ctfDisplay
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ctfDisplayは、デフォーカスなどのCTFパラメータを設定するためのIntegration Tools(Integration Commands)の一つです。自動的にCTFパラメータを決定するコマンドもありますが、cryo-EMのdataなどで、コントラストが低い場合、SN比が悪い場合、また、自動決定したデフォーカス量等を確認する意味で利用されます。
List of option
Main option
| Option | Essential/Optional | Description | Default |
|---|---|---|---|
| -i | Optional | Input: mrcImage(FFT) | NULL |
| -o | Optional | 入Output file: CTF Information | stdout |
| -Rmax | Optional | Rmax: [A-1] | 0.2 |
| -Imax | Optional | Intensity max | 0.2 |
| -Imin | Optional | Intensity min | 0.2 |
| -AutoRange | Optional | ||
| -Log | Optional | Log of Intensity | |
| -c | Optional | ConfigurationFile | NULL |
| -m | Optional | Mode | 0 |
| -h | Optional | Help |
-o 's Input and Output file can be used by mrcImageCTFCompensation.
-m details
| Value | Description |
|---|---|
| 0 |
