FAQ - 変更履歴

Tacyas: /* コマンド時のエラー */

2016-09-07T03:17:19Z

‎コマンド時のエラー

Kinoshita: /* Q.10. PIONE定義書にブロックコメントを付けることができますか */

2015-03-30T07:47:36Z

‎Q.10. PIONE定義書にブロックコメントを付けることができますか

Kinoshita: /* PIONE */

2015-03-30T07:26:15Z

‎PIONE

Kinoshita: /* PIONE */

2015-03-30T07:06:05Z

‎PIONE

Kinoshita: /* Q.3 ＣＴＦ補正を行うと周辺から縞模様が現れます。 */

2015-03-12T06:52:52Z

‎Q.3 ＣＴＦ補正を行うと周辺から縞模様が現れます。

Kinoshita: /* Q1. ダウンロードのコマンドがよく分かりません。 */

2015-03-12T06:48:17Z

‎Q1. ダウンロードのコマンドがよく分かりません。

Kinoshita: /* フーリエ空間の解析 */

2015-02-23T06:34:32Z

‎フーリエ空間の解析

Kinoshita: /* Q5. 既に記述されているMakefileをベースにPIONE定義書を記述したいのですが、何に気をつけたら良いでしょうか。 */

2015-01-28T02:21:18Z

‎Q5. 既に記述されているMakefileをベースにPIONE定義書を記述したいのですが、何に気をつけたら良いでしょうか。

Kinoshita: /* ３次元再構成 */

2015-01-21T07:25:41Z

‎３次元再構成

Kinoshita: /* Q.4 継承したパッケージがPIONE Webclientで動作しません */

2015-01-21T06:05:23Z

‎Q.4 継承したパッケージがPIONE Webclientで動作しません

@@ 行13: / 行13: @@
 == コマンド時のエラー ==
 === Q.1 コマンド実行時にライブラリなどのエラーが発生して動作しません。 ===
-A. [[Eosを最新版に更新]]して[[Eosのリビルド]]を試してみて下さい。あるいはothersも[[ダウンロード#付加的なレポジトリを利用したい場合|ダウンロード]]、更新してみて下さい。Eosでは使用するライブラリはOSの環境毎に使い分けていますので、アップデートしたときやダウンロードしたときはそのままでは正常に動作しない場合があります。<br>
+A. [[Eosを最新版に更新]]して[[Eosのリビルド]]を試してみて下さい。あるいはothersも[[ダウンロード#付加的なレポジトリを利用したい場合|ダウンロード]]、更新してみて下さい。Eosでは使用するライブラリはOSの環境毎に使い分けていますので、アップデートしたときやダウンロードしたときはそのままでは正常に動作しない場合があります。この動作の詳細は、[[MachineIndependent]]等をご参照下さい。<br>
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@@ 行192: / 行192: @@
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-=== Q.10. [[PIONE定義書]]にブロックコメントを付けることができますか ===
+=== Q.10. [[PIONE定義書]]にブロックコメントを付けることはできますか ===
 A. [[PIONE定義書]]の記法にはブロックコメントに相当する構文はありません。エディタによっては文頭に#を付ける機能もありますので、そちらをご利用下さい。あるいはifなどの条件分岐を使用する方法もあります。（参照：[[PIONEチュートリアル#デバッグのための条件文]]）<br>
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@@ 行190: / 行190: @@
 === Q.9. [[PIONE定義書]]のAction内でechoしても標準出力されません。 ===
 A. [[PIONE]]は入力からActionを実行し出力を得る仕組みで、入出力の有無と時間のみを基準に処理を行うのみなので、Action内で何が実行されているかは関与しません。それ故にAction処理内部でのそのままではecho処理でターミナル上に標準出力することはできません。ログとして閲覧・記録する場合はファイルに書き込んで、Mainルールまで出力するようにして下さい。<br>
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@@ 行186: / 行186: @@
 === Q8. [[pione-client]]実行時に"info ERROR: Outputs of rule 'Main' in package &Anonymous are invalid: ... "といったエラーが発生します。 ===
 A. Mainルールでoutputに記述したファイルのいずれかが作成されていない可能性があります。[[PIONE定義書]]の構文を確認してみて下さい。<br>
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@@ 行76: / 行76: @@
 A. デジタル画像では、画像が繰り返していると考えるべきであることから生じています。周辺の濃さが左右、上下で異なる場合に、如実に表れます。<br>
-これを無くすためには、Padding([[mrcImagePad]])/Windowing([[mrcImageWindowing]])/Floating([[mrcImagePad]]で可能)といった前処理を行うことで最小限に抑えることが出来ます。<br>
+これを無くすためには、Padding([[mrcImagePad]])/Windowing([[mrcImageWindowing]])/Floating([[mrcImageFloating]]または[[mrcImagePad]]で可能)といった前処理を行うことで最小限に抑えることが出来ます。<br>
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@@ 行4: / 行4: @@
 == ダウンロード・インストール・更新 ==
 === Q1. ダウンロードのコマンドがよく分かりません。 ===
-A. 基本的には[[ダウンロード]]の操作の内いずれでも可能です。gitが使用できる（git --versionで確認できる）環境の場合は例えば[[ダウンロード#全てのデータを一括でダウンロードしたい場合(makeコマンドを使用)]]の方法、そうでない場合は[[ダウンロード#直接ダウンロードしたい方、開発環境は必要なく、実行だけを行い方]]の方法でダウンロードしてみてはどうでしょうか。<br>
+A. 基本的には[[ダウンロード]]の操作の内いずれでも可能です。gitが使用できる（git --versionで確認できる）環境の場合は例えば[[ダウンロード#全てのデータを一括でダウンロードしたい場合(makeコマンドを使用)]]の方法、そうでない場合は[[ダウンロード#直接ダウンロードしたい方、開発環境は必要なく、実行だけを行いたい方]]の方法でダウンロードしてみてはどうでしょうか。<br>
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@@ 行114: / 行114: @@
 === Q.1 フーリエ空間のパワースペクトラムの値を出したいのですが、どんなコマンドがありますか？ ===
-A. [[mrcFFTInfo]]というコマンドがあり、半径毎の平均値や和などを出すことが出来ます。これ以外に、[[mrcFFTShellInfo]]という設定したShell(Rmin<R<Rmax)の平均強度やパワーを出すことができるツールもあります。<br>
+A. [[mrcFFTInfo]]というコマンドがあり、R毎の平均値や和などを出すことが出来ます。これ以外に、[[mrcFFTShellInfo]]という設定したShell(Rmin<R<Rmax)の平均強度やパワーを出すことができるツールもあります。<br>
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@@ 行170: / 行170: @@
 === Q5. 既に記述されている[[Makefile]]をベースに[[PIONE定義書]]を記述したいのですが、何に気をつけたら良いでしょうか。 ===
-A. まず、[[Makefile]]と[[PIONE定義書]]を見てそれぞれの違いを確認してみましょう。特に入力ファイルから出力ファイルを作成する一つのルーチンをそれぞれどのように書いているかに注目します。それを踏まえて、[[Makefile]]のmake allから最初に実行しているコマンドの書き換えから試してみて下さい。また、内部の処理はどちらも基本的には[[シェルスクリプト]]ですが、[[Makefile]]には[[Makefile#Makefile作成での注意点|シェルスクリプトと異なる点]]もありますので、注意して下さい。特にif文やfor文などで使用している\はあっても動作しますが、デバッグのために途中でコメントアウトできるようにしておいて方が良いので、消しておくことをお薦めします。<br>
+A. まず、[[Makefile]]と[[PIONE定義書]]を見てそれぞれの違いを確認してみましょう。特に入力ファイルから出力ファイルを作成する一つのルーチンをそれぞれどのように書いているかに注目します。それを踏まえて、[[Makefile]]のmake allから最初に実行しているコマンドの書き換えから試してみて下さい。また、内部の処理はどちらも基本的には[[シェルスクリプト]]ですが、[[Makefile]]には[[Makefile#Makefile作成での注意点|シェルスクリプトと異なる点]]もありますので、注意して下さい。特にif文やfor文などで使用している\はあっても動作しますが、デバッグのために途中でコメントアウトできるようにしておいた方が良いので、消しておくことをお薦めします。<br>
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	A. 再構成する前に使用した角度情報(-Iの入力ファイル)が偏っていないでしょうか。Makefileで実行した場合は.3dlstファイルが角度情報となっていますので、確認してみましょう。角度情報が偏っている場合は[[#Q.1 決定された投影角がある方向に偏ってしまいます。]]を参照。<br>		A. 再構成する前に使用した角度情報(-Iの入力ファイル)が偏っていないでしょうか。Makefileで実行した場合は.3dlstファイルが角度情報となっていますので、確認してみましょう。角度情報が偏っている場合は[[#Q.1 決定された投影角がある方向に偏ってしまいます。]]を参照。<br>
		+	<br>
		+
		+	=== Q.2 ３次元再構成後のファイルを拡大・縮小するコマンドはありますか。 ===
		+	A. [[mrcImageSamplingUnitChange]]を使用すると、２Dあるいは３D画像ファイルの拡大・縮小ができます。<br>
	<br>		<br>

@@ 行210: / 行210: @@
 === Q.4 継承したパッケージが[[PIONE Webclient]]で動作しません ===
-A1. パッケージの継承は現在、[[PIONE Webclinet]]には未対応です。<br>
+A1. パッケージの継承は現在、[[PIONE Webclient]]には未対応です。<br>
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