WITs-CLEM チュートリアル - 変更履歴

Honda: /* 画像合成 */

2019-07-26T07:11:22Z

‎画像合成

2019年7月12日 (金) 08:25にHondaによる

2019-07-12T08:25:23Z

2019年7月5日 (金) 08:44にHondaによる

2019-07-05T08:44:08Z

2019年6月28日 (金) 08:56にHondaによる

2019-06-28T08:56:04Z

Honda: /* 画像比較および画像合成 */

2019-06-28T06:54:19Z

‎画像比較および画像合成

Honda: /* 画像表示 */

2019-06-28T05:17:56Z

‎画像表示

Honda: /* 画像表示 */

2019-06-28T04:56:51Z

‎画像表示

2019年6月28日 (金) 04:30にHondaによる

2019-06-28T04:30:34Z

Honda: /* 座標取得 */

2019-06-21T08:40:04Z

‎座標取得

Honda: /* 座標取得 */

2019-06-21T08:37:50Z

‎座標取得

@@ 行29: / 行29: @@
 #Display3の<code>Apply</code> ボタンをクリック
 <br><br><br><br><br><br><br><br><br><br><br><br>
 ====座標取得====

@@ 行99: / 行99: @@
 ----
 ===座標計算===
-::現在はGUIのみで具体的な機能は実装されていない
+::＊現在はGUIのみで具体的な機能は実装されていない
 ====蛍光顕微鏡像と電子顕微鏡像から座標計算====
 ----

@@ 行1: / 行1: @@
 ===画像比較および画像合成===
-このシステムは相関顕微鏡法を用いるために複数の画像を色変更や画像合成、またさらに画像から座標を取得したり、システム側から電子顕微鏡の操作をするためのシステムです。
+相関顕微鏡法を用いるために複数の画像を色変更や画像合成を行います。
 <br><br>
 ====画像表示====
@@ 行49: / 行49: @@
 ブラウザのページから電子顕微鏡を操作するチュートリアルです。
 ====電子顕微鏡の情報入力====
 [[File:inputEM.png|512px|right]]
 電子顕微鏡操作のために必要なパラメータの入力
@@ 行57: / 行58: @@
 #:electron microscope name（任意項目）：電子顕微鏡の名前
 #<code>access</code>ボタンをクリック
-<br><br><br>
+<br>
 ====操作画面====
 [[File:em.png|512px|right]]
 実際にブラウザから電子顕微鏡を操作する。
 :'''Setting'''
 ::imaze size：画像の大きさ(full,half,quarter)
-::binning：
+::binning：ビニング(1,2,4)
-::exptime：
+::exptime：露光時間(1,0.25,0.07)
 :'''Stage Control'''
-::moving distance：
+::moving distance：移動幅
-::move x：
+::move x：x軸方向への平行移動
-::move y：
+::move y：y軸方向への平行移動
-::move(keep magnificance)：
+::move z (keep magnificance)：z軸方向への平行移動（倍率を保つ）
 ::change current(keep stage)：
 ::Current lenz：
-::spot size：
+::spot size：スポットサイズ指定
-::magnification absolute value：
+::magnification absolute value：倍率設定（絶対値）
-::magnification relative value：
+::magnification relative value：倍率設定（相対値）
-:'''Take photol'''
+:'''Take photo'''
 ::写真をとる
 :'''Save photo'''
@@ 行82: / 行84: @@
 :'''Electron Microscopy Condition'''
 ::電子顕微鏡の状態をファイル保存
-<table border = 1>
+::<table border = 1>
-<tr><td>TEM</td></tr>
+::<tr><td>TEM</td><td>電子顕微鏡の名前(前ページのElectron microscopy name)</td></tr>
-<tr><td>Position</td><td></td></tr>
+::<tr><td>Position</td><td>x,y,zの座標を表示</td></tr>
-<tr><td>SpotSizeIndex</td><td></td></tr>
+::<tr><td>SpotSizeIndex</td><td>スポットサイズ</td></tr>
-<tr><td>MagIndex</td><td></td></tr>
+::<tr><td>MagIndex</td><td>倍率</td></tr>
-<tr><td>Obj</td><td></td></tr>
+::<tr><td>Obj</td><td></td></tr>
-<tr><td>BeamTiltX</td><td></td></tr>
+::<tr><td>BeamTiltX</td><td></td></tr>
-<tr><td>BeamTiltY</td><td></td></tr>
+::<tr><td>BeamTiltY</td><td></td></tr>
-<tr><td>Speed</td><td></td></tr>
+::<tr><td>Speed</td><td></td></tr>
-</table>
+::</table>

←前の版		2019年6月28日 (金) 08:56時点における版
行43:		行43:
	#座標リスト(Coordinate list)の上部にあるUploadの<code>ファイルを選択</code> をクリック		#座標リスト(Coordinate list)の上部にあるUploadの<code>ファイルを選択</code> をクリック
	#フォーマットに合うテキストファイルを選択		#フォーマットに合うテキストファイルを選択
		+	<br><br><br><br><br><br><br><br><br><br><br>
		+	----
		+	----
		+	===電子顕微鏡操作===
		+	ブラウザのページから電子顕微鏡を操作するチュートリアルです。
		+	====電子顕微鏡の情報入力====
		+	[[File:inputEM.png\|512px\|right]]
		+	電子顕微鏡操作のために必要なパラメータの入力
		+	#それぞれのフォームに入力・選択をする
		+	#:IP Address：IPアドレスを入力
		+	#:port number：ポート番号を入力
		+	#:manufacturer：電子顕微鏡の製造メーカーを選択
		+	#:electron microscope name（任意項目）：電子顕微鏡の名前
		+	#<code>access</code>ボタンをクリック
		+	<br><br><br>
		+
		+	====操作画面====
		+	[[File:em.png\|512px\|right]]
		+	実際にブラウザから電子顕微鏡を操作する。
		+	:'''Setting'''
		+	::imaze size：画像の大きさ(full,half,quarter)
		+	::binning：
		+	::exptime：
		+	:'''Stage Control'''
		+	::moving distance：
		+	::move x：
		+	::move y：
		+	::move(keep magnificance)：
		+	::change current(keep stage)：
		+	::Current lenz：
		+	::spot size：
		+	::magnification absolute value：
		+	::magnification relative value：
		+	:'''Take photol'''
		+	::写真をとる
		+	:'''Save photo'''
		+	::写真を保存
		+	:'''Electron Microscopy Condition'''
		+	::電子顕微鏡の状態をファイル保存
		+	<table border = 1>
		+	<tr><td>TEM</td></tr>
		+	<tr><td>Position</td><td></td></tr>
		+	<tr><td>SpotSizeIndex</td><td></td></tr>
		+	<tr><td>MagIndex</td><td></td></tr>
		+	<tr><td>Obj</td><td></td></tr>
		+	<tr><td>BeamTiltX</td><td></td></tr>
		+	<tr><td>BeamTiltY</td><td></td></tr>
		+	<tr><td>Speed</td><td></td></tr>
		+	</table>

@@ 行15: / 行15: @@
 :アップロードした画像はThumbnailsに表示され、画像をクリックすることでDisplay2に表示できる。また、Display1、2において画像の拡大縮小(Scaling)、回転(Rotation)、平行移動(Move x, Move y)が行える。
-[[ファイル:d1d2.png|512px|center]]<br>
+[[ファイル:d1d2.png|512px|left]]<br>
-−
-[[ファイル:thumbnail.png|512px|center]]
 ====画像合成====
 ----
 各画像の色を変更する<br>
 #<code>Create Table</code> ボタンをクリックして、Color Tableに行を生成
 #各画像において変更前の色と変更後の色を指定
@@ 行27: / 行28: @@
 #<code>Make BE</code> ボタンをクリック（下部のBrend Elementsに画像のプレビューが表示される）
 #Display3の<code>Apply</code> ボタンをクリック
-<br>
+<br><br><br><br><br><br><br><br><br><br><br><br>
 ====座標取得====
 ----
 画像から座標取得を取得する
 #'''画像表示'''と同様にしてDisplayに画像を表示させる。
 #length of pixelに1pxの大きさを入力

@@ 行20: / 行20: @@
 #<code>Create Table</code> ボタンをクリックして、Color Tableに行を生成
 #各画像において変更前の色と変更後の色を指定
 #<code>Make BE</code> ボタンをクリック（下部のBrend Elementsに画像のプレビューが表示される）
 #Display3の<code>Apply</code> ボタンをクリック
@@ 行35: / 行36: @@
 ファイルから座標リストに座標を反映
 #座標リスト(Coordinate list)の上部にあるUploadの<code>ファイルを選択</code> をクリック
-#フォーマットにあったテキストファイルを選択
+#フォーマットに合うテキストファイルを選択

←前の版		2019年6月21日 (金) 08:40時点における版
行33:		行33:
	#座標リスト(Coordinate list)の下部にあるDownloadにファイル名を入力		#座標リスト(Coordinate list)の下部にあるDownloadにファイル名を入力
	#<code>Download</code> ボタンをクリックでダウンロードできる（フォーマットはcsv、starのどちらか）		#<code>Download</code> ボタンをクリックでダウンロードできる（フォーマットはcsv、starのどちらか）
		+	ファイルから座標リストに座標を反映
		+	#座標リスト(Coordinate list)の上部にあるUploadの<code>ファイルを選択</code> をクリック
		+	#フォーマットにあったテキストファイルを選択

@@ 行30: / 行30: @@
 #length of pixelに1pxの大きさを入力
 #マウスの左クリックで座標を取得する。<br>
-:(補足)
+取得した座標をローカルに保存
-:取得した座標は座標リスト(Coordinate list)の下部にあるDownloadにファイル名を入力<code>Download</code> ボタンをクリックでダウンロードできる（フォーマットはcsv、starのどちらか）
+#座標リスト(Coordinate list)の下部にあるDownloadにファイル名を入力