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Kinoshita がページ「MrcImageModelSubfilamentsCreate」を「mrcImageModelSubfilamentsCreate」に移動しました

Kinoshita: ページの作成:「'''mrcImageModelSubfilamentsCreate'''とはフィラメント画像を作るEosのコマンドである。 == オプション一覧 == ===メインオプショ...」

2013-10-29T08:49:56Z

ページの作成:「'''mrcImageModelSubfilamentsCreate'''とはフィラメント画像を作るEosのコマンドである。 == オプション一覧 == ===メインオプショ...」

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'''mrcImageModelSubfilamentsCreate'''とはフィラメント画像を作る[[Eos]]の[[コマンド]]である。

== オプション一覧 ==
===メインオプション===
<table border="1">
<tr>
<th>オプション</th>
<th>必須項目/選択項目</th>
<th>説明</th>
<th>デフォルト</th>
</tr>
<tr>
<td>-i</td>
<td>必須</td>
<td>入力ファイル: [[mrcImage]]</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-o</td>
<td>必須</td>
<td>出力ファイル: [[mrcImage]]</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-nx</td>
<td>選択</td>
<td>Real length = nx * lx</td>
<td>71</td>
</tr>
<tr>
<td>-ny</td>
<td>選択</td>
<td>Real length = ny * ly</td>
<td>71</td>
</tr>
<tr>
<td>-nz</td>
<td>選択</td>
<td>Real length = nz * lz</td>
<td>100</td>
</tr>
<tr>
<td>-lx</td>
<td>選択</td>
<td>ピクセルサイズ[Angstrom]</td>
<td>5.0</td>
</tr>
<tr>
<td>-ly</td>
<td>選択</td>
<td>ピクセルサイズ[Angstrom]</td>
<td>5.0</td>
</tr>
<tr>
<td>-lz</td>
<td>選択</td>
<td>ピクセルサイズ[Angstrom]</td>
<td>5.0</td>
</tr>
<tr>
<td>-position</td>
<td>選択</td>
<td>subfilaments position from center [A]</td>
<td>70</td>
</tr>
<tr>
<td>-n</td>
<td>選択</td>
<td>n-helix</td>
<td>3</td>
</tr>
<tr>
<td>-dphi</td>
<td>選択</td>
<td>回転角度 [degree]</td>
<td>1.395348837</td>
</tr>
<tr>
<td>-sphi</td>
<td>選択</td>
<td>start angle [degree]</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-c</td>
<td>選択</td>
<td>コンフィグファイル設定</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-m</td>
<td>選択</td>
<td>モードを設定</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-h</td>
<td>選択</td>
<td>ヘルプを表示</td>
<td>　</td>
</tr>
</table>
<div>※nx, nyは奇数でなければならない</div>

===モードの詳細===
<table border="1">
<tr>
<th>モード</th>
<th>説明</th>
</tr>
<tr>
<td>0</td>
<td></td>
</tr>
</table>

== 実行例 ==
===入力ファイルの画像===
<table>
<tr>
<td>[[画像:Input-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
59.7531 
2.23188 
10.0142 
0.598462 
</td>
</tr>
</table>

===オプション必須項目のみの場合===
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
10.5248 
0.294771 
1.04365 
0.00146993 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-nx===
====nx=35で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-nx35-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
10.5248 
0.477951 
1.3255 
0.00265899 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-ny===
====ny=19で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-ny19-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
10.5248 
0.682039 
1.56 
0.00424737 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-nz===
====nz=200で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-nz200-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
10.5248 
0.294954 
1.04288 
0.00103863 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-lx===
====lx=2で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-lx2-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
10.4376 
0.320059 
1.0121 
0.0014255 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-ly===
====ly=3で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-ly3-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
10.5572 
0.285985 
0.985501 
0.00138803 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-position===
====position=35で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-position35-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
16.0514 
0.296075 
1.14438 
0.00161181 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-n===
====n=6で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-n6-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
19.1903 
0.589651 
1.5579 
0.00219422 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-dphi===
====dphi=2で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-dphi2-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
10.1935 
0.294779 
1.01354 
0.00142752 
</td>
</tr>
</table>

===オプション　-sphi===
====sphi=90で実行====
<table>
<tr>
<td>[[画像:Outdata-sphi90-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
<td>最小 
最大 
平均値 
標準偏差 
標準誤差 
</td>
<td>0 
11.2071 
0.292996 
1.04152 
0.00146694 
</td>
</tr>
</table>

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mrcImageModelSubfilamentsCreate - 変更履歴

2013年12月12日 (木) 05:51にKinoshitaによる

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