてフローティングする。

オプション -v

v=10で実行

Outdata-v-mrcImageFloating.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-61.1105 (73, 46, 0)

259.402 (49, 32, 0)
10
49.3141

0.616426


オプション -m

m=1で実行

その他のオプション変更無しで実行
rmax from caliculate:97.500000
HeaderNx should be odd
HeaderNy should be odd
meanOfSphereSurface 0.00544438 at rmax 97.5[A]


Outdata-m1-mrcImageFloating.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-50.1326 (73, 46, 0)

270.38 (49, 32, 0)
20.9779
49.3141

0.616426


rmax=20で実行
rmax from option:20.000000
HeaderNx should be odd
HeaderNy should be odd
meanOfSphereSurface 6.12671 at rmax 20[A]


Outdata-m1rmax-mrcImageFloating.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-56.2539 (73, 46, 0)

264.259 (49, 32, 0)
14.8566
49.3141

0.616426


m=2で実行

その他のオプション変更無しで実行
rmax from caliculate:97.500000
HeaderNx should be odd
HeaderNy should be odd
meanOfCylinderSurface 0.664563 at rmax 97.5[A]


Outdata-m2-mrcImageFloating.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-50.7917 (73, 46, 0)

269.721 (49, 32, 0)
20.3188
49.3141

0.616426


rmax=20で実行
rmax from option:20.000000
HeaderNx should be odd
HeaderNy should be odd
meanOfCylinderSurface 154.616 at rmax 20[A]


Outdata-m2rmax-mrcImageFloating.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-204.743 (73, 46, 0)

115.769 (49, 32, 0)
-133.633
49.3141

0.616426


m=3で実行

Outdata-m3-mrcImageFloating.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-49.4715 (73, 46, 0)

271.041 (49, 32, 0)
21.639
49.3141

0.616426