Eospedia - 利用者の投稿記録 [ja]

mrcImageBinalization

2022-01-28T07:11:58Z

Yasuda: /* モードの詳細 */

'''mrcImageBinalization'''とは画像の２値化（閾値指定、大津の方法などの自動閾値指定を含む）を行う[[Eos]]の[[コマンド]]である。

== オプション一覧 ==
===メインオプション===
<table border="1">
<tr>
<th>オプション</th>
<th>必須項目/選択項目</th>
<th>説明</th>
<th>デフォルト</th>
</tr>
<tr>
<td>-i</td>
<td>必須</td>
<td>入力ファイル: [[mrcImage]]</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-o</td>
<td>必須</td>
<td>出力ファイル: [[mrcImage]]</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-O</td>
<td>選択</td>
<td>閾値等のパラメータの出力：出力ファイル: [[ASCII]]</td>
<td>stdout</td>
</tr>
<tr>
<td>-t</td>
<td>選択</td>
<td>閾値</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-d</td>
<td>選択</td>
<td>delta閾値</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-s</td>
<td>選択</td>
<td>sigma閾値</td>
<td>0.5</td>
</tr>
<tr>
<td>-v</td>
<td>選択</td>
<td>value</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-near</td>
<td>選択</td>
<td>Near[pixel]: Near-area also binary</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-nLevel</td>
<td>選択</td>
<td>nLevel: For creating histgram by Kittler and Ohtsu </td>
<td>256</td>
</tr>
<tr>
<td>-p</td>
<td>選択</td>
<td>p</td>
<td>0.5</td>
</tr>
<tr>
<td>-c</td>
<td>選択</td>
<td>コンフィグファイル設定</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-m</td>
<td>選択</td>
<td>モードを設定</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-h</td>
<td>選択</td>
<td>ヘルプを表示</td>
<td>　</td>
</tr>
</table>

===モードの詳細===
<table border="1">
<tr>
<th>モード</th>
<th>説明</th>
</tr>
<tr>
<td>0</td>
<td>閾値未満は0、閾値以上は1に設定</td>
</tr>
<tr>
<td>1</td>
<td>閾値超は0、閾値以下は1に設定</td>
</tr>
<tr>
<td>2</td>
<td>閾値未満はvalueに設定し、閾値以上は変更しない</td>
</tr>
<tr>
<td>3</td>
<td>閾値超はvalueに設定し、閾値以下は変更しない</td>
</tr>
<tr>
<td>4</td>
<td>閾値超はvalueに設定し，-sigで設定されるsigに対して，
</tr>
<tr>
<td>5</td>
<td></td>
</tr>
<tr>
<td>6</td>
<td></td>
</tr>
<tr>
<td>7</td>
<td></td>
</tr>
<tr>
<td>16</td>
<td>自動閾値指定 by Kittler Method</td>
</tr>
<tr>
<td>32</td>
<td>自動閾値指定 by Ohtsu Method</td>
</tr>
<tr>
<td>48</td>
<td>自動閾値指定 by p-tile Method 
p range: 0.0 - 1.0</td>
</tr>
<tr>
<td>64</td>
<td>自動閾値指定 by Differential-Histogram Method</td>
</tr>
<tr>
<td>80</td>
<td>自動閾値指定 by Laplacian-Histogram Method</td>
</tr>
</table>

== 実行例 ==
===入力ファイルの画像===
<table>
<tr>
<td>[[画像:Input-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
255 
21.0538 
47.6709 
0.595886 
</td>
</tr>
</table>

===オプション必須項目のみの場合===
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>1 
1 
1 
0 
0 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-t===
====t=20で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-t20-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.200313 
0.400234 
0.00500293 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-near===
====near=5, t=20で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-near5t20-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.333125 
0.471331 
0.00589164 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-m===
====m=1, t=20で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m1t20-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.800937 
0.399295 
0.00499119 
</td>
</tr>
</table>

====m=2, t=50で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m2t50-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
255 
19.1695 
47.8459 
0.598074 
</td>
</tr>
</table>

====m=2, t=50, v=255 で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m2t50v255-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>50 
255 
234.047 
51.6961 
0.646201 
</td>
</tr>
</table>

====m=3, t=50で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m3t50-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
50 
1.97797 
7.73614 
0.0967017 
</td>
</tr>
</table>

====m=3, t=50, v=255 で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m3t50v255-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
255 
41.6225 
91.8732 
1.14841 
</td>
</tr>
</table>

====m=16で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m16-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.256719 
0.436823 
0.00546029 
</td>
</tr>
</table>

====m=32で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m32-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.135937 
0.342722 
0.00428403 
</td>
</tr>
</table>

====m=48で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m48-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>1 
1 
1 
0 
0 
</td>
</tr>
</table>

====m=48, p=0.1で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m48p0.1-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.100781 
0.301039 
0.00376299 
</td>
</tr>
</table>

====m=64で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m64-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.0646875 
0.245974 
0.00307467 
</td>
</tr>
</table>

====m=80で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m80-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.140937 
0.347957 
0.00434946 
</td>
</tr>
</table>

mrcImageBinalization

2022-01-28T07:06:38Z

Yasuda: /* メインオプション */

'''mrcImageBinalization'''とは画像の２値化（閾値指定、大津の方法などの自動閾値指定を含む）を行う[[Eos]]の[[コマンド]]である。

== オプション一覧 ==
===メインオプション===
<table border="1">
<tr>
<th>オプション</th>
<th>必須項目/選択項目</th>
<th>説明</th>
<th>デフォルト</th>
</tr>
<tr>
<td>-i</td>
<td>必須</td>
<td>入力ファイル: [[mrcImage]]</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-o</td>
<td>必須</td>
<td>出力ファイル: [[mrcImage]]</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-O</td>
<td>選択</td>
<td>閾値等のパラメータの出力：出力ファイル: [[ASCII]]</td>
<td>stdout</td>
</tr>
<tr>
<td>-t</td>
<td>選択</td>
<td>閾値</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-d</td>
<td>選択</td>
<td>delta閾値</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-s</td>
<td>選択</td>
<td>sigma閾値</td>
<td>0.5</td>
</tr>
<tr>
<td>-v</td>
<td>選択</td>
<td>value</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-near</td>
<td>選択</td>
<td>Near[pixel]: Near-area also binary</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-nLevel</td>
<td>選択</td>
<td>nLevel: For creating histgram by Kittler and Ohtsu </td>
<td>256</td>
</tr>
<tr>
<td>-p</td>
<td>選択</td>
<td>p</td>
<td>0.5</td>
</tr>
<tr>
<td>-c</td>
<td>選択</td>
<td>コンフィグファイル設定</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-m</td>
<td>選択</td>
<td>モードを設定</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-h</td>
<td>選択</td>
<td>ヘルプを表示</td>
<td>　</td>
</tr>
</table>

===モードの詳細===
<table border="1">
<tr>
<th>モード</th>
<th>説明</th>
</tr>
<tr>
<td>0</td>
<td>閾値未満は0、閾値以上は1に設定</td>
</tr>
<tr>
<td>1</td>
<td>閾値超は0、閾値以下は1に設定</td>
</tr>
<tr>
<td>2</td>
<td>閾値未満はvalueに設定し、閾値以上は変更しない</td>
</tr>
<tr>
<td>3</td>
<td>閾値超はvalueに設定し、閾値以下は変更しない</td>
</tr>
<tr>
<td>4</td>
<td>閾値超はvalueに設定し，-sigで設定されるsigに対して，
</tr>
<tr>
<td>16</td>
<td>自動閾値指定 by Kittler Method</td>
</tr>
<tr>
<td>32</td>
<td>自動閾値指定 by Ohtsu Method</td>
</tr>
<tr>
<td>48</td>
<td>自動閾値指定 by p-tile Method 
p range: 0.0 - 1.0</td>
</tr>
<tr>
<td>64</td>
<td>自動閾値指定 by Differential-Histogram Method</td>
</tr>
<tr>
<td>80</td>
<td>自動閾値指定 by Laplacian-Histogram Method</td>
</tr>
</table>

== 実行例 ==
===入力ファイルの画像===
<table>
<tr>
<td>[[画像:Input-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
255 
21.0538 
47.6709 
0.595886 
</td>
</tr>
</table>

===オプション必須項目のみの場合===
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>1 
1 
1 
0 
0 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-t===
====t=20で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-t20-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.200313 
0.400234 
0.00500293 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-near===
====near=5, t=20で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-near5t20-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.333125 
0.471331 
0.00589164 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-m===
====m=1, t=20で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m1t20-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.800937 
0.399295 
0.00499119 
</td>
</tr>
</table>

====m=2, t=50で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m2t50-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
255 
19.1695 
47.8459 
0.598074 
</td>
</tr>
</table>

====m=2, t=50, v=255 で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m2t50v255-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>50 
255 
234.047 
51.6961 
0.646201 
</td>
</tr>
</table>

====m=3, t=50で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m3t50-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
50 
1.97797 
7.73614 
0.0967017 
</td>
</tr>
</table>

====m=3, t=50, v=255 で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m3t50v255-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
255 
41.6225 
91.8732 
1.14841 
</td>
</tr>
</table>

====m=16で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m16-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.256719 
0.436823 
0.00546029 
</td>
</tr>
</table>

====m=32で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m32-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.135937 
0.342722 
0.00428403 
</td>
</tr>
</table>

====m=48で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m48-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>1 
1 
1 
0 
0 
</td>
</tr>
</table>

====m=48, p=0.1で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m48p0.1-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.100781 
0.301039 
0.00376299 
</td>
</tr>
</table>

====m=64で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m64-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.0646875 
0.245974 
0.00307467 
</td>
</tr>
</table>

====m=80で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m80-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.140937 
0.347957 
0.00434946 
</td>
</tr>
</table>

mrcImageBinalization

2022-01-28T07:05:13Z

Yasuda: /* メインオプション */

'''mrcImageBinalization'''とは画像の２値化（閾値指定、大津の方法などの自動閾値指定を含む）を行う[[Eos]]の[[コマンド]]である。

== オプション一覧 ==
===メインオプション===
<table border="1">
<tr>
<th>オプション</th>
<th>必須項目/選択項目</th>
<th>説明</th>
<th>デフォルト</th>
</tr>
<tr>
<td>-i</td>
<td>必須</td>
<td>入力ファイル: [[mrcImage]]</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-o</td>
<td>必須</td>
<td>出力ファイル: [[mrcImage]]</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-O</td>
<td>選択</td>
<td>閾値等のパラメータの出力：出力ファイル: [[ASCII]]</td>
<td>stdout</td>
</tr>
<tr>
<td>-t</td>
<td>選択</td>
<td>delta閾値</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-s</td>
<td>選択</td>
<td>sigma閾値</td>
<td>0.5</td>
</tr>
<tr>
<td>-v</td>
<td>選択</td>
<td>value</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-near</td>
<td>選択</td>
<td>Near[pixel]: Near-area also binary</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-nLevel</td>
<td>選択</td>
<td>nLevel: For creating histgram by Kittler and Ohtsu </td>
<td>256</td>
</tr>
<tr>
<td>-p</td>
<td>選択</td>
<td>p</td>
<td>0.5</td>
</tr>
<tr>
<td>-c</td>
<td>選択</td>
<td>コンフィグファイル設定</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-m</td>
<td>選択</td>
<td>モードを設定</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-h</td>
<td>選択</td>
<td>ヘルプを表示</td>
<td>　</td>
</tr>
</table>

===モードの詳細===
<table border="1">
<tr>
<th>モード</th>
<th>説明</th>
</tr>
<tr>
<td>0</td>
<td>閾値未満は0、閾値以上は1に設定</td>
</tr>
<tr>
<td>1</td>
<td>閾値超は0、閾値以下は1に設定</td>
</tr>
<tr>
<td>2</td>
<td>閾値未満はvalueに設定し、閾値以上は変更しない</td>
</tr>
<tr>
<td>3</td>
<td>閾値超はvalueに設定し、閾値以下は変更しない</td>
</tr>
<tr>
<td>4</td>
<td>閾値超はvalueに設定し，-sigで設定されるsigに対して，
</tr>
<tr>
<td>16</td>
<td>自動閾値指定 by Kittler Method</td>
</tr>
<tr>
<td>32</td>
<td>自動閾値指定 by Ohtsu Method</td>
</tr>
<tr>
<td>48</td>
<td>自動閾値指定 by p-tile Method 
p range: 0.0 - 1.0</td>
</tr>
<tr>
<td>64</td>
<td>自動閾値指定 by Differential-Histogram Method</td>
</tr>
<tr>
<td>80</td>
<td>自動閾値指定 by Laplacian-Histogram Method</td>
</tr>
</table>

== 実行例 ==
===入力ファイルの画像===
<table>
<tr>
<td>[[画像:Input-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
255 
21.0538 
47.6709 
0.595886 
</td>
</tr>
</table>

===オプション必須項目のみの場合===
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>1 
1 
1 
0 
0 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-t===
====t=20で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-t20-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.200313 
0.400234 
0.00500293 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-near===
====near=5, t=20で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-near5t20-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.333125 
0.471331 
0.00589164 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-m===
====m=1, t=20で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m1t20-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.800937 
0.399295 
0.00499119 
</td>
</tr>
</table>

====m=2, t=50で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m2t50-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
255 
19.1695 
47.8459 
0.598074 
</td>
</tr>
</table>

====m=2, t=50, v=255 で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m2t50v255-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>50 
255 
234.047 
51.6961 
0.646201 
</td>
</tr>
</table>

====m=3, t=50で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m3t50-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
50 
1.97797 
7.73614 
0.0967017 
</td>
</tr>
</table>

====m=3, t=50, v=255 で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m3t50v255-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
255 
41.6225 
91.8732 
1.14841 
</td>
</tr>
</table>

====m=16で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m16-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.256719 
0.436823 
0.00546029 
</td>
</tr>
</table>

====m=32で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m32-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.135937 
0.342722 
0.00428403 
</td>
</tr>
</table>

====m=48で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m48-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>1 
1 
1 
0 
0 
</td>
</tr>
</table>

====m=48, p=0.1で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m48p0.1-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.100781 
0.301039 
0.00376299 
</td>
</tr>
</table>

====m=64で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m64-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.0646875 
0.245974 
0.00307467 
</td>
</tr>
</table>

====m=80で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m80-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.140937 
0.347957 
0.00434946 
</td>
</tr>
</table>

mrcImageBinalization

2022-01-28T07:03:13Z

Yasuda: /* メインオプション */

'''mrcImageBinalization'''とは画像の２値化（閾値指定、大津の方法などの自動閾値指定を含む）を行う[[Eos]]の[[コマンド]]である。

== オプション一覧 ==
===メインオプション===
<table border="1">
<tr>
<th>オプション</th>
<th>必須項目/選択項目</th>
<th>説明</th>
<th>デフォルト</th>
</tr>
<tr>
<td>-i</td>
<td>必須</td>
<td>入力ファイル: [[mrcImage]]</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-o</td>
<td>必須</td>
<td>出力ファイル: [[mrcImage]]</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-O</td>
<td>選択</td>
<td>閾値等のパラメータの出力：出力ファイル: [[ASCII]]</td>
<td>stdout</td>
</tr>
<tr>
<td>-t</td>
<td>選択</td>
<td>閾値</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-v</td>
<td>選択</td>
<td>value</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-s</td>
<td>選択</td>
<td>sigma</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-near</td>
<td>選択</td>
<td>Near[pixel]: Near-area also binary</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-nLevel</td>
<td>選択</td>
<td>nLevel: For creating histgram by Kittler and Ohtsu </td>
<td>256</td>
</tr>
<tr>
<td>-p</td>
<td>選択</td>
<td>p</td>
<td>0.5</td>
</tr>
<tr>
<td>-c</td>
<td>選択</td>
<td>コンフィグファイル設定</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-m</td>
<td>選択</td>
<td>モードを設定</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-h</td>
<td>選択</td>
<td>ヘルプを表示</td>
<td>　</td>
</tr>
</table>

===モードの詳細===
<table border="1">
<tr>
<th>モード</th>
<th>説明</th>
</tr>
<tr>
<td>0</td>
<td>閾値未満は0、閾値以上は1に設定</td>
</tr>
<tr>
<td>1</td>
<td>閾値超は0、閾値以下は1に設定</td>
</tr>
<tr>
<td>2</td>
<td>閾値未満はvalueに設定し、閾値以上は変更しない</td>
</tr>
<tr>
<td>3</td>
<td>閾値超はvalueに設定し、閾値以下は変更しない</td>
</tr>
<tr>
<td>4</td>
<td>閾値超はvalueに設定し，-sigで設定されるsigに対して，
</tr>
<tr>
<td>16</td>
<td>自動閾値指定 by Kittler Method</td>
</tr>
<tr>
<td>32</td>
<td>自動閾値指定 by Ohtsu Method</td>
</tr>
<tr>
<td>48</td>
<td>自動閾値指定 by p-tile Method 
p range: 0.0 - 1.0</td>
</tr>
<tr>
<td>64</td>
<td>自動閾値指定 by Differential-Histogram Method</td>
</tr>
<tr>
<td>80</td>
<td>自動閾値指定 by Laplacian-Histogram Method</td>
</tr>
</table>

== 実行例 ==
===入力ファイルの画像===
<table>
<tr>
<td>[[画像:Input-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
255 
21.0538 
47.6709 
0.595886 
</td>
</tr>
</table>

===オプション必須項目のみの場合===
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>1 
1 
1 
0 
0 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-t===
====t=20で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-t20-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.200313 
0.400234 
0.00500293 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-near===
====near=5, t=20で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-near5t20-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.333125 
0.471331 
0.00589164 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-m===
====m=1, t=20で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m1t20-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.800937 
0.399295 
0.00499119 
</td>
</tr>
</table>

====m=2, t=50で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m2t50-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
255 
19.1695 
47.8459 
0.598074 
</td>
</tr>
</table>

====m=2, t=50, v=255 で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m2t50v255-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>50 
255 
234.047 
51.6961 
0.646201 
</td>
</tr>
</table>

====m=3, t=50で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m3t50-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
50 
1.97797 
7.73614 
0.0967017 
</td>
</tr>
</table>

====m=3, t=50, v=255 で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m3t50v255-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
255 
41.6225 
91.8732 
1.14841 
</td>
</tr>
</table>

====m=16で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m16-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.256719 
0.436823 
0.00546029 
</td>
</tr>
</table>

====m=32で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m32-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.135937 
0.342722 
0.00428403 
</td>
</tr>
</table>

====m=48で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m48-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>1 
1 
1 
0 
0 
</td>
</tr>
</table>

====m=48, p=0.1で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m48p0.1-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.100781 
0.301039 
0.00376299 
</td>
</tr>
</table>

====m=64で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m64-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.0646875 
0.245974 
0.00307467 
</td>
</tr>
</table>

====m=80で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-m80-mrcImageBinalization.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
1 
0.140937 
0.347957 
0.00434946 
</td>
</tr>
</table>