mrcImageSurfaceAreaCalc - 変更履歴

2015年9月16日 (水) 21:32にTacyasによる

2015-09-16T21:32:51Z

Tacyas: /* モードの詳細 */

2015-09-16T21:31:54Z

‎モードの詳細

Tacyas: /* オプション指定なし */

2015-09-16T21:31:35Z

‎オプション指定なし

Tacyas: /* オプション指定なし */

2015-09-16T21:27:41Z

‎オプション指定なし

Tacyas: ページの作成:「'''mrcImageSurfaceAreaCalc'''とは、ラベル化された三次元２値化画像の各ラベル毎の表面積を求める実施するEosのコマンドであ...」

2015-09-16T21:26:32Z

ページの作成:「'''mrcImageSurfaceAreaCalc'''とは、ラベル化された三次元２値化画像の各ラベル毎の表面積を求める実施するEosのコマンドであ...」

新規ページ

'''mrcImageSurfaceAreaCalc'''とは、ラベル化された三次元２値化画像の各ラベル毎の表面積を求める実施する[[Eos]]の[[コマンド]]である。



現在は、表面積は、６，１８，２６近傍を選んで、表面にあるボクセル数をカウントすることで計算しています。

注意：２６近傍などでは、本来ボクセルに対して斜めのものはもう少し表面積を大きく見積もる必要があるかもしれませんが、６近傍では逆に広めに表現されていると考えられます。

== オプション一覧 ==

===メインオプション===


<table border="1">
<div align="left">
<tr>
<th>オプション</th>
<th>必須項目/選択項目</th>
<th>説明</th>
<th>デフォルト</th>
</tr>
<tr>
<td>-i</td>
<td>必須</td>
<td>入力ファイル:２値画像：mrcImage</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-o</td>
<td>必須</td>
<td>出力ファイル：表面積の画像：２値化画像:mrcImage (表面の始点に表面積の値が格納されたファイル)</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-oS</td>
<td>選択</td>
<td>出力ファイル：表面の画像：２値化画像:mrcImage　(表面画像)</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-oSA</td>
<td>選択</td>
<td>出力ファイル：ラベル毎の表面積をリストしたもの（ASCII）</td>
<td>NULL</td>
</tr>
<tr>
<td>-n</td>
<td>選択</td>
<td>近傍を設定：6|18|26 デフォールト0は６が指定</td>
<td>0</td>
</tr>
<tr>
<td>-m</td>
<td>選択</td>
<td>モードを設定</td>
<td>0</td>
</tr>

<tr>
<td>-h</td>
<td>選択</td>
<td>ヘルプを表示</td>
<td>　</td>
</tr>
</div>
</table>

===モードの詳細===


<table border="1">
<div align="left">
<tr>
<th>モード</th>
<th>説明</th>
</tr>
<tr>
<td>0</td>
<td>8ビット</td>
</tr>

</div>
</table>

== 実行例 ==

===オプション指定なし===
$ mrcImageSurfaceAreaCalc -i test.bin -o test.out6 -oS test.surfaceArea6 -oSA test.info6

<div>[[画像:mrcImageSurfaceAreaCalc-test.bin.gif]]</div>
<div>[[画像:mrcImageSurfaceAreaCalc-test.out6.gif]]</div>
<div>[[画像:mrcImageSurfaceAreaCalc-test.outSurface6.gif]]</div>

<pre>
label surfaceArea startx starty startz
000000 0.0000 0 0 0
000001 9337.0000 40 9 0
000002 475.0000 20 18 0
000003 428.0000 45 33 0
000004 9544.0000 21 48 0
000005 3.0000 22 37 1
000006 66.0000 59 44 6
000007 59.0000 13 20 19
000008 2.0000 48 46 41
000009 1.0000 44 45 42
000010 53.0000 27 32 43
000011 114.0000 12 37 52
000012 172.0000 29 24 55
000013 2.0000 38 39 55
000014 54.0000 41 38 57
000015 100.0000 57 33 66
000016 2.0000 30 25 67
000017 3.0000 32 29 68
000018 1.0000 34 28 95
</pre>

@@ 行89: / 行89: @@
   $ mrcImageSurfaceAreaCalc -i test.bin -o test.out6 -oS test.surfaceArea6 -oSA test.info6
 	<div>[[画像:mrcImageSurfaceAreaCalc-test.bin.60.gif]]</div>
 	<div>[[画像:mrcImageSurfaceAreaCalc-test.out6.60.gif]]</div>
 	<div>[[画像:mrcImageSurfaceAreaCalc-test.outSurface6.60.gif]]</div>
 <pre>
 label surfaceArea     startx     starty     startz

@@ 行3: / 行3: @@
 <!--ここには、コマンドの機能に関する記述を行います。-->
-現在は、表面積は、６，１８，２６近傍を選んで、表面にあるボクセル数をカウントすることで計算しています。
+現在は、表面積は、６，１８，２６近傍を選んで、表面にあるボクセル数をカウントすることで計算しています。関連したコマンドとして、[[mrcImageFeatureCalc]]があり、表面積、面積等のラベル毎の情報を撮り出すことが出来ます。
 注意：２６近傍などでは、本来ボクセルに対して斜めのものはもう少し表面積を大きく見積もる必要があるかもしれませんが、６近傍では逆に広めに表現されていると考えられます。

@@ 行77: / 行77: @@
 			<tr>
 				<td>0</td>
-				<td>8ビット</td>
+				<td>デフォールト</td>
 			</tr>
 		</div>
 	</table>
-−
 == 実行例 ==