mrcRefHeaderCreate

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mrcRefHeaderCreateとは参照投影像にRefヘッダ情報を付加するEosコマンドである。このRefヘッダとはmrcImage形式ファイルのヘッダとは全く別のもので、mrcImage(Ref)のz=0に格納されている情報を指している。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 必須 出力ファイル: mrcImage NULL
-p 選択 中心座標:(Phi[degree], Omega[degree], Alpha[degree]) (0, 0, 0)
-w 選択 幅:(Phi[±degree], Omega[±degree], Alpha[±degree]) (360, 10, 10)
-d 選択 間隔:(Phi[z軸周り], Omega[y軸], Alpha[x軸]) (5, 5, 5)
-sy 選択 Start y (m=1のみ使用) 0
-ey 選択 End y (m=1のみ使用, デフォルト: Ny-1) 0
-refsize 選択 参照データのサイズ 0
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  
-p: Omega, Alphaは 0 または 180付近でなければならない。

モードの詳細

モード 説明
0
1


実行例

入力ファイルの画像

Input-121P1-R.png
z=156 〜 170

サイズ

モード
最小
最大
平均値
標準偏差

標準誤差

( 56, 27, 326)

mrcFloatImage
-1503.16 (14, 25, 131)
36873.4 (28, 20, 158)
6082.23
6479.76

9.22942


オプション必須項目のみの場合

z=0をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 360 
7 0 10 
8 0 10 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-
z=156 〜 170の画像
Outdata-mrcRefHeaderCreate.png

サイズ

モード
最小
最大
平均値
標準偏差

標準誤差

( 56, 27, 327)

mrcFloatImage
-1503.16 (14, 25, 132)
36873.4 (28, 20, 159)
6063.63
6478.56

9.21358

z=0にRefヘッダが加わるので、画像は1つずつずれる

オプション -p

p=(11, 12, 13)で実行

z=0をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 11 
1 0 12 
2 0 13 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 360 
7 0 10 
8 0 10 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-


オプション -w

w=(20, 30, 40)で実行

z=0をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 20 
7 0 30 
8 0 40 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-


オプション -d

d=(2, 6, 8)で実行

z=0をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 2 
4 0 6 
5 0 8 
6 0 360 
7 0 10 
8 0 10 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-


オプション -m

m=1で実行

その他のオプションなし
z=0をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 360 
7 0 10 
8 0 10 
9 0 0 
10 0 26 
11 0 0 
12 0 2.44886e+08 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-


sy=7 ,ey=33, refsize=44で実行
z=0をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 360 
7 0 10 
8 0 10 
9 0 7 
10 0 33 
11 0 44 
12 0 3.72162e+06 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-