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		<title>cufft - Revision history</title>
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		<title>Kinoshita: Created page with &quot;'''cufft''' is Eos's Command that performs Fourier Transform by CUDA.   == List of option == === Main option === 		&lt;table border=&quot;1&quot;&gt; 			&lt;tr&gt;  				&lt;th&gt;Option&lt;/th&gt;...&quot;</title>
		<link rel="alternate" type="text/html" href="http://www.yasunaga-lab.bio.kyutech.ac.jp/Eos/index.php?title=cufft&amp;diff=3484&amp;oldid=prev"/>
				<updated>2014-08-20T01:24:46Z</updated>
		
		<summary type="html">&lt;p&gt;Created page with &amp;quot;&amp;#039;&amp;#039;&amp;#039;cufft&amp;#039;&amp;#039;&amp;#039; is &lt;a href=&quot;/Eos/index.php/Eos&quot; title=&quot;Eos&quot;&gt;Eos&lt;/a&gt;&amp;#039;s &lt;a href=&quot;/Eos/index.php/Command&quot; title=&quot;Command&quot;&gt;Command&lt;/a&gt; that performs Fourier Transform by CUDA.   == List of option == === Main option === 		&amp;lt;table border=&amp;quot;1&amp;quot;&amp;gt; 			&amp;lt;tr&amp;gt;  				&amp;lt;th&amp;gt;Option&amp;lt;/th&amp;gt;...&amp;quot;&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;b&gt;New page&lt;/b&gt;&lt;/p&gt;&lt;div&gt;'''cufft''' is [[Eos]]'s [[Command]] that performs Fourier Transform by CUDA.&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
== List of option ==&lt;br /&gt;
=== Main option ===&lt;br /&gt;
		&amp;lt;table border=&amp;quot;1&amp;quot;&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Option&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Essential/Optional&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Description&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Default&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-i&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Essential&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Input:[[mrcImage]]&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;NULL&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-o&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Essential&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Output:[[mrcImage]](FFT)&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;NULL&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-c&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Optional&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;ConfigurationFile&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;NULL&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-m&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Optional&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Mode&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;0&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-h&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Optional&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Help&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;　&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
		&amp;lt;/table&amp;gt; &lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&amp;lt;div&amp;gt; x, y, z must be even.&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
example of exception: (x, y ,z)=(100, 1, 1)&amp;lt;/div&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
=== -m details ===&lt;br /&gt;
		&amp;lt;table border=&amp;quot;1&amp;quot;&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Value&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Description&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;0&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
		&amp;lt;/table&amp;gt; &lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
== Execution example ==&lt;br /&gt;
===[[Media:Input-3D-Data.mrc | Input file]] image===&lt;br /&gt;
	&amp;lt;table&amp;gt; &lt;br /&gt;
		&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;Center&amp;quot;&amp;gt;[[File:Input-3D-Data.png]]&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				xy-plane&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;/p&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;Center&amp;quot;&amp;gt;[[File:Input1-3D-Data.png]]&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				yz-plane&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;/p&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;Size&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				Mode&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				Min&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				Max&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				Mean&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				SD&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				SE&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;/p&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;(        70,         70,        100)&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				mrcFloatImage &amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				0 (0, 0, 0)&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				2 (35, 35, 5)&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				0.384947&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				0.605556&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				0.00086508&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;/p&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
		&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
	&amp;lt;/table&amp;gt; &lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
=== Output ===&lt;br /&gt;
	&amp;lt;table&amp;gt;&lt;br /&gt;
		&amp;lt;tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;[[File:Outdata-cufft.png]]&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;Size&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				Mode&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				Min&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				Max&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				Mean&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				SD&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				SE&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;/p&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;(        70,         70,        100)&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				mrcComplexFloatFT  &amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				5.8388e-05 (34, 19, 25)&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				269.463 (0, 0, 0)&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				0.184947&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				0.853561&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
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