Difference between revisions of "mrcImageGaussSphere"

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(Main option)
(-m details)
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<tr>
 
<tr>
 
<td>0</td>
 
<td>0</td>
<td>char(1バイト)</td>
+
<td>char (1 byte)</td>
 
</tr>
 
</tr>
 
<tr>
 
<tr>
 
<td>2</td>
 
<td>2</td>
<td>float(4バイト)</td>
+
<td>float (4 bytes)</td>
 
</tr>
 
</tr>
 
</div>
 
</div>
 
</table>
 
</table>
 
  
 
== Execution example ==
 
== Execution example ==

Revision as of 00:29, 25 July 2014

mrcImageGaussSphere is Eos's Command that creates a Gauss Sphere.

List of option

Main option

Option Essential/Optional NULL Default
-o Essential Output: mrcImage NULL
-sigmax Optional sigmax[A] 10
-sigmay Optional sigmay[A] 20
-sigmaz Optional sigmaz[A] 30
-sigma_range Optional x times 3
-weight Optional weight 10
-size Optional Pixel Size[A] 5
-W Optional Width[A] 0
-H Optional Height[A] 0
-S Optional Section[A] 0
-m Optional Mode 2
-h Optional Help  
mrcImageFileSize=(sigma_range*sigmax*2) x (sigma_range*sigmay*2) x (sigma_range*sigmaz*2)

-m details

Value Description
0 char (1 byte)
2 float (4 bytes)

Execution example

------必須項目のオプションのみの場合------

Outdata-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

1.87953e-11

10
0.222265
0.858162

0.00782576

z軸の中央部分の切断面を表示
  ------>
Outdata-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

1.523e-07

10
0.773306
1.80792

0.100285

------オプション -sigmax,-sigmay,-sigmaz------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=50

Outdata-xyz50-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

1.87953e-11

10
0.24531
0.898424

0.00188576

z軸の中央部分の切断面を表示
  ------>
Outdataoutdata-xyz50-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

1.523e-07

10
0.84426
1.87314

0.0307072

------オプション -sigma_range------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1

-sigma_range=3(デフォルト)
Outdata-xy50z1-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

2.94008e-10

0.0193046
0.00162981
0.00361602

4.19165e-05

-sigma_range=2
Outdata-xy50z1-sigma range2-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

0.00335463

0.0193046
0.00162981
0.00361602

4.19165e-05

------オプション -weight------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1

-weight=10(デフォルト)
Outdata-xy50z1-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

2.94008e-10

0.0193046
0.00162981
0.00361602

4.19165e-05

-weight=30
Outdata-xy50z1-weight30-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

8.82023e-10

0.0579137
0.00488942
0.010848

0.00012575

------オプション -size------

-sigmaz=1

-size=1
Outdata-z1-size1-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

1.87953e-11

10
0.215562
0.852389

0.00375

z軸の中央部分の切断面を表示
  ------>
Outdata-z1-size1-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

1.523e-07

10
0.851235
1.87929

0.0218744

------オプション -W,-H------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1

-W=500,-H=500,-S=500に設定する
Outdata-xy50z1-WHS500-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

0

0.0192083
1.21294e-05
0.000341949

3.41949e-07

z軸の中央部分の切断面を表示
  ------>
Outdata-xy50z1-WHS500-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

1.00707e-23

0.0192083
0.00060647
0.00234222

2.34222e-05

※ピクセルサイズがデフォルト(5)となっているので、x軸およびy軸の幅は100となる

------オプション -m------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=50

モード:0
Outdata-xyz50-WHS500m0-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

0

9
0.0378
0.38963

0.00038963

z軸の中央部分の切断面を表示
  ------>
Outdata-xyz50-WHS500m0-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

0

9
0.2476
1.10666

0.0110666

モード:2
Outdata-xyz50-WHS500m2-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

1.19151e-31

9.92528
0.0556833
0.440193

0.000440193

z軸の中央部分の切断面を表示
  ------>
Outdata-xyz50-WHS500m2-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

Min

Max
Mean
SD

SE

5.20371e-21

9.92528
0.313375
1.21027

0.0121027