LoGピッキングのSTARファイル - 変更履歴

Kttn: /* 画像ごとのSTARファイル */

2019-05-21T05:07:33Z

‎画像ごとのSTARファイル

Kttn: /* 画像ごとのSTARファイル */

2019-05-21T05:07:03Z

‎画像ごとのSTARファイル

Kttn: /* 画像ごとのSTARファイル */

2019-05-21T05:06:21Z

‎画像ごとのSTARファイル

Kttn: ページの作成:「== 画像ごとのSTARファイル == AutoPick/LoG_based/Movies/に、各画像ごとにピッキングした座標などを記録したSTARファイルが生成されま...」

2019-05-21T05:05:23Z

ページの作成:「== 画像ごとのSTARファイル == AutoPick/LoG_based/Movies/に、各画像ごとにピッキングした座標などを記録したSTARファイルが生成されま...」

新規ページ

== 画像ごとのSTARファイル ==
AutoPick/LoG_based/Movies/に、各画像ごとにピッキングした座標などを記録したSTARファイルが生成されます。

20170629_00021_frameImage_autopick.starを例にとってみます。

<pre>
# RELION; version 3.0.5

data_

loop_
_rlnCoordinateX #1
_rlnCoordinateY #2
_rlnAutopickFigureOfMerit #3
_rlnClassNumber #4
_rlnAnglePsi #5
3555.794139 406.376473 0.662536 0 0.000000
3600.947080 485.394120 0.193001 0 0.000000
（以下略）
</pre>

ピッキングされた単粒子の個数分だけレコードがあります。

各ラベル名の説明を以下にまとめました。

{| class="wikitable" style="width:100%"
|+ラベル名一覧
! style="width:20%" | ラベル名
! 説明
|-
! _rlnCoordinateX
| ピッキングした座標のx座標[pixel]
|-
! _rlnCoordinateY
| ピッキングした座標のy座標[pixel]
|-
! _rlnAutopickFigureOfMerit
| 自動ピッキングのFOM値。（※要確認：FOM値とは具体的には何なのか？）
|-
! _rlnClassNumber
| クラス分類をした際に割り当てられる値。最もコンフィデンスの高いクラスの番号が割り当てられる。LoGピッキング時点ではクラス分類を行なっていないので全て0
|-
! _rlnAnglePsi
| 3番目のオイラー角ψ（または面内回転）の値[度]。LoGピッキングの時点では全て0.0
|}

@@ 行40: / 行40: @@
 |-
 | _rlnClassNumber
-| クラス分類をした際に割り当てられる値。最もコンフィデンスの高いクラスの番号が割り当てられる。LoGピッキング時点ではクラス分類を行なっていないので全て0
+| クラス分類をした際に割り当てられる値。最も所属確率の高いクラスの番号が割り当てられる。LoGピッキング時点ではクラス分類を行なっていないので全て0
 |-
 | _rlnAnglePsi
 | 3番目のオイラー角ψ（または面内回転）の値[度]。LoGピッキングの時点では角度推定を行っていないため全て0.0
 |}

@@ 行43: / 行43: @@
 |-
 | _rlnAnglePsi
-| 3番目のオイラー角ψ（または面内回転）の値[度]。LoGピッキングの時点では全て0.0
+| 3番目のオイラー角ψ（または面内回転）の値[度]。LoGピッキングの時点では角度推定を行っていないため全て0.0
 |}

@@ 行30: / 行30: @@
 ! 説明
 |-
-! _rlnCoordinateX
+| _rlnCoordinateX
 | ピッキングした座標のx座標[pixel]
 |-
-! _rlnCoordinateY
+| _rlnCoordinateY
 | ピッキングした座標のy座標[pixel]
 |-
-! _rlnAutopickFigureOfMerit
+| _rlnAutopickFigureOfMerit
 | 自動ピッキングのFOM値。（※要確認：FOM値とは具体的には何なのか？）
 |-
-! _rlnClassNumber
+| _rlnClassNumber
 | クラス分類をした際に割り当てられる値。最もコンフィデンスの高いクラスの番号が割り当てられる。LoGピッキング時点ではクラス分類を行なっていないので全て0
 |-
-! _rlnAnglePsi
+| _rlnAnglePsi
 | 3番目のオイラー角ψ（または面内回転）の値[度]。LoGピッキングの時点では全て0.0
 |}