mrcImageNormalizedSubtraction

mrcImageNormalizedSubtractionとは画像の密度を合わせた後、画像間の差を求めるEosのコマンドである。また画像間のRMSDを求めることができる。(-rmsd指定でファイル出力、指定無しで標準出力される)

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i1	必須	入力ファイル1: mrcImage	NULL
-i2	必須	入力ファイル2: mrcImage	NULL
-o	必須	出力ファイル: mrcImage	NULL
-nori2	選択	出力ファイル2: mrcImage	NULL
-rmsd	選択	出力: ASCII(RMSD)	stdout(指定しなければ標準出力)
-pf	選択	出力: ASCII(パラメータ)	stdout(指定しなければ標準出力)
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

モードの詳細

モード	説明
+1	Sigma!=1.0
+2	パラメータを標準出力
+4	反転
+8	Robust Test

実行例

入力ファイル1の画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 255 21.0538 47.6709 0.595886

入力ファイル2の画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 255 111.211 32.7239 0.409049

オプション必須項目のみの場合

出力結果

-rmsd, -pfは設定無しの場合は標準出力される。

a= -76.811897, b= 0.879999, r= 0.000000, 
sigma_a= 1.679392, sigma_b= 0.014486, 
RMSD: 179.359329

-o の画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 255 147.638 101.846 1.27308

-nori2 の画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 255 77.1355 90.1288 1.12661

-rmsd のデータ

設定したファイルへ出力される。

RMSD: 179.359329

-pf のデータ

設定したファイルへ出力される。

a= -76.811897, b= 0.879999, r= 0.000000, 
sigma_a= 1.679392, sigma_b= 0.014486, 

オプション　-m

m=4で実行

-o の画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 255 102.362 100.504 1.2563