Difference between revisions of "mrcImageGaussSphere"

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(→‎Main option)
Line 20: Line 20:
 
<td>-sigmax</td>
 
<td>-sigmax</td>
 
<td>Optional</td>
 
<td>Optional</td>
−
<td>物体のｘ軸の幅を設定</td>
+
<td>sigmax[A]</td>
 
<td>10</td>
 
<td>10</td>
 
</tr>
 
</tr>
Line 26: Line 26:
 
<td>-sigmay</td>
 
<td>-sigmay</td>
 
<td>Optional</td>
 
<td>Optional</td>
−
<td>物体のｙ軸の幅を設定</td>
+
<td>sigmay[A]</td>
 
<td>20</td>
 
<td>20</td>
 
</tr>
 
</tr>
Line 32: Line 32:
 
<td>-sigmaz</td>
 
<td>-sigmaz</td>
 
<td>Optional</td>
 
<td>Optional</td>
−
<td>物体のz軸の幅を設定</td>
+
<td>sigmaz[A]</td>
 
<td>30</td>
 
<td>30</td>
 
</tr>
 
</tr>
Line 38: Line 38:
 
<td>-sigma_range</td>
 
<td>-sigma_range</td>
 
<td>Optional</td>
 
<td>Optional</td>
−
<td>画像データの大きさを設定</td>
+
<td>x times</td>
 
<td>3</td>
 
<td>3</td>
 
</tr>
 
</tr>
Line 44: Line 44:
 
<td>-weight</td>
 
<td>-weight</td>
 
<td>Optional</td>
 
<td>Optional</td>
−
<td>物体の高さを設定</td>
+
<td>weight</td>
 
<td>10</td>
 
<td>10</td>
 
</tr>
 
</tr>
Line 50: Line 50:
 
<td>-size</td>
 
<td>-size</td>
 
<td>Optional</td>
 
<td>Optional</td>
−
<td>ピクセルのサイズを設定</td>
+
<td>Pixel Size[A]</td>
 
<td>5</td>
 
<td>5</td>
 
</tr>
 
</tr>
Line 56: Line 56:
 
<td>-W</td>
 
<td>-W</td>
 
<td>Optional</td>
 
<td>Optional</td>
−
<td>画像データの幅（ｘ軸）を設定</td>
+
<td>Width[A]</td>
 
<td>0</td>
 
<td>0</td>
 
</tr>
 
</tr>
Line 62: Line 62:
 
<td>-H</td>
 
<td>-H</td>
 
<td>Optional</td>
 
<td>Optional</td>
−
<td>画像データの高さ（ｙ軸）を設定</td>
+
<td>Height[A]</td>
 
<td>0</td>
 
<td>0</td>
 
</tr>
 
</tr>
Line 68: Line 68:
 
<td>-S</td>
 
<td>-S</td>
 
<td>Optional</td>
 
<td>Optional</td>
−
<td>画像データの奥行き（ｚ軸）を設定</td>
+
<td>Section[A]</td>
 
<td>0</td>
 
<td>0</td>
 
</tr>
 
</tr>
Line 86: Line 86:
 
</table>
 
</table>
  
−
<div>ファイルサイズ＝(sigma_range*sigmax*2) x (sigma_range*sigmay*2) x (sigma_range*sigmaz*2)</div>
+
<div>mrcImageFileSize＝(sigma_range*sigmax*2) x (sigma_range*sigmay*2) x (sigma_range*sigmaz*2)</div>
  
 
=== -m details ===
 
=== -m details ===

Revision as of 00:29, 25 July 2014

mrcImageGaussSphere is Eos's Command that creates a Gauss Sphere.

List of option

Main option

Option Essential/Optional NULL Default
-o Essential Output: mrcImage NULL
-sigmax Optional sigmax[A] 10
-sigmay Optional sigmay[A] 20
-sigmaz Optional sigmaz[A] 30
-sigma_range Optional x times 3
-weight Optional weight 10
-size Optional Pixel Size[A] 5
-W Optional Width[A] 0
-H Optional Height[A] 0
-S Optional Section[A] 0
-m Optional Mode 2
-h Optional Help 　
mrcImageFileSize＝(sigma_range*sigmax*2) x (sigma_range*sigmay*2) x (sigma_range*sigmaz*2)

-m details

Value Description
0 char（１バイト）
2 float（４バイト）


Execution example

------必須項目のオプションのみの場合------

Outdata-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

1.87953e-11

10
0.222265
0.858162

0.00782576

 ｚ軸の中央部分の切断面を表示
　　－－－－－－＞		 Outdata-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

1.523e-07

10
0.773306
1.80792

0.100285

------オプション　-sigmax,-sigmay,-sigmaz------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=50

Outdata-xyz50-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

1.87953e-11

10
0.24531
0.898424

0.00188576

 ｚ軸の中央部分の切断面を表示
　　－－－－－－＞		 Outdataoutdata-xyz50-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

1.523e-07

10
0.84426
1.87314

0.0307072

------オプション　-sigma_range------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1

-sigma_range=3（デフォルト）
Outdata-xy50z1-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

2.94008e-10

0.0193046
0.00162981
0.00361602

4.19165e-05
-sigma_range=2
Outdata-xy50z1-sigma range2-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

0.00335463

0.0193046
0.00162981
0.00361602

4.19165e-05

------オプション　-weight------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1

-weight=10（デフォルト）
Outdata-xy50z1-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

2.94008e-10

0.0193046
0.00162981
0.00361602

4.19165e-05
-weight=30
Outdata-xy50z1-weight30-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

8.82023e-10

0.0579137
0.00488942
0.010848

0.00012575

------オプション　-size------

-sigmaz=1

-size=1
Outdata-z1-size1-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

1.87953e-11

10
0.215562
0.852389

0.00375

 ｚ軸の中央部分の切断面を表示
　　－－－－－－＞		 Outdata-z1-size1-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

1.523e-07

10
0.851235
1.87929

0.0218744

------オプション　-W,-H------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1

-W=500,-H=500,-S=500に設定する
Outdata-xy50z1-WHS500-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

0

0.0192083
1.21294e-05
0.000341949

3.41949e-07

 ｚ軸の中央部分の切断面を表示
　　－－－－－－＞		 Outdata-xy50z1-WHS500-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

1.00707e-23

0.0192083
0.00060647
0.00234222

2.34222e-05
※ピクセルサイズがデフォルト（５）となっているので、ｘ軸およびｙ軸の幅は100となる

------オプション　-m------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=50

モード：０
Outdata-xyz50-WHS500m0-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

0

9
0.0378
0.38963

0.00038963

 ｚ軸の中央部分の切断面を表示
　　－－－－－－＞		 Outdata-xyz50-WHS500m0-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

0

9
0.2476
1.10666

0.0110666
モード：２
Outdata-xyz50-WHS500m2-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

1.19151e-31

9.92528
0.0556833
0.440193

0.000440193

 ｚ軸の中央部分の切断面を表示
　　－－－－－－＞		 Outdata-xyz50-WHS500m2-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

5.20371e-21

9.92528
0.313375
1.21027

0.0121027
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