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		<title>mrcImageAsProbability - Revision history</title>
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		<title>Kinoshita at 07:49, 16 July 2014</title>
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		<summary type="html">&lt;p&gt;&lt;/p&gt;
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				&lt;col class='diff-marker' /&gt;
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				&lt;td colspan='2' style=&quot;background-color: white; color:black; text-align: center;&quot;&gt;Revision as of 07:49, 16 July 2014&lt;/td&gt;
				&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot;&gt;Line 1:&lt;/td&gt;
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&lt;tr&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;−&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color:black; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;'''mrcImageAsProbability''' is&amp;#160; [[Eos]]'s [[Command]] that is the probability &lt;del class=&quot;diffchange diffchange-inline&quot;&gt;of [[mrcImage]]. &lt;/del&gt;(Normalized so that the sum is 1) We can be used in the kernel file of Convolution or Deconvolution output file.&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;+&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color:black; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;'''mrcImageAsProbability''' is&amp;#160; [[Eos]]'s [[Command]] that is the probability (Normalized so that the sum is 1) &lt;ins class=&quot;diffchange diffchange-inline&quot;&gt;of [[mrcImage]]. &lt;/ins&gt;We can be used in the kernel file of Convolution or Deconvolution output file.&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;&amp;#160;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f9f9f9; color: #333333; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #e6e6e6; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;&amp;#160;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f9f9f9; color: #333333; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #e6e6e6; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;&amp;#160;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f9f9f9; color: #333333; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #e6e6e6; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;&amp;#160;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f9f9f9; color: #333333; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #e6e6e6; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
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		<author><name>Kinoshita</name></author>	</entry>

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		<title>Kinoshita: Created page with &quot;'''mrcImageAsProbability''' is  Eos's Command that is the probability of mrcImage. (Normalized so that the sum is 1) We can be used in the kernel file of Convoluti...&quot;</title>
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		<summary type="html">&lt;p&gt;Created page with &amp;quot;&amp;#039;&amp;#039;&amp;#039;mrcImageAsProbability&amp;#039;&amp;#039;&amp;#039; is  &lt;a href=&quot;/Eos/index.php/Eos&quot; title=&quot;Eos&quot;&gt;Eos&lt;/a&gt;&amp;#039;s &lt;a href=&quot;/Eos/index.php/Command&quot; title=&quot;Command&quot;&gt;Command&lt;/a&gt; that is the probability of &lt;a href=&quot;/Eos/index.php/mrcImage&quot; title=&quot;mrcImage&quot;&gt;mrcImage&lt;/a&gt;. (Normalized so that the sum is 1) We can be used in the kernel file of Convoluti...&amp;quot;&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;b&gt;New page&lt;/b&gt;&lt;/p&gt;&lt;div&gt;'''mrcImageAsProbability''' is  [[Eos]]'s [[Command]] that is the probability of [[mrcImage]]. (Normalized so that the sum is 1) We can be used in the kernel file of Convolution or Deconvolution output file.&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
== List of option ==&lt;br /&gt;
=== Main option ===&lt;br /&gt;
		&amp;lt;table border=&amp;quot;1&amp;quot;&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Option&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Essential/Optional&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Description&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Default&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-i&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Essential&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Input&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;NULL&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-o&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Essential&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Output&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;NULL&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-c&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Optional&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;ConfigurationFile&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;NULL&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-m&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Optional&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Mode&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;0&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;-h&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Optional&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;Help&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;　&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
		&amp;lt;/table&amp;gt; &lt;br /&gt;
&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
=== -m details ===&lt;br /&gt;
		&amp;lt;table border=&amp;quot;1&amp;quot;&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Value&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Description&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;0&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
		&amp;lt;/table&amp;gt; &lt;br /&gt;
&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
== Execution example ==&lt;br /&gt;
===[[Media:Input-1VOM-N-2D-v.mrc|Input file]] image===&lt;br /&gt;
	&amp;lt;table&amp;gt; &lt;br /&gt;
		&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;[[File:Input-1VOM-N-2D-v.png]]&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;Size&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				Min&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				Max&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				Mean&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				SD&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				SE&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				Sum&amp;lt;br&amp;gt; &amp;lt;/p&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;(        80,         80,          1)&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				1348.3 (10, 1, 0)&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				72942.8 (24, 39, 0)&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				27214.9&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				10067.6&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				125.845&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				1.74175e+08&amp;lt;br&amp;gt; &amp;lt;/p&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
		&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
	&amp;lt;/table&amp;gt;&lt;br /&gt;
&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
=== Example of options only essential ===&lt;br /&gt;
	&amp;lt;table&amp;gt; &lt;br /&gt;
		&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;[[File:Outdata-mrcImageAsProbability.png]]&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;Size&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				Min&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				Max&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				Mean&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				SD&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				SE&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				Sum&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;/p&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;(        80,         80,          1)&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				7.74108e-06 (10, 1, 0)&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
				0.00041879 (24, 39, 0)&amp;lt;br&amp;gt; &lt;br /&gt;
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			&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
		&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
	&amp;lt;/table&amp;gt; &lt;br /&gt;
&amp;lt;div&amp;gt;The value is normalized as: (Sum) = (Mean) * (Size) = 0.00015625 * 80 * 80 * 1 = 1&amp;lt;/div&amp;gt;&lt;br /&gt;
&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;</summary>
		<author><name>Kinoshita</name></author>	</entry>

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