mrcImageAutoRotationCorrelation3D - 変更履歴

Kinoshita: /* メインオプション */

2014-07-17T01:21:00Z

‎メインオプション

2013-12-20T00:03:28Z

2013-12-19T06:56:47Z

2013-12-10T02:20:31Z

2013-12-03T23:45:28Z

2013-12-03T08:33:19Z

2013-12-03T06:01:38Z

2013-11-25T08:01:58Z

2013-06-26T20:53:45Z

‎実行例

2013-06-26T20:53:18Z

‎実行例

@@ 行73: / 行73: @@
 				<td>-Xrange</td>
 				<td>選択</td>
-				<td>入力: z: min max: [pixel]</td>
+				<td>入力: x: min max: [pixel]</td>
 				<td>0 0(設定しなければ、Ｘ方向の全範囲)</td>
 			</tr>
@@ 行85: / 行85: @@
 				<td>-Zrange</td>
 				<td>選択</td>
-				<td>入力: x: min max: [pixel]</td>
+				<td>入力: z: min max: [pixel]</td>
 				<td>0 0(設定しなければ、Z方向の全範囲)</td>
 			</tr>

@@ 行208: / 行208: @@
-===[[Media:.mrc | 入力ファイル]]の画像===
+===[[Media:Input-ThickFilaments3-P.mrc | 入力ファイル]]の画像===
 	<table>
 		<tr>
@@ 行227: / 行227: @@
 	</table>
-===[[Media:.mrc | 参照ファイル]]の画像===
+===[[Media:Input-ThickFilaments4-P.mrc | 参照ファイル]]の画像===
 	<table>
 		<tr>

@@ 行122: / 行122: @@
 ===モードの詳細===
 ==== 回転のモード:  -MR ====
 		<table border="1">
@@ 行209: / 行208: @@
-===入力ファイルの画像===
+===[[Media:.mrc | 入力ファイル]]の画像===
 	<table>
 		<tr>
@@ 行221: / 行220: @@
 			<td><p align="left">0 (1, 1, 0)<br>
 (19, 1, 0)<br>
-.0111612r>
+.0111612<br>
 .102481<br>
 .00114578<br></p>
@@ 行228: / 行227: @@
 	</table>
-===参照ファイルの画像===
+===[[Media:.mrc | 参照ファイル]]の画像===
 	<table>
 		<tr>

@@ 行781: / 行781: @@
 =====-o のデータ=====
 <pre>
+Max: YOYS 0.000000 0.000000 0.000000 at -23.000000 -28.000000 -20.000000 Cor 0.140128 -0.006095
 </pre>
@@ 行794: / 行796: @@
 				標準誤差<br></p>
 			</td>
-			<td><p align="left"><br>
+			<td><p align="left">0.0256789 (8, 5, 7)<br>
-				<br>
+.178878 (0, 0, 3)<br>
-				<br>
+.0361763<br>
-				<br>
+.0103279<br>
-				<br></p>
+.000300277<br></p>
 			</td>
 		</tr>
@@ 行813: / 行815: @@
 				標準誤差<br></p>
 			</td>
-			<td><p align="left"><br>
+			<td><p align="left">-4.76837e-07 (10, 14, 9)<br>
-				<br>
+(1, 17, 1)<br>
-				<br>
+.0045<br>
-				<br>
+.0669309<br>
-				<br></p>
+.000748311<br></p>
 			</td>
 		</tr>

@@ 行97: / 行97: @@
 				<td>-MR</td>
 				<td>選択</td>
-				<td>入力: 画像回転の取り扱い　1: 平均値で周辺を埋める 0: 楕円体としての回転　+16:　直方体としての回転</td>
+				<td>入力: 画像回転の取り扱い</td>
 				<td>0</td>
 			</tr>
@@ 行103: / 行103: @@
 				<td>-m</td>
 				<td>選択</td>
-				<td>入力: 画像の補間モード: 0: 最近傍、1:１次補間、2:３次補間</td>
+				<td>入力: 画像の補間モード</td>
 				<td>0</td>
 			</tr>
@@ 行119: / 行119: @@
 			<tr>
 				<td>0</td>
-				<td>padding 0 </td>
+				<td>0で周辺を埋める</td>
 			</tr>
 			<tr>
@@ 行175: / 行175: @@
 			<tr>
 				<td>0</td>
-				<td>Nearest </td>
+				<td>最近傍</td>
 			</tr>
 			<tr>
 				<td>1</td>
-				<td>Bilinear</td>
+				<td>１次補間</td>
 			</tr>
 			<tr>
 				<td>2</td>
-				<td>CubicConvolution</td>
+				<td>３次補間</td>
 			</tr>
 		</table>

←前の版	2013年12月10日 (火) 02:20時点における版
(相違点なし)

@@ 行140: / 行140: @@
 参照像test.refに対して、テスト画像test.inを合わせる場合の例。その際の相関値の計算結果がtest.paramに格納され、また、相関マップtest.corも手に入れている。
-相関は、参照像を[[Euler Angle]]([[オイラー角]]、この場合は、YOYSであるので、Ｙ軸回転(Rot1)、Ｘ軸回転(Rot2)、Ｚ軸回転(Rot3)の順に回転)に従って、３つの角度Rot1, Rot2, Rot3で指定した範囲と刻み幅で回転させる。
+相関は、参照像を([[オイラー角]]、この場合は、YOYSであるので、Ｙ軸回転(Rot1)、Ｘ軸回転(Rot2)、Ｚ軸回転(Rot3)の順に回転)に従って、３つの角度Rot1, Rot2, Rot3で指定した範囲と刻み幅で回転させる。
 回転する際に、画像は直方体内全体にあると考え、その外側は平均値でパッドする。相関値は、F*G*でフーリエ空間の積の逆フーリエ変換で求められた相関関数（相関マップ）から求めるが、-Xrange/-Yrange/-Zrangeにより、その移動距離が制限される。

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	== 実行例 ==		== 実行例 ==
		+
		+	参照像test.refに対して、テスト画像test.inを合わせる場合の例。その際の相関値の計算結果がtest.paramに格納され、また、相関マップtest.corも手に入れている。
		+	相関は、参照像を[[Euler Angle]]([[オイラー角]]、この場合は、YOYSであるので、Ｙ軸回転(Rot1)、Ｘ軸回転(Rot2)、Ｚ軸回転(Rot3)の順に回転)に従って、３つの角度Rot1, Rot2, Rot3で指定した範囲と刻み幅で回転させる。
		+	回転する際に、画像は直方体内全体にあると考え、その外側は平均値でパッドする。相関値は、FGでフーリエ空間の積の逆フーリエ変換で求められた相関関数（相関マップ）から求めるが、-Xrange/-Yrange/-Zrangeにより、その移動距離が制限される。
		+
		+	$ mrcImageAutoRotationCorrelation3D -i test.in -r test.ref -o test.param -cor test.cor -fit test.fit -EA YOYS -Rot1 -20 20 10 -Rot2 -30 30 15 -Rot3 -10 10 5 -Xrange -1 1 -Yrange -2 2 -Zrange 0 0 -MR 17 -M 16 -m 2

	== 参考文献 ==		== 参考文献 ==