mrcImageZPad

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mrcImageZPadとはmrcImage(3D)に対してz軸に関するパディングを行うEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 必須 出力ファイル: mrcImage NULL
-r 選択 境界の幅z(zサイズ * 0.5以下で設定) 0
-w 選択 スロープの幅(m=1で使用)(通常は3以上推奨) 1
-v 選択 パディング値 0
-Nx 選択 出力ファイルのサイズ x 入力ファイルのサイズ x
-Ny 選択 出力ファイルのサイズ y 入力ファイルのサイズ y
-Nz 選択 出力ファイルのサイズ z 入力ファイルのサイズ z
-Floating 選択 フローティング
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 パディング値の算出方法を設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

-m の詳細

モード 説明
0 平均値でパディングする
1 余弦関数を掛ける
パディング値は-v が優先される


実行例

入力ファイルの画像

Input-ThickFilaments0-N.png
xy平面

Input1-ThickFilaments0-N.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.307724 (52, 10, 79)

1.52145 (47, 41, 47)
0.00295664
0.0916201

0.000132783


オプション -m

m=1, r=20で実行

出力結果
Tailer: 0
Program Start
av :0.00324832
出力画像

Outdata-m1r-mrcImageZPad.png
xy平面

Outdata1-m1r-mrcImageZPad.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.302611 (10, 14, 59)

1.52145 (47, 41, 47)
0.00427721
0.0683816

9.91038e-05


以降はm=1, r=20で実行する


オプション -w

w=10で実行

出力結果
Tailer: 0
Program Start
av :0.00028809
出力画像

Outdata-m1w-mrcImageZPad.png
xy平面

Outdata1-m1w-mrcImageZPad.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.302611 (10, 14, 59)

1.52145 (47, 41, 47)
0.00272471
0.0715415

0.000103683


オプション -v

v=0.1, w=10で実行

出力結果
Tailer: 0
Program Start
av :0.1
出力画像

Outdata-m1v-mrcImageZPad.png
xy平面

Outdata1-m1v-mrcImageZPad.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.302611 (10, 14, 59)

1.52145 (47, 41, 47)
0.0498431
0.0831128

0.000120453

オプション -Floating

出力結果
Tailer: 0
Program Start
av :0.00324832
出力画像

Outdata-m1Floating-mrcImageZPad.png
xy平面

Outdata1-m1Floating-mrcImageZPad.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.30586 (10, 14, 59)

1.5182 (47, 41, 47)
0.0010289
0.0683816

9.91038e-05


オプション -Nx, -Ny, -Nz

Nx=40, Ny=40, Nz=50で実行

出力結果
Tailer: 0
Program Start
av :0.00324832
出力画像

Outdata-m1NxNyNz-mrcImageZPad.png
xy平面

Outdata1-m1NxNyNz-mrcImageZPad.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.289995 (10, 3, 38)

1.52145 (33, 27, 22)
0.015069
0.138822

0.000490811