「mrcImageFourierNeighborCorrelation」の版間の差分

2014年10月14日 (火) 03:04時点における版 (ソースを閲覧) Kinoshita (トーク | 投稿記録) ←古い編集		2014年10月14日 (火) 04:51時点における版 (ソースを閲覧) Kinoshita (トーク | 投稿記録) 新しい編集→
行118:		行118:
	== 実行例 ==		== 実行例 ==
		+	===[[Media:Input-1VOM-N.mrc|入力ファイル]]の画像===
		+	<table>
		+	<tr>
		+	<td><p align="Center">[[画像:Input-1VOM-N.png]]<br>
		+	xy平面<br></p>
		+	</td>
		+	<td><p align="Center">[[画像:Input1-1VOM-N.png]]<br>
		+	yz平面<br></p>
		+	</td>
		+	<td><p align="left">最小<br>
		+	最大<br>
		+	平均値<br>
		+	標準偏差<br>
		+	標準誤差<br></p>
		+	</td>
		+	<td><p align="left">-2390.42 (77, 14, 69)<br>
		+	4374.62 (17, 62, 46)<br>
		+	72.1487<br>
		+	577.82<br>
		+	0.722275<br></p>
		+	</td>
		+	</tr>
		+	</table>
		+	<br>
		+
		+	===オプション必須項目のみの場合===
		+	<pre>
		+	0.000000  0.863711          1
		+	0.012500  0.553876        18
		+	0.025000  0.170684        64
		+	0.037500  0.221808        146
		+	0.050000  0.230874        266
		+	0.062500  0.280359        382
		+	0.075000  0.269777        588
		+	0.087500  0.280955        746
		+	0.100000  0.322332      1002
		+	0.112500  0.249747      1294
		+
		+	-中略-
		+
		+	0.750000  -0.005313      2256
		+	0.762500  0.036957      1688
		+	0.775000  0.021723      1264
		+	0.787500  0.010364        864
		+	0.800000  -0.026498        568
		+	0.812500  -0.009259        312
		+	0.825000  -0.009356        144
		+	0.837500  0.030291        72
		+	0.850000  -0.109028          8
		+	0.862500  0.000000          0
		+	</pre>
		+	<br>

---

2014年10月14日 (火) 04:51時点における版

mrcImageFourierNeighborCorrelationは、フーリエ空間の冗長性を利用した分解能をチェックする為のEosのコマンドです。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage(3D)	NULL
-o	選択	出力ファイル: ASCII(FNC)	stdout
-d	選択	delta(フーリエ空間)	0.0
-C	選択	CentreMode	0
-M	選択	補間モード	0
-FSC	選択	予測したFSCの出力フラグ
-mask	選択	入力ファイル: mrcImage(3D)(Mask for FSC)	NULL
-maskBack	選択	入力ファイル: mrcImage(3D)(Mask for FSC Back)	NULL
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

-Cの詳細

モード	説明
0	中心を画像の中心とする: (Nx/2.0, Ny/2.0, Nz/2.0 )
1	中心を原点(左下端)とする: (0, 0, 0 )
2	中心を画像のStartNとする: (StartNx,StartNy,StartNz)

-Mの詳細

補間モード参照。

-mの詳細

モード	説明
0

実行例

入力ファイルの画像

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-2390.42 (77, 14, 69) 4374.62 (17, 62, 46) 72.1487 577.82 0.722275

オプション必須項目のみの場合

  0.000000   0.863711          1 
  0.012500   0.553876         18 
  0.025000   0.170684         64 
  0.037500   0.221808        146 
  0.050000   0.230874        266 
  0.062500   0.280359        382 
  0.075000   0.269777        588 
  0.087500   0.280955        746 
  0.100000   0.322332       1002 
  0.112500   0.249747       1294 

-中略-

  0.750000  -0.005313       2256 
  0.762500   0.036957       1688 
  0.775000   0.021723       1264 
  0.787500   0.010364        864 
  0.800000  -0.026498        568 
  0.812500  -0.009259        312 
  0.825000  -0.009356        144 
  0.837500   0.030291         72 
  0.850000  -0.109028          8 
  0.862500   0.000000          0