mrcImageAverage - 変更履歴

2015年1月23日 (金) 05:59にKinoshitaによる

2015-01-23T05:59:49Z

2014年10月29日 (水) 03:44にTacyasによる

2014-10-29T03:44:22Z

2014年6月4日 (水) 06:57にKinoshitaによる

2014-06-04T06:57:55Z

2013年12月18日 (水) 18:17にTacyasによる

2013-12-18T18:17:05Z

2013年12月10日 (火) 04:08にKinoshitaによる

2013-12-10T04:08:13Z

Kinoshita: Kinoshita がページ「MrcImageAverage」を「mrcImageAverage」に移動しました

2013-12-10T01:57:02Z

Kinoshita がページ「MrcImageAverage」を「mrcImageAverage」に移動しました

2013年11月20日 (水) 05:12にKinoshitaによる

2013-11-20T05:12:49Z

2012年9月16日 (日) 03:10にAdminによる

2012-09-16T03:10:55Z

Admin: ページの作成: '''mrcImageAverage'''とは複数の画像から平均画像を生成するEosのコマンドである。単粒子解析のように大量の粒子画像を...

2010-11-10T09:38:49Z

ページの作成: '''mrcImageAverage'''とは複数の画像から平均画像を生成するEosのコマンドである。単粒子解析のように大量の粒子画像を...

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'''mrcImageAverage'''とは複数の画像から[[平均画像]]を生成する[[Eos]]の[[コマンド]]である。[[単粒子解析]]のように大量の[[粒子]]画像を扱う場合、[[平均画像]]の取得は有効である。画像を平均化するとノイズが低減する。これにより、[[角度]]決定の精度が向上し、[[3次元再構成]]したときの[[分解能]]向上が期待される。詳細は[[平均画像|画像の平均化]]を参照のこと。

== オプション一覧 ==
<table border="1">
<tr>
<th>オプション</th>
<th>必須項目/選択項目</th>
<th>説明</th>
<th>デフォルト</th>
</tr>
<tr>
<td>-i</td>
<td>必須</td>
<td>入力ファイル設定</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-o</td>
<td>必須</td>
<td>出力ファイル設定</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-h</td>
<td>選択</td>
<td>ヘルプを表示</td>
<td>　</td>
</tr>
</div>
</table>

== 実行例 ==
===入力ファイルの内容===

1vom-rot0.mrc
1vom-rot1.mrc
1vom-rot2.mrc
1vom-rot3.mrc

====1vom-rot0.mrcの詳細====
<table>
<tr>
<td>[[画像:1vom-rot0-mrcImageAverage.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
73.1421 
6.29881 
20.4635 
0.215447 
</td>
</tr>
</table>

====1vom-rot1.mrcの詳細====
<table>
<tr>
<td>[[画像:1vom-rot1-mrcImageAverage.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
77.0909 
6.29894 
14.3204 
0.223756 
</td>
</tr>
</table>

====1vom-rot2.mrcの詳細====
<table>
<tr>
<td>[[画像:1vom-rot2-mrcImageAverage.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
83.9283 
6.29888 
15.77 
0.246406 
</td>
</tr>
</table>

====1vom-rot3.mrcの詳細====
<table>
<tr>
<td>[[画像:1vom-rot3-mrcImageAverage.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
87.0306 
6.29884 
15.437 
0.241203 
</td>
</tr>
</table>

===実行結果===
<table>
<tr>
<td>[[画像:outdata-mrcImageAverage.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
70.8404 
6.29887 
14.3507 
0.224229 
</td>
</tr>
</table>

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行3:		行3:
	また、３次元画像等で全ての投影方向が手に入っていない画像同士を平均化しようとする場合には、ミッシングエリア等の情報を使って平均化することが有効である。そのために、[[mrc2Dto3D]]で求められるDoubleCounterのファイルなどの画像の再構成に用いられた際に得られる情報を重み(-wにより指定)として利用して再構成することは有効である。DoubleCounterで指定されたファイルは、投影画像のファイル数も反映したものであるため、そのまま平均することができる。		また、３次元画像等で全ての投影方向が手に入っていない画像同士を平均化しようとする場合には、ミッシングエリア等の情報を使って平均化することが有効である。そのために、[[mrc2Dto3D]]で求められるDoubleCounterのファイルなどの画像の再構成に用いられた際に得られる情報を重み(-wにより指定)として利用して再構成することは有効である。DoubleCounterで指定されたファイルは、投影画像のファイル数も反映したものであるため、そのまま平均することができる。

−	平均画像の平均化を単純に行う場合には、[[~~mrcimageNullImage~~]]を使って、全ての点の値を枚数にしたファイルを作り、重みファイルとすることができます。	+	平均画像の平均化を単純に行う場合には、[[mrcImageNullImageCreate]]を使って、全ての点の値を枚数にしたファイルを作り、重みファイルとすることができます。

@@ 行2: / 行2: @@
 　また、３次元画像等で全ての投影方向が手に入っていない画像同士を平均化しようとする場合には、ミッシングエリア等の情報を使って平均化することが有効である。そのために、[[mrc2Dto3D]]で求められるDoubleCounterのファイルなどの画像の再構成に用いられた際に得られる情報を重み(-wにより指定)として利用して再構成することは有効である。DoubleCounterで指定されたファイルは、投影画像のファイル数も反映したものであるため、そのまま平均することができる。
 == オプション一覧 ==
@@ 行20: / 行23: @@
 				<td>-o</td>
 				<td>必須</td>
-				<td>出力ファイル設定（ファイル名）</td>
+				<td>出力ファイル設定（ファイル名）: 入力ファイルのフォーマット</td>
 				<td>NULL</td>
 			</tr>
@@ 行26: / 行29: @@
 				<td>-w</td>
 				<td>選択</td>
-				<td>重みファイル設定（ファイル名のリスト）：mrc2Dto3DによるDoubleCounterファイル</td>
+				<td>重みファイル設定（ファイル名のリスト）：例：mrc2Dto3DによるDoubleCounterファイル</td>
 				<td>NULL</td>
 			</tr>
@@ 行244: / 行247: @@
 ====オプション　-w====
 =====-w (重み付き)を使用して実行=====
 	<table>

@@ 行1: / 行1: @@
 '''mrcImageAverage'''とは複数の画像から[[平均画像]]を生成する[[Eos]]の[[コマンド]]である。[[単粒子解析]]のように大量の[[粒子]]画像を扱う場合、[[平均画像]]の取得は有効である。画像を平均化するとノイズが低減する。これにより、[[角度]]決定の精度が向上し、[[3次元再構成]]したときの[[分解能]]向上が期待される。詳細は[[平均画像|画像の平均化]]を参照のこと。
-　また、３次元画像等で全ての投影方向が手に入っていない画像同士を平均化しようとする場合には、ミッシングエリア等の情報を使って平均化することが有効である。そのために、[[mrc2Dto3D]]で求められるDoubleCounterのファイルなどの画像の再構成に用いられた際に得られる情報を重みとして利用して再構成することは有効である。
+　また、３次元画像等で全ての投影方向が手に入っていない画像同士を平均化しようとする場合には、ミッシングエリア等の情報を使って平均化することが有効である。そのために、[[mrc2Dto3D]]で求められるDoubleCounterのファイルなどの画像の再構成に用いられた際に得られる情報を重み(-wにより指定)として利用して再構成することは有効である。DoubleCounterで指定されたファイルは、投影画像のファイル数も反映したものであるため、そのまま平均することができる。
 == オプション一覧 ==
@@ 行26: / 行26: @@
 				<td>-w</td>
 				<td>選択</td>
-				<td>重みファイル設定（ファイル名のリスト）</td>
+				<td>重みファイル設定（ファイル名のリスト）：mrc2Dto3DによるDoubleCounterファイル</td>
 				<td>NULL</td>
 			</tr>

@@ 行131: / 行131: @@
 	<table>
 		<tr>
-			<td>[[画像:outdata-mrcImageAverage.png]]</td>
+			<td>[[画像:Outdata-mrcImageAverage.png]]</td>
 			<td><p align="left">最小<br>
 				最大<br>

@@ 行45: / 行45: @@
 == 実行例 ==
-===入力ファイルの内容===
+===２次元画像の平均化===
+====入力ファイルの内容====
 vom-rot0.mrc
 vom-rot1.mrc
 vom-rot2.mrc
 vom-rot3.mrc
-====1vom-rot0.mrcの詳細====
+=====1vom-rot0.mrcの詳細=====
 	<table>
 		<tr>
@@ 行71: / 行73: @@
 	</table>
-====1vom-rot1.mrcの詳細====
+=====1vom-rot1.mrcの詳細=====
 	<table>
 		<tr>
@@ 行90: / 行92: @@
 	</table>
-====1vom-rot2.mrcの詳細====
+=====1vom-rot2.mrcの詳細=====
 	<table>
 		<tr>
@@ 行109: / 行111: @@
 	</table>
-====1vom-rot3.mrcの詳細====
+=====1vom-rot3.mrcの詳細=====
 	<table>
 		<tr>
@@ 行128: / 行130: @@
 	</table>
-===実行結果===
+====実行結果====
 	<table>
 		<tr>
@@ 行146: / 行148: @@
 		</tr>
 	</table>
-===実行結果２（重み付き）===
+===３次元画像の平均化===

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(相違点なし)

@@ 行41: / 行41: @@
 				<td>　</td>
 			</tr>
 		</table>