mrcImageNormalizing
mrcImageNormalizingとは画像の値の正規化を行うEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
-A | 選択 | A | 1.0 |
-B | 選択 | B | 0.0 |
-ContourMin | 選択 | 輪郭の最小値 | 0.0 |
-ContourMax | 選択 | 輪郭の最大値 | 1.0 |
-ContourSolvent | 選択 | 溶媒の輪郭 | 0.0 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | Double Exponential: Solvent and Object Fitting histgram to double exponentials as Solvent and Object |
1 | Min-Max: Background and Object data = A*(data-Min)/(Max-Min) + B |
2 | Contour data = A*(data-ContourMin)/(ContourMax-ContourMin) + B |
3 | Contour and Solvent if data < ContourSolvent, data = ContourSolvent. After this, calculate the below. |
4 | 直接演算する data = A*data + B |
5 | ガウシアンとして密度を仮定する data = A*Normalized(data) + B |
実行例
入力ファイルの画像
最小 最大 |
-18651.7 (10, 1, 0) 52942.7 (24, 39, 0) |
オプション必須項目のみの場合
最小 最大 |
-0.00221962 (10, 1, 0) 0.00448009 (24, 39, 0) |
オプション -A, -B
A=1000, B=3で実行
最小 最大 |
0.780381 (10, 1, 0) 7.48009 (24, 39, 0) |
オプション -m
m=5で実行
A=1, B=0 のとき
最小 最大 |
-2.5693 (10, 1, 0) 4.5421 (24, 39, 0) |
平均値が0、標準偏差が1になるように正規化されている。
A=2, B=3 のとき
最小 最大 |
-5.70789 (10, 1, 0) 15.6263 (24, 39, 0) |
平均値が2、標準偏差が3になるように正規化されている。