「pdbWaterAdd」の版間の差分
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| 行103: | 行103: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>[[画像:Input-pdbWaterAdd.png]]</td> | <td>[[画像:Input-pdbWaterAdd.png]]</td> | ||
| − | <td><p align="left">重心 | + | <td><p align="left">重心<br> |
| − | 最大半径 | + | 最大半径<br> |
| − | 最大半径(座標) | + | 最大半径(座標)<br> </p> |
</td> | </td> | ||
<td><p align="left">2.500000e+01 3.750000e+01 5.000000e+01<br> | <td><p align="left">2.500000e+01 3.750000e+01 5.000000e+01<br> | ||
| 行118: | 行118: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>[[画像:Outdata-pdbWaterAdd.png]]</td> | <td>[[画像:Outdata-pdbWaterAdd.png]]</td> | ||
| − | <td><p align="left">重心 | + | <td><p align="left">重心<br> |
| − | 最大半径 | + | 最大半径<br> |
| − | 最大半径(座標) | + | 最大半径(座標)<br> </p> |
</td> | </td> | ||
<td><p align="left">2.801699e+01 4.042596e+01 5.283918e+01<br> | <td><p align="left">2.801699e+01 4.042596e+01 5.283918e+01<br> | ||
| 行134: | 行134: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>[[画像:Outdata-d-pdbWaterAdd.png]]</td> | <td>[[画像:Outdata-d-pdbWaterAdd.png]]</td> | ||
| − | <td><p align="left">重心 | + | <td><p align="left">重心<br> |
| − | 最大半径 | + | 最大半径<br> |
| − | 最大半径(座標) | + | 最大半径(座標)<br> </p> |
</td> | </td> | ||
<td><p align="left">2.816617e+01 4.092423e+01 5.106283e+01<br> | <td><p align="left">2.816617e+01 4.092423e+01 5.106283e+01<br> | ||
| 行150: | 行150: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>[[画像:Outdata-r-pdbWaterAdd.png]]</td> | <td>[[画像:Outdata-r-pdbWaterAdd.png]]</td> | ||
| − | <td><p align="left">重心 | + | <td><p align="left">重心<br> |
| − | 最大半径 | + | 最大半径<br> |
| − | 最大半径(座標) | + | 最大半径(座標)<br> </p> |
</td> | </td> | ||
<td><p align="left">2.873605e+01 4.110250e+01 4.960092e+01<br> | <td><p align="left">2.873605e+01 4.110250e+01 4.960092e+01<br> | ||
5.159114e+01<br> | 5.159114e+01<br> | ||
| − | + | 51.20 51.08 50.52 <br> </p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行167: | 行167: | ||
<td>[[画像:Outdata-m1-pdbWaterAdd.png]]</td> | <td>[[画像:Outdata-m1-pdbWaterAdd.png]]</td> | ||
<td>[[画像:Outdata-m1(yz)-pdbWaterAdd.png]]</td> | <td>[[画像:Outdata-m1(yz)-pdbWaterAdd.png]]</td> | ||
| − | <td><p align="left">重心 | + | <td><p align="left">重心<br> |
| − | 最大半径 | + | 最大半径<br> |
| − | 最大半径(座標) | + | 最大半径(座標)<br> </p> |
</td> | </td> | ||
<td><p align="left">2.804255e+01 4.044974e+01 4.965178e+01<br> | <td><p align="left">2.804255e+01 4.044974e+01 4.965178e+01<br> | ||
| 行183: | 行183: | ||
<td>[[画像:Outdata-m1height-pdbWaterAdd.png]]</td> | <td>[[画像:Outdata-m1height-pdbWaterAdd.png]]</td> | ||
<td>[[画像:Outdata-m1height(yz)-pdbWaterAdd.png]]</td> | <td>[[画像:Outdata-m1height(yz)-pdbWaterAdd.png]]</td> | ||
| − | <td><p align="left">重心 | + | <td><p align="left">重心<br> |
| − | 最大半径 | + | 最大半径<br> |
| − | 最大半径(座標) | + | 最大半径(座標)<br> </p> |
</td> | </td> | ||
<td><p align="left">2.810252e+01 4.051072e+01 4.965763e+01<br> | <td><p align="left">2.810252e+01 4.051072e+01 4.965763e+01<br> | ||
| 行198: | 行198: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>[[画像:Outdata-m2-pdbWaterAdd.png]]</td> | <td>[[画像:Outdata-m2-pdbWaterAdd.png]]</td> | ||
| − | <td><p align="left">重心 | + | <td><p align="left">重心<br> |
| − | 最大半径 | + | 最大半径<br> |
| − | 最大半径(座標) | + | 最大半径(座標)<br> </p> |
</td> | </td> | ||
<td><p align="left">2.351263e+01 3.752831e+01 4.991955e+01<br> | <td><p align="left">2.351263e+01 3.752831e+01 4.991955e+01<br> | ||
| 行213: | 行213: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>[[画像:Outdata-m2edge-pdbWaterAdd.png]]</td> | <td>[[画像:Outdata-m2edge-pdbWaterAdd.png]]</td> | ||
| − | <td><p align="left">重心 | + | <td><p align="left">重心<br> |
| − | 最大半径 | + | 最大半径<br> |
| − | 最大半径(座標) | + | 最大半径(座標)<br> </p> |
</td> | </td> | ||
<td><p align="left">2.275528e+01 3.777079e+01 5.054808e+01<br> | <td><p align="left">2.275528e+01 3.777079e+01 5.054808e+01<br> | ||
| 行228: | 行228: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>[[画像:Outdata-m3-pdbWaterAdd.png]]</td> | <td>[[画像:Outdata-m3-pdbWaterAdd.png]]</td> | ||
| − | <td><p align="left">重心 | + | <td><p align="left">重心<br> |
| − | 最大半径 | + | 最大半径<br> |
| − | 最大半径(座標) | + | 最大半径(座標)<br> </p> |
</td> | </td> | ||
<td><p align="left">2.657380e+01 3.896318e+01 4.788873e+01<br> | <td><p align="left">2.657380e+01 3.896318e+01 4.788873e+01<br> | ||
| 行243: | 行243: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>[[画像:Outdata-m3cube-pdbWaterAdd.png]]</td> | <td>[[画像:Outdata-m3cube-pdbWaterAdd.png]]</td> | ||
| − | <td><p align="left">重心 | + | <td><p align="left">重心<br> |
| − | 最大半径 | + | 最大半径<br> |
| − | 最大半径(座標) | + | 最大半径(座標)<br> </p> |
</td> | </td> | ||
<td><p align="left">2.680180e+01 3.562480e+01 4.810106e+01<br> | <td><p align="left">2.680180e+01 3.562480e+01 4.810106e+01<br> | ||
2013年11月11日 (月) 01:47時点における版
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: [pdb] | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: [pdb] | NULL |
| -d | 選択 | 水の密度: [M] | 55.55555 |
| -r | 選択 | 水の半径(m=0, 1で使用) | 100 |
| -height | 選択 | 水の高さ(m=1で使用) | 100 |
| -cube | 選択 | (X, Y, Z): [A](m=3で使用) | (100, 100, 100) |
| -edge | 選択 | layer number(m=2で使用) | 3 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | 球 |
| 1 | 円筒 |
| 2 | エッジ |
| 3 | 立方体 |
実行例
入力ファイルの画像
 |
重心 最大半径 |
2.500000e+01 3.750000e+01 5.000000e+01 4.349928e+01 |
オプション必須項目のみの場合
 |
重心 最大半径 |
2.801699e+01 4.042596e+01 5.283918e+01 1.013542e+02 |
オプション -d
d=100で実行
 |
重心 最大半径 |
2.816617e+01 4.092423e+01 5.106283e+01 1.007834e+02 |
オプション -r
r=50で実行
 |
重心 最大半径 |
2.873605e+01 4.110250e+01 4.960092e+01 5.159114e+01 |
オプション -m
m=1で実行
 |
-pdbWaterAdd.png) |
重心 最大半径 |
2.804255e+01 4.044974e+01 4.965178e+01 1.124507e+02 |
m=1, height=50で実行
 |
-pdbWaterAdd.png) |
重心 最大半径 |
2.810252e+01 4.051072e+01 4.965763e+01 1.035522e+02 |
m=2で実行
 |
重心 最大半径 |
2.351263e+01 3.752831e+01 4.991955e+01 5.244210e+01 |
m=2, edge=11で実行
 |
重心 最大半径 |
2.275528e+01 3.777079e+01 5.054808e+01 8.021160e+01 |
m=3で実行
 |
重心 最大半径 |
2.657380e+01 3.896318e+01 4.788873e+01 8.453592e+01 |
m=3, cube=(150, 50, 25)で実行
 |
重心 最大半径 |
2.680180e+01 3.562480e+01 4.810106e+01 7.877402e+01 |
