MrcImage.h - 変更履歴

Admin: /* メンバ */

2013-04-28T20:39:19Z

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Admin: /* メンバ */

2013-04-28T20:34:34Z

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Admin: ページの作成：「'''mrcImage.h'''は、mrcImage型の画像を取り扱うための標準APIです。 == クラス名（構造体） ==

 mrcImage   |- mrcImageHeader (画像の情...」

2012-10-20T22:27:53Z

ページの作成：「'''mrcImage.h'''は、mrcImage型の画像を取り扱うための標準APIです。 == クラス名（構造体） == <pre> mrcImage |- mrcImageHeader (画像の情...」

新規ページ

'''mrcImage.h'''は、mrcImage型の画像を取り扱うための標準APIです。

== クラス名（構造体） ==
<pre>
mrcImage
|- mrcImageHeader (画像の情報)
|- mrcImageTailer (画像の付加的な情報)
　|- Image (画像)
</pre>

=== メンバ ===
<pre>
typedef struct mrcImage {
mrcImageHeader Header;
mrcImageParaTypeInteger BytePerImage;
mrcImageParaTypeInteger BytePerBand;
mrcImageParaTypeInteger BandPerPixel;
mrcImageParaTypeInteger PixelPerImage;
mrcStatusType status;
char* Image;
unsigned char* ImageCharImage;
unsigned short* ImageShortImage;
unsigned long* ImageLongImage;
float* ImageFloatImage;
double* ImageDoubleImage;
mrcImageTailer* Tailer;
mrcImageParaTypeInteger numTailer;

/* Swap Bytes */
mrcImageParaTypeInteger flagByteSwap;

/* flag CCP4-2000 */
mrcImageParaTypeInteger flagCCP4;
mrcImageParaTypeInteger ImageOffset;
mrcImageSymmetryOperator* SymmetryOperator;
} mrcImage;
</pre>

<pre>
/* Image Header */
typedef union mrcImageHeader {
unsigned char All[MRC_HEADER];
mrcImageParaTypeInteger Int[MRC_HEADER/4];
mrcImageParaTypeReal Real[MRC_HEADER/4];
_mrcImageHeader Cont; /* Conventional Header */
_mrcImageHeaderCCP4 ContCCP4; /* Current Header */
} mrcImageHeader;

typedef struct _mrcImageHeader {
mrcImageParaTypeIntegerCoord N; /* Data Numbers */
mrcImageMode Mode; /* Data Type */
mrcImageParaTypeIntegerCoord StartN; /* First in map */
mrcImageParaTypeIntegerCoord M; /* Number of Intervals */
mrcImageParaTypeRealCoord Length; /* Cell Dimensions : Angstrom */
mrcImageParaTypeReal Alpha; /* Cell Angle : Degree */
mrcImageParaTypeReal Beta;
mrcImageParaTypeReal Gamma;
mrcImageParaTypeInteger MAPC; /* Which Axis Corresponds to Columns */
mrcImageParaTypeInteger MAPR; /* Which Axis Corresponds to Rows */
mrcImageParaTypeInteger MAPS; /* Which Axis Corresponds to Sections */
mrcImageParaTypeReal AMin; /* Minimum Density Value */
mrcImageParaTypeReal AMax; /* Maximum Density Value */
mrcImageParaTypeReal AMean; /* Mean Density Value */
mrcImageParaTypeInteger ISPG; /* Space Group */
mrcImageParaTypeInteger NSYMBT; /* Number of bytes */
mrcImageParaTypeReal EXTRA[MRC_MAX_EXTRA]; /* Extra, user defined storage space */
mrcImageParaTypeReal OriginX;
mrcImageParaTypeReal OriginY;
mrcImageParaTypeInteger LabelN;
char Label[MRC_MAX_LABEL_N][MRC_MAX_LABEL_LEN];
} _mrcImageHeader;

/* For CCP4 2000 : Current New */
typedef char mrcImageSymmetryOperator;

typedef struct _mrcImageHeaderCCP4 {
mrcImageParaTypeIntegerCoord N; /* Data Numbers */
mrcImageMode Mode; /* Data Type */
mrcImageParaTypeIntegerCoord StartN; /* First in map */
mrcImageParaTypeIntegerCoord NI; /* Number of Intervals */
mrcImageParaTypeRealCoord Length; /* Cell Dimensions : Angstrom */
mrcImageParaTypeReal Alpha; /* Cell Angle : Degree */
mrcImageParaTypeReal Beta;
mrcImageParaTypeReal Gamma;
mrcImageParaTypeInteger MAPC; /* Which Axis Corresponds to Columns */
mrcImageParaTypeInteger MAPR; /* Which Axis Corresponds to Rows */
mrcImageParaTypeInteger MAPS; /* Which Axis Corresponds to Sections */
mrcImageParaTypeReal AMin; /* Minimum Density Value */
mrcImageParaTypeReal AMax; /* Maximum Density Value */
mrcImageParaTypeReal AMean; /* Mean Density Value */
mrcImageParaTypeInteger ISPG; /* Space Group */
mrcImageParaTypeInteger NSYMBT; /* Number of bytes used for storing symmetry operators */
mrcImageParaTypeInteger LSKFLG; /* Flag for Skew transformation */
mrcImageParaTypeReal SKWMAT[9]; /* Skew matrix S */
mrcImageParaTypeReal SKWTRN[3]; /* Skew translation */
mrcImageParaTypeReal EXTRA[MRC_MAX_EXTRA_CCP4]; /* Extra, user defined storage space */
mrcImageParaTypeCharacter MAP[4];
mrcImageParaTypeInteger ARCHST;
mrcImageParaTypeReal ARMS;
mrcImageParaTypeInteger LabelN;
char Label[MRC_MAX_LABEL_N][MRC_MAX_LABEL_LEN];
} _mrcImageHeaderCCP4;
</pre>

<pre>
/*
Tailer
*/
/* constant begin */
#define mrcImageTailerMode2DProjection 0
/* constant end */

/* struct begin */
typedef struct _mrcImageTailer {
char Code[4];
mrcImageParaTypeInteger Mode;
char EulerAngleMode[4];
mrcImageParaTypeReal Rot1;
mrcImageParaTypeReal Rot2;
mrcImageParaTypeReal Rot3;
mrcImageParaTypeInteger Mirror;
} _mrcImageTailer;

typedef union mrcImageTailer {
unsigned char All[MRC_TAILER];
mrcImageParaTypeInteger Int[MRC_TAILER/4];
mrcImageParaTypeReal Real[MRC_TAILER/4];
_mrcImageTailer Cont;
} mrcImageTailer;

</pre>

== メソッド ==

@@ 行12: / 行12: @@
 <pre>
 typedef struct mrcImage {
      mrcImageHeader          Header;
      mrcImageParaTypeInteger BytePerImage;
@@ 行18: / 行19: @@
      mrcImageParaTypeInteger PixelPerImage;
      mrcStatusType           status;
      char*           Image;
      unsigned char*  ImageCharImage;
@@ 行24: / 行27: @@
      float*          ImageFloatImage;
      double*         ImageDoubleImage;
      mrcImageTailer*         Tailer;
      mrcImageParaTypeInteger numTailer;
@@ 行37: / 行42: @@
 </pre>
 <pre>
@@ 行47: / 行53: @@
    _mrcImageHeaderCCP4     ContCCP4;             /* Current Header */
 } mrcImageHeader;
 typedef struct _mrcImageHeader {
      mrcImageParaTypeIntegerCoord        N;      /* Data Numbers */
@@ 行74: / 行84: @@
 CCP4のフォーマットが2000年に正式に変更になったことに併せて、そのフォーマットに対応しました。以前のものと共用体によりいずれのフォーマットにも一端対応しています。
 <pre>

@@ 行71: / 行71: @@
      char                                Label[MRC_MAX_LABEL_N][MRC_MAX_LABEL_LEN];
 } _mrcImageHeader;
 /* For CCP4 2000 : Current New */
 typedef char mrcImageSymmetryOperator;
@@ 行104: / 行108: @@
 </pre>
 <pre>