「mrcImageTTest」の版間の差分
(同じ利用者による、間の1版が非表示) | |||
行14: | 行14: | ||
<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td>入力ファイルリスト</td> | + | <td>入力ファイルリスト: [[ASCII]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行20: | 行20: | ||
<td>-I</td> | <td>-I</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td>入力: | + | <td>入力: ([[mrcImage]](平均), [[mrcImage]](分散), 画像数)</td> |
<td>(NULL, NULL, 0)</td> | <td>(NULL, NULL, 0)</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行26: | 行26: | ||
<td>-Nor</td> | <td>-Nor</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td>入力: A + B*x: | + | <td>入力: 正規化処理: A + B*x: (A, B)</td> |
<td>(0.0, 1.0)</td> | <td>(0.0, 1.0)</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行32: | 行32: | ||
<td>-r</td> | <td>-r</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td>参照ファイルリスト</td> | + | <td>参照ファイルリスト: [[ASCII]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行38: | 行38: | ||
<td>-R</td> | <td>-R</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td>参照: | + | <td>参照: ([[mrcImage]](平均), [[mrcImage]](分散), 画像数)</td> |
<td>(NULL, NULL, 0)</td> | <td>(NULL, NULL, 0)</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行44: | 行44: | ||
<td>-NorR</td> | <td>-NorR</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td>参照: A + B*x: | + | <td>参照: 正規化処理: A + B*x: (A, B)</td> |
<td>(0.0, 1.0)</td> | <td>(0.0, 1.0)</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行78: | 行78: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
− | <div>入力ファイルとして-i, -I、参照ファイルとして-r, -Rのどちらかが必要</div> | + | <div>入力ファイルとして-i, -I、参照ファイルとして-r, -Rのどちらかが必要<br> |
+ | -I, -R で使用する平均、分散ファイルは[[mrcImageSN]]にて作成することができる。</div> | ||
<br> | <br> | ||
行172: | 行173: | ||
===-I のデータ=== | ===-I のデータ=== | ||
+ | <div>I=(Input-1VOM-N-2D-A.mrc, Input-1VOM-N-2D-Var.mrc, 3)を入力とする</div> | ||
+ | |||
+ | <div>[[Media:Input-1VOM-N-2D-A.mrc|Input-1VOM-N-2D-A.mrc]]の画像(-i のファイルの平均)</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-1VOM-N-2D-A.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-7385.85 (61, 29, 0)<br> | ||
+ | 41209.8 (29, 26, 0)<br> | ||
+ | 6791.67<br> | ||
+ | 8335.26<br> | ||
+ | 104.191<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | <div>[[Media:Input-1VOM-N-2D-Var.mrc|Input-1VOM-N-2D-Var.mrc]]の画像(-i のファイルの分散)</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-1VOM-N-2D-Var.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">62.2022 (11, 5, 0)<br> | ||
+ | 5.06054e+08 (45, 28, 0)<br> | ||
+ | 3.00629e+07<br> | ||
+ | 4.18721e+07<br> | ||
+ | 523402<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
===-r のデータ=== | ===-r のデータ=== | ||
<pre> | <pre> | ||
行239: | 行281: | ||
===-R のデータ=== | ===-R のデータ=== | ||
+ | <div>I=(Input-1VOM-2D-A.mrc, Input-1VOM-2D-Var.mrc, 3)を入力とする</div> | ||
+ | |||
+ | <div>[[Media:Input-1VOM-2D-A.mrc|Input-1VOM-2D-A.mrc]]の画像(-r のファイルの平均)</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-1VOM-2D-A.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-145.807 (2, 45, 0)<br> | ||
+ | 31890.8 (45, 47, 0)<br> | ||
+ | 6764.13<br> | ||
+ | 6642.45<br> | ||
+ | 83.0307<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | <div>[[Media:Input-1VOM-2D-Var.mrc|Input-1VOM-2D-Var.mrc]]の画像(-r のファイルの分散)</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-1VOM-2D-Var.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> | ||
+ | 7.26565e+08 (27, 28, 0)<br> | ||
+ | 3.85865e+07<br> | ||
+ | 5.61164e+07<br> | ||
+ | 701454<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
===オプション必須項目のみの場合=== | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
====-i, -rで実行==== | ====-i, -rで実行==== | ||
行282: | 行365: | ||
====-I, -Rで実行==== | ====-I, -Rで実行==== | ||
+ | <div>-i, -rと同じ画像が得られる</div> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
<div>-o の画像</div> | <div>-o の画像</div> | ||
<table> | <table> | ||
行292: | 行378: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left"><br> | + | <td><p align="left">-99.9368 (45, 3, 0)<br> |
− | <br> | + | 99.9301 (76, 50, 0)<br> |
− | <br> | + | -1.29958<br> |
− | <br> | + | 58.3662<br> |
− | <br></p> | + | 0.729578<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行312: | 行398: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left"><br> | + | <td><p align="left">-13.383 (30, 3, 0)<br> |
− | <br> | + | 30.6481 (76, 50, 0)<br> |
− | <br> | + | -0.00954761<br> |
− | <br> | + | 1.39399<br> |
− | <br></p> | + | 0.0174249<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行322: | 行408: | ||
<br> | <br> | ||
− | ===オプション -=== | + | <div>以降は-I, -Rにて実行</div> |
− | ====で実行==== | + | |
+ | ===オプション -Nor=== | ||
+ | ====Nor=(0, 0.4)で実行==== | ||
<div>-o の画像</div> | <div>-o の画像</div> | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata--mrcImageTTest.png]]</td> | + | <td>[[画像:Outdata-Nor-mrcImageTTest.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行334: | 行422: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left"><br> | + | <td><p align="left">-99.9762 (46, 37, 0)<br> |
− | <br> | + | 99.9871 (76, 50, 0)<br> |
− | <br> | + | -42.9433<br> |
− | <br> | + | 49.5383<br> |
− | <br></p> | + | 0.619228<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行347: | 行435: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata1--mrcImageTTest.png]]</td> | + | <td>[[画像:Outdata1-Nor-mrcImageTTest.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行354: | 行442: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left"><br> | + | <td><p align="left">-13.9446 (39, 40, 0)<br> |
− | <br> | + | 27.7973 (76, 50, 0)<br> |
− | <br> | + | -1.06447<br> |
− | <br> | + | 1.61062<br> |
− | <br></p> | + | 0.0201327<br></p> |
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ===オプション -NorR=== | ||
+ | ====NorR=(0, 0.4)で実行==== | ||
+ | <div>-o の画像</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata-NorR-mrcImageTTest.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-99.819 (45, 3, 0)<br> | ||
+ | 99.9888 (30, 32, 0)<br> | ||
+ | 32.2003<br> | ||
+ | 59.6772<br> | ||
+ | 0.745965<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | <div>-t の画像</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata1-NorR-mrcImageTTest.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-13.383 (30, 3, 0)<br> | ||
+ | 31.1071 (76, 50, 0)<br> | ||
+ | 1.00935<br> | ||
+ | 1.92418<br> | ||
+ | 0.0240522<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
<br> | <br> |
2014年3月7日 (金) 01:45時点における最新版
mrcImageTTestとは画像間のt-testを行うEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 選択 | 入力ファイルリスト: ASCII | NULL |
-I | 選択 | 入力: (mrcImage(平均), mrcImage(分散), 画像数) | (NULL, NULL, 0) |
-Nor | 選択 | 入力: 正規化処理: A + B*x: (A, B) | (0.0, 1.0) |
-r | 選択 | 参照ファイルリスト: ASCII | NULL |
-R | 選択 | 参照: (mrcImage(平均), mrcImage(分散), 画像数) | (NULL, NULL, 0) |
-NorR | 選択 | 参照: 正規化処理: A + B*x: (A, B) | (0.0, 1.0) |
-o | 選択 | 出力: Probability | NULL |
-t | 選択 | 出力: t-value | NULL |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
-I, -R で使用する平均、分散ファイルはmrcImageSNにて作成することができる。
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 |
-i, -r のフォーマット
ファイル1 ファイル2 . .
実行例
-i のデータ
Input-1VOM-N-2D.mrc Input-1VOM-N-Rot-2D.mrc Input-1VOM-N-Rot1-2D.mrc
最小 最大 |
-18651.7 (10, 1, 0) 52942.7 (24, 39, 0) |
最小 最大 |
-11367.8 (51, 62, 0) 51939.8 (29, 26, 0) |
最小 最大 |
-14918 (53, 17, 0) 58621.8 (30, 26, 0) |
-I のデータ
最小 最大 |
-7385.85 (61, 29, 0) 41209.8 (29, 26, 0) |
最小 最大 |
62.2022 (11, 5, 0) 5.06054e+08 (45, 28, 0) |
-r のデータ
Input-1VOM-2D.mrc Input-1VOM-Rot-2D.mrc Input-1VOM-Rot1-2D.mrc
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 49749.7 (27, 28, 0) |
最小 最大 |
-609.552 (68, 18, 0) 43476 (45, 47, 0) |
最小 最大 |
-2.31309e-06 (29, 7, 0) 49749.2 (52, 51, 0) |
-R のデータ
最小 最大 |
-145.807 (2, 45, 0) 31890.8 (45, 47, 0) |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 7.26565e+08 (27, 28, 0) |
オプション必須項目のみの場合
-i, -rで実行
最小 最大 |
-99.9368 (45, 3, 0) 99.9301 (76, 50, 0) |
最小 最大 |
-13.383 (30, 3, 0) 30.6481 (76, 50, 0) |
-I, -Rで実行
最小 最大 |
-99.9368 (45, 3, 0) 99.9301 (76, 50, 0) |
最小 最大 |
-13.383 (30, 3, 0) 30.6481 (76, 50, 0) |
オプション -Nor
Nor=(0, 0.4)で実行
最小 最大 |
-99.9762 (46, 37, 0) 99.9871 (76, 50, 0) |
最小 最大 |
-13.9446 (39, 40, 0) 27.7973 (76, 50, 0) |
オプション -NorR
NorR=(0, 0.4)で実行
最小 最大 |
-99.819 (45, 3, 0) 99.9888 (30, 32, 0) |
最小 最大 |
-13.383 (30, 3, 0) 31.1071 (76, 50, 0) |