「Cluster(API)」の版間の差分
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typedef struct clusterLogOneRecord clusterLogOneRecord; | typedef struct clusterLogOneRecord clusterLogOneRecord; | ||
struct clusterLogOneRecord { | struct clusterLogOneRecord { | ||
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}; | }; | ||
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| − | + | ==== 管理データ ==== | |
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| + | typedef struct clusterLog2 { | ||
| + | clusterLog2OneRecord* top; | ||
| + | clusterLog2OneRecord* current; | ||
| + | clusterLog2OneRecord* bottom; | ||
| + | } clusterLog2; | ||
| + | ==== ログデータ ==== | ||
| + | ログデータ（ノードのみ）の構造体です。 | ||
typedef struct clusterLog2OneRecord clusterLog2OneRecord; | typedef struct clusterLog2OneRecord clusterLog2OneRecord; | ||
struct clusterLog2OneRecord { | struct clusterLog2OneRecord { | ||
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}; | }; | ||
| − | + | === 樹形図 === | |
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typedef struct clusterTreeInfo clusterTreeInfo; | typedef struct clusterTreeInfo clusterTreeInfo; | ||
struct clusterTreeInfo { | struct clusterTreeInfo { | ||
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== API == | == API == | ||
| − | === | + | === ファイル読み込み === |
| − | + | ファイルからログデータを読み込み、格納されたデータのポインタを返します。 | |
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| + | ==== [[ASCII]]ログ（全体） ==== | ||
| + | 全データ | ||
extern clusterLog* clusterLogReadAll(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode); | extern clusterLog* clusterLogReadAll(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode); | ||
| + | １データ | ||
| + | extern clusterLogOneRecord* clusterLogRead(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode); | ||
| + | |||
| + | ==== [[ASCII]]ログ（ノードのみ） ==== | ||
| + | 全データ | ||
extern clusterLog2OneRecord* clusterLog2Read(clusterLog2* cluster, FILE* fpt, int mode); | extern clusterLog2OneRecord* clusterLog2Read(clusterLog2* cluster, FILE* fpt, int mode); | ||
| + | １データ | ||
extern clusterLog2* clusterLog2ReadAll(clusterLog2* cluster, FILE* fpt, int mode); | extern clusterLog2* clusterLog2ReadAll(clusterLog2* cluster, FILE* fpt, int mode); | ||
| − | + | ||
| + | ==== バイナリログ ==== | ||
| + | 全データ | ||
extern clusterLog* clusterLogReadAllBinary(clusterLog* cluster, char* basename, int mode); | extern clusterLog* clusterLogReadAllBinary(clusterLog* cluster, char* basename, int mode); | ||
| + | １データ | ||
| + | extern clusterLogOneRecord* clusterLogReadBinary(clusterLog* cluster, clusterTypeInteger* prevN, clusterTypeInteger* prevM, char* filename, int mode); | ||
| + | === ファイル書き出し === | ||
extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteAllBinary(clusterLog* cluster, char* basename, int mode); | extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteAllBinary(clusterLog* cluster, char* basename, int mode); | ||
extern clusterLogOneRecord* clusterLogWrite(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode); | extern clusterLogOneRecord* clusterLogWrite(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode); | ||
| + | extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteBinary2(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode); | ||
extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteOneRecord(clusterLogOneRecord* cluster, FILE* fpt, int mode); | extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteOneRecord(clusterLogOneRecord* cluster, FILE* fpt, int mode); | ||
| + | extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteOneRecordBinary2(clusterLogOneRecord* cluster, FILE* fpt, int mode); | ||
extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteAll(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode); | extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteAll(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode); | ||
| + | extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteAllBinary2(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode); | ||
extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteClusterOnly(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode); | extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteClusterOnly(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode); | ||
extern void clusterLogWritePS(clusterLog* cluster, clusterTreeInfo* linfo, FILE* fpt, int mode); | extern void clusterLogWritePS(clusterLog* cluster, clusterTreeInfo* linfo, FILE* fpt, int mode); | ||
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extern clusterLog* clusterLogTransformLog2ToLog(clusterLog2* cluster2, clusterTypeInteger lastNum, int mode); | extern clusterLog* clusterLogTransformLog2ToLog(clusterLog2* cluster2, clusterTypeInteger lastNum, int mode); | ||
| − | === | + | === 初期化 === |
| + | ==== ログ（全体） ==== | ||
extern clusterLog* clusterLogInit(clusterLog * cluster, int mode); | extern clusterLog* clusterLogInit(clusterLog * cluster, int mode); | ||
| − | |||
extern clusterLogOneRecord* clusterLogInitOneRecord(clusterLogOneRecord * cluster, int mode); | extern clusterLogOneRecord* clusterLogInitOneRecord(clusterLogOneRecord * cluster, int mode); | ||
| + | |||
| + | ==== ログ（ノードのみ） ==== | ||
| + | extern clusterLog2* clusterLog2Init(clusterLog2 * cluster, int mode); | ||
extern clusterLog2OneRecord* clusterLog2InitOneRecord(clusterLog2OneRecord * cluster, int mode); | extern clusterLog2OneRecord* clusterLog2InitOneRecord(clusterLog2OneRecord * cluster, int mode); | ||
2015年3月16日 (月) 01:54時点における版
General/Clusterはクラスター解析におけるログのためのAPIです。
目次
定数
バイナリログの読み書きで使用します。
#define CLUSTERLOG_BINARY_FILENAME_FORMAT "%s.%08d.%08d.%08d" #define CLUSTERLOG_BINARY_NO_CALCULATION_VALUE (-9999)
構造体
typedef float clusterTypeReal; typedef short clusterTypeInteger;
ログ（全体）
mrcImageClusterAnalysisのオプション -Logに対応したログデータの構造体です。
管理データ
リスト構造でログデータ（全体）を管理する構造体です。
typedef struct clusterLog {
clusterLogOneRecord* top;
clusterLogOneRecord* current;
clusterLogOneRecord* bottom;
} clusterLog;
ログデータ
ログデータ（全体）の構造体です。
typedef struct clusterLogOneRecord clusterLogOneRecord;
struct clusterLogOneRecord {
/* Information of this log line in the logfile */
clusterTypeInteger N; /* Current N (shrinked array): Definition: N > M */
clusterTypeInteger M; /* Current M : */
clusterTypeInteger prevN; /* prevN: N: the nearest pair in the below layer */
clusterTypeInteger prevM; /* prevM: M: */
clusterTypeReal distance; /* Distance between N and M */
/* Original File Number */
clusterTypeInteger originalN;
clusterTypeInteger originalM;
/* File Number within the below layer */
clusterTypeInteger firstN;
clusterTypeInteger firstM;
clusterLogOneRecord* belowLayerStart;
clusterLogOneRecord* belowLayer;
clusterLogOneRecord* belowLayerEnd;
/* Upper Layer */
clusterLogOneRecord* upperLayer;
/* Below Layer */
clusterLogOneRecord* belowLayerForN;
clusterLogOneRecord* belowLayerForM;
/* Including the below layer */
clusterTypeInteger clusterSize; /* File Number of the cluster */
/* This Layer */
clusterTypeInteger clusterNumber; /* Cluster Numer of this layer */
/* Set the number of the cluster where this log line attributes in a function of clusterLogClusterNumberSet or Set2 */
clusterLogOneRecord* prev; /* previous record */
clusterLogOneRecord* next; /* Next record */
};
ログ（ノードのみ）
mrcImageClusterAnalysisのオプション -Log2に対応したログデータの構造体です。
管理データ
リスト構造でログデータ（ノードのみ）を管理する構造体です。
typedef struct clusterLog2 {
clusterLog2OneRecord* top;
clusterLog2OneRecord* current;
clusterLog2OneRecord* bottom;
} clusterLog2;
ログデータ
ログデータ（ノードのみ）の構造体です。
typedef struct clusterLog2OneRecord clusterLog2OneRecord;
struct clusterLog2OneRecord {
// LogFile Information
clusterTypeInteger N;
clusterTypeInteger M; // N > M: merge N to M
clusterTypeReal distance;
clusterTypeReal linearCorrelation;
// After reading
clusterTypeInteger clusterNumber; // Cluster Number
clusterLog2OneRecord* prev;
clusterLog2OneRecord* next;
};
樹形図
typedef struct clusterTreeInfo clusterTreeInfo;
struct clusterTreeInfo {
clusterTypeReal posX;
clusterTypeReal posY;
clusterTypeReal ShoulderScale;
clusterTypeReal ArmScale;
clusterTypeReal ArmOffset;
clusterTypeInteger flagLog;
clusterTypeInteger flagScaling;
char** In;
char** argv;
clusterTypeReal* InPosY;
clusterTypeReal* InPosX;
clusterTypeInteger argc;
clusterTypeInteger* clusterSize;
clusterTypeInteger* clusterNumber;
clusterTypeInteger currentNo;
clusterTypeInteger flagFPTTreeInfo;
FILE* fptTreeInfo;
};
API
ファイル読み込み
ファイルからログデータを読み込み、格納されたデータのポインタを返します。
ASCIIログ（全体）
全データ
extern clusterLog* clusterLogReadAll(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode);
１データ
extern clusterLogOneRecord* clusterLogRead(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode);
ASCIIログ（ノードのみ）
全データ
extern clusterLog2OneRecord* clusterLog2Read(clusterLog2* cluster, FILE* fpt, int mode);
１データ
extern clusterLog2* clusterLog2ReadAll(clusterLog2* cluster, FILE* fpt, int mode);
バイナリログ
全データ
extern clusterLog* clusterLogReadAllBinary(clusterLog* cluster, char* basename, int mode);
１データ
extern clusterLogOneRecord* clusterLogReadBinary(clusterLog* cluster, clusterTypeInteger* prevN, clusterTypeInteger* prevM, char* filename, int mode);
ファイル書き出し
extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteAllBinary(clusterLog* cluster, char* basename, int mode); extern clusterLogOneRecord* clusterLogWrite(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode); extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteBinary2(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode); extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteOneRecord(clusterLogOneRecord* cluster, FILE* fpt, int mode); extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteOneRecordBinary2(clusterLogOneRecord* cluster, FILE* fpt, int mode); extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteAll(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode); extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteAllBinary2(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode); extern clusterLogOneRecord* clusterLogWriteClusterOnly(clusterLog* cluster, FILE* fpt, int mode); extern void clusterLogWritePS(clusterLog* cluster, clusterTreeInfo* linfo, FILE* fpt, int mode);
clusterLogUtil
extern void clusterLogClusterInformationSet(clusterLog* cluster, clusterTypeInteger lastNum, int mode);
extern void clusterLogClusterNumberSet(clusterLogOneRecord* bottom, clusterTypeInteger lastClusterNum, int mode); extern void clusterLogClusterNumberSetForLog2(clusterLog* cluster, clusterTypeInteger lastClusterNum, int mode); extern void clusterLogClusterNumberSet2(clusterLog* top, clusterTypeInteger firstClusterNum, int mode);
extern clusterLogOneRecord* clusterLogGetDistance(clusterLog* cluster, clusterTypeInteger N, clusterTypeInteger M, clusterTypeInteger clusterNum, clusterTypeReal* data);
extern void clusterLogBelowLayerPointerSet(clusterLog* cluster, int mode); extern clusterLogOneRecord* clusterLogBottomGet(clusterLog* cluster, int mode); extern int clusterLogClusterSizeGet(clusterLogOneRecord* cluster, int mode); extern void clusterLogClusterSizeSet(clusterLog* cluster, int mode); extern void clusterLogBottomSet(clusterLog* cluster, int mode); extern clusterLog* clusterLogTransformLog2ToLog(clusterLog2* cluster2, clusterTypeInteger lastNum, int mode);
初期化
ログ（全体）
extern clusterLog* clusterLogInit(clusterLog * cluster, int mode); extern clusterLogOneRecord* clusterLogInitOneRecord(clusterLogOneRecord * cluster, int mode);
ログ（ノードのみ）
extern clusterLog2* clusterLog2Init(clusterLog2 * cluster, int mode); extern clusterLog2OneRecord* clusterLog2InitOneRecord(clusterLog2OneRecord * cluster, int mode);
