<?xml version="1.0"?>
<?xml-stylesheet type="text/css" href="http://www.yasunaga-lab.bio.kyutech.ac.jp/Eos/skins/common/feed.css?303"?>
<feed xmlns="http://www.w3.org/2005/Atom" xml:lang="en">
		<id>http://www.yasunaga-lab.bio.kyutech.ac.jp/Eos/index.php?action=history&amp;feed=atom&amp;title=llDataCTFCompensate</id>
		<title>llDataCTFCompensate - Revision history</title>
		<link rel="self" type="application/atom+xml" href="http://www.yasunaga-lab.bio.kyutech.ac.jp/Eos/index.php?action=history&amp;feed=atom&amp;title=llDataCTFCompensate"/>
		<link rel="alternate" type="text/html" href="http://www.yasunaga-lab.bio.kyutech.ac.jp/Eos/index.php?title=llDataCTFCompensate&amp;action=history"/>
		<updated>2026-05-14T14:24:41Z</updated>
		<subtitle>Revision history for this page on the wiki</subtitle>
		<generator>MediaWiki 1.23.6</generator>

	<entry>
		<id>http://www.yasunaga-lab.bio.kyutech.ac.jp/Eos/index.php?title=llDataCTFCompensate&amp;diff=3589&amp;oldid=prev</id>
		<title>Kinoshita: Created page with &quot;'''llDataCTFCompensate''' is Eos's Command.   == List of option == === Main option === 		&lt;table border=&quot;1&quot;&gt; 			&lt;tr&gt;  				&lt;th&gt;Option&lt;/th&gt;  				&lt;th&gt;Essential/Optional&lt;/t...&quot;</title>
		<link rel="alternate" type="text/html" href="http://www.yasunaga-lab.bio.kyutech.ac.jp/Eos/index.php?title=llDataCTFCompensate&amp;diff=3589&amp;oldid=prev"/>
				<updated>2014-08-21T00:18:23Z</updated>
		
		<summary type="html">&lt;p&gt;Created page with &amp;quot;&amp;#039;&amp;#039;&amp;#039;llDataCTFCompensate&amp;#039;&amp;#039;&amp;#039; is &lt;a href=&quot;/Eos/index.php/Eos&quot; title=&quot;Eos&quot;&gt;Eos&lt;/a&gt;&amp;#039;s &lt;a href=&quot;/Eos/index.php/Command&quot; title=&quot;Command&quot;&gt;Command&lt;/a&gt;.   == List of option == === Main option === 		&amp;lt;table border=&amp;quot;1&amp;quot;&amp;gt; 			&amp;lt;tr&amp;gt;  				&amp;lt;th&amp;gt;Option&amp;lt;/th&amp;gt;  				&amp;lt;th&amp;gt;Essential/Optional&amp;lt;/t...&amp;quot;&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;b&gt;New page&lt;/b&gt;&lt;/p&gt;&lt;div&gt;'''llDataCTFCompensate''' is [[Eos]]'s [[Command]].&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
== List of option ==&lt;br /&gt;
=== Main option ===&lt;br /&gt;
		&amp;lt;table border=&amp;quot;1&amp;quot;&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Option&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Essential/Optional&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Description&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Default&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-i&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Essential&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Input: [[llData]]&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;NULL&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-I&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Optional&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;CTFInformation: [[ASCII]]&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;NULL&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-I2&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Optional&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;CTFInformation2: [[ASCII]]&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;NULL&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-o&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Essential&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Output: [[llData]]&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;NULL&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-t&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Essential&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;truePitch[A]&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;430.0&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-c&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Optional&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;ConfigurationFile&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;NULL&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-m&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Optional&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Mode&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;0&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-h&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Optional&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Help&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;　&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
		&amp;lt;/table&amp;gt; &lt;br /&gt;
&amp;lt;div&amp;gt;Either -I or -I2 's Input is essential.&amp;lt;/div&amp;gt;&lt;br /&gt;
&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
=== -m details ===&lt;br /&gt;
		&amp;lt;table border=&amp;quot;1&amp;quot;&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Value&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Description&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;0&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
		&amp;lt;/table&amp;gt; &lt;br /&gt;
&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
===-I  format===&lt;br /&gt;
&amp;lt;div&amp;gt;[[ctfDisplay]] can create it.&amp;lt;/div&amp;gt;&lt;br /&gt;
&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
===-I2  format===&lt;br /&gt;
&amp;lt;pre&amp;gt;&lt;br /&gt;
defocus Cs kV AmplitudeContrast&lt;br /&gt;
&amp;lt;/pre&amp;gt;&lt;br /&gt;
&amp;lt;div&amp;gt;[[llExtractWithLayerSeparationFilamentInfo]](-oI) can create it.&amp;lt;/div&amp;gt;&lt;br /&gt;
&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
== Execution example ==&lt;br /&gt;
===[[Media:Input-LL1.ll.zip|Input file]] data===&lt;br /&gt;
&amp;lt;div&amp;gt;[[File:Input-LL1.png]]&amp;lt;/div&amp;gt;&lt;br /&gt;
&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&amp;lt;div&amp;gt;Set t=364&amp;lt;/div&amp;gt;&lt;br /&gt;
=== Option -I===&lt;br /&gt;
&amp;lt;div&amp;gt;Use the following data.&amp;lt;/div&amp;gt;&lt;br /&gt;
&amp;lt;pre&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&amp;lt;/pre&amp;gt;&lt;br /&gt;
&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&amp;lt;div&amp;gt;Output file&amp;lt;/div&amp;gt;&lt;br /&gt;
&amp;lt;div&amp;gt;[[File:Outdata1-llDataCTFCompensate.png]]&amp;lt;/div&amp;gt;&lt;br /&gt;
&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
=== Option -I2===&lt;br /&gt;
&amp;lt;div&amp;gt;Use the following data.&amp;lt;/div&amp;gt;&lt;br /&gt;
&amp;lt;pre&amp;gt;&lt;br /&gt;
27000.000000 2.100000 200.000000 0.100000&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&amp;lt;/pre&amp;gt;&lt;br /&gt;
&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&amp;lt;div&amp;gt;Output file&amp;lt;/div&amp;gt;&lt;br /&gt;
&amp;lt;div&amp;gt;[[File:Oudata2-llDataCTFCompensate.png]]&amp;lt;/div&amp;gt;&lt;br /&gt;
&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;</summary>
		<author><name>Kinoshita</name></author>	</entry>

	</feed>