「統合コマンド」の版間の差分
提供: Eospedia
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PDBファイルを使った場合: [[:Media:Makefile-Ref1.zip]]<br> | PDBファイルを使った場合: [[:Media:Makefile-Ref1.zip]]<br> | ||
| + | *使用方法: [[単粒子解析#球・楕円体を参照像とする場合]](下段)<br> | ||
[[:ファイル:Makefile-Reconstrucion1.zip]]<br> | [[:ファイル:Makefile-Reconstrucion1.zip]]<br> | ||
[[:ファイル:Mediafile-Reconstrucion.zip]]<br> | [[:ファイル:Mediafile-Reconstrucion.zip]]<br> | ||
2014年8月5日 (火) 02:34時点における版
目次
統合コマンド一覧
Eosが提供している統合コマンドの一覧を示します。現在は、ほとんどMakefileもしくはbashで書かれています。少しずつPIONEでの記述も提供します。
画像補正
CTFの補正
単粒子解析
２次元画像の分類（クラスター解析）と平均像の獲得
クラスター解析
実行例1: Media:Makefile-Cluster.zip
- 使用方法: 単粒子解析#クラスター解析(コマンド例は段落末尾に記載)
リファレンスがある場合の３次元再構成
参照像の作成
PCAを使った場合: Media:Makefile-Ref.zip
- 使用方法: 単粒子解析#球・楕円体を参照像とする場合(上段)
PDBファイルを使った場合: Media:Makefile-Ref1.zip
- 使用方法: 単粒子解析#球・楕円体を参照像とする場合(下段)
ファイル:Makefile-Reconstrucion1.zip
ファイル:Mediafile-Reconstrucion.zip
ファイル:Mediafile-Reconstrucion0.zip
ファイル:Mediafile-Reconstrucion1.zip
ファイル:Mediafile-Reconstrucion3.zip
ファイル:Mediafile-Reconstrucion4.zip
ファイル:Makefile-Reconstruction.zip
ファイル:Makefile-Radon.zip
らせん単粒子解析
電子線トモグラフィー
複数領域のROIのある電子線トモグラフィー法
ファイル:Makefile-Tomogram.zip
ファイル:Makefile-Tomogram1.zip
ファイル:Makefile-Tomogram2.zip
ファイル:Makefile-Tomogram3.zip
ファイル:Makefile-Tomogram4.zip
ファイル:Makefile-Tomogram5.zip
ファイル:Makefile-Tomogram6.zip
ファイル:Makefile-Tomogram7.zip
