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		<title>mrcImageContourSurfaceCreate - Revision history</title>
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		<title>Kinoshita: Created page with &quot;'''mrcImageContourSurfaceCreate''' is Eos's Command that that creates a surface of the contour.  == List of option == === Main option === 		&lt;table border=&quot;1&quot;&gt; 			&lt;div...&quot;</title>
		<link rel="alternate" type="text/html" href="http://www.yasunaga-lab.bio.kyutech.ac.jp/Eos/index.php?title=mrcImageContourSurfaceCreate&amp;diff=1009&amp;oldid=prev"/>
				<updated>2014-07-23T02:47:17Z</updated>
		
		<summary type="html">&lt;p&gt;Created page with &amp;quot;&amp;#039;&amp;#039;&amp;#039;mrcImageContourSurfaceCreate&amp;#039;&amp;#039;&amp;#039; is &lt;a href=&quot;/Eos/index.php/Eos&quot; title=&quot;Eos&quot;&gt;Eos&lt;/a&gt;&amp;#039;s &lt;a href=&quot;/Eos/index.php/Command&quot; title=&quot;Command&quot;&gt;Command&lt;/a&gt; that that creates a surface of the contour.  == List of option == === Main option === 		&amp;lt;table border=&amp;quot;1&amp;quot;&amp;gt; 			&amp;lt;div...&amp;quot;&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;b&gt;New page&lt;/b&gt;&lt;/p&gt;&lt;div&gt;'''mrcImageContourSurfaceCreate''' is [[Eos]]'s [[Command]] that that creates a surface of the contour.&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
== List of option ==&lt;br /&gt;
=== Main option ===&lt;br /&gt;
		&amp;lt;table border=&amp;quot;1&amp;quot;&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;div align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;&lt;br /&gt;
				&amp;lt;tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;th&amp;gt;Option&amp;lt;/th&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;th&amp;gt;Essential/Optional&amp;lt;/th&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;th&amp;gt;Description&amp;lt;/th&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;th&amp;gt;Default&amp;lt;/th&amp;gt;&lt;br /&gt;
				&amp;lt;/tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
				&amp;lt;tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;-i&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;Essential&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;Input: [[mrcImage]]&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;NULL&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
				&amp;lt;/tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
				&amp;lt;tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;-o&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;Essential&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;Output: [[mrcImage]]&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;NULL&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
				&amp;lt;/tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
				&amp;lt;tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;-C&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;Essential&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;Input: Contour Value&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;0.0&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
				&amp;lt;/tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
				&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;-c&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;Optional&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;ConfigurationFile&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;NULL&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;-m&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;Optional&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;Mode&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;0&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;-h&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;Optional&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;Help&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
					&amp;lt;td&amp;gt;　&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
				&amp;lt;/tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;/div&amp;gt;&lt;br /&gt;
		&amp;lt;/table&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
=== -m details ===&lt;br /&gt;
		&amp;lt;table border=&amp;quot;1&amp;quot;&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Value&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;th&amp;gt;Description&amp;lt;/th&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;0&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
				&amp;lt;td&amp;gt;SimpleMethod&amp;lt;/td&amp;gt; &lt;br /&gt;
			&amp;lt;/tr&amp;gt; &lt;br /&gt;
		&amp;lt;/table&amp;gt; &lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
== Execution example ==&lt;br /&gt;
=== Input file's image ===&lt;br /&gt;
	&amp;lt;table&amp;gt;&lt;br /&gt;
		&amp;lt;tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;[[File:B120-MrcImageContourSurfaceCreate.png]]&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;Min&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				Max&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				Mean&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				SD&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				SE&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;/p&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;0&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				65.5929&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				5.45036&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				12.3043&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				0.153804&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;/p&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
		&amp;lt;/tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
	&amp;lt;/table&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
===------Option -C------===&lt;br /&gt;
====Case: C=0.1====&lt;br /&gt;
	&amp;lt;table&amp;gt;&lt;br /&gt;
		&amp;lt;tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;[[File:Outdata1-0.1-MrcImageContourSurfaceCreate.png]]&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;Min&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				Max&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				Mean&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				SD&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				SE&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;/p&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;0&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				1&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				0.0484375&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				0.214689&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				0.00268361&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;/p&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
		&amp;lt;/tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
	&amp;lt;/table&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
====Case: C=1====&lt;br /&gt;
	&amp;lt;table&amp;gt;&lt;br /&gt;
		&amp;lt;tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;[[File:Outdata1-1-MrcImageContourSurfaceCreate.png]]&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;Min&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				Max&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				Mean&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				SD&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				SE&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;/p&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;0&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				1&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				0.0484375&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				0.214689&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				0.00268361&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;/p&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
		&amp;lt;/tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
	&amp;lt;/table&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
====Case: C=10====&lt;br /&gt;
	&amp;lt;table&amp;gt;&lt;br /&gt;
		&amp;lt;tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;[[File:Outdata1-10-MrcImageContourSurfaceCreate.png]]&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;Min&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				Max&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				Mean&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				SD&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				SE&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;/p&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;td&amp;gt;&amp;lt;p align=&amp;quot;left&amp;quot;&amp;gt;0&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				1&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				0.0484375&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				0.211371&amp;lt;br&amp;gt;&lt;br /&gt;
				0.00264214&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;/p&amp;gt;&lt;br /&gt;
			&amp;lt;/td&amp;gt;&lt;br /&gt;
		&amp;lt;/tr&amp;gt;&lt;br /&gt;
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		<author><name>Kinoshita</name></author>	</entry>

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