「ctfInfo(API)」の版間の差分

2015年11月18日 (水) 06:22時点における最新版

DataManip/ctfInfoはCTFの推定及びCTF補正のためのAPI です。

定数

モード選択

マスク用

#define ctfInfoModeWithAmplitudeContrast    0x0f
#define ctfInfoModeWithMTF                  0x10
#define ctfInfoModeWithIlluminationAngle    0x20
#define ctfInfoModeWithEnergySpread         0x40
#define ctfInfoModeAbsoluteValue            0x100

モード	マスク部分	説明
ctfInfoModeWithAmplitudeContrast	0x0f	コントラスト補正のモード
ctfInfoModeWithMTF	0x10	MTF積算のフラグ
ctfInfoModeWithIlluminationAngle	0x20	照射角度の考慮のフラグ
ctfInfoModeWithEnergySpread	0x40	エネルギー拡散の考慮のフラグ
ctfInfoModeAbsoluteValue	0x100	絶対値のフラグ

モード値の定義

コントラストモード

ctfInfo->modeにて使用(ctfInfoModeWithAmplitudeContrastでマスクした値に対応)

typedef enum ctfInfoMode {
	ctfInfoModePhaseCTFOnly   = 0,
	ctfInfoModePhaseAndAmpCTF = 1 
} ctfInfoMode;

モード	値	説明
ctfInfoModePhaseCTFOnly	0	位相コントラストだけ
ctfInfoModePhaseAndAmpCTF	1	強度コントラストを加える

envelope関数のモード

ctfInfo->MTFModeにて使用

typedef enum ctfInfoMTFMode {
	ctfInfoMTFModeSingleExp = 0,
	ctfInfoMTFModeSingleLorentzian = 1,
	ctfInfoMTFModeBoth      = 2,
	ctfInfoMTFModeLinear    = 3, 
	ctfInfoMTFModeBothSum   = 4,
	ctfInfoMTFModePolynomial = 5
} ctfInfoMTFMode;

モード	値	説明
ctfInfoMTFModeSingleExp	0	指数関数
ctfInfoMTFModeSingleLorentzian	1	ローレンツ関数
ctfInfoMTFModeBoth	2	指数関数×ローレンツ関数
ctfInfoMTFModeLinear	3	リニア
ctfInfoMTFModeBothSum	4	指数関数+ローレンツ関数
ctfInfoMTFModePolynomial	5	多項式

構造体

分子のエンベロープ関連で使用

typedef struct moleculrEnvelope {
	char* filename; 
	int   nR;
	float* R;
	float* Envelope;
	int    mode;	
} molecularEnvelope;

ctfInfo

ＣＴＦを計算する上で必要なパラメータになります。

電子顕微鏡や照射条件により決まるもの

kV	[kV]	加速電圧（電子線の加速電圧、単位はkV）
Cc	[mm]	色収差係数（単位はmm）
dE		エネルギーの揺らぎ幅（色収差を使った包絡関数の計算に必要）
Cs	[mm]	球面収差係数（単位はmm）
Ain	[mrad]	照射半角（単位はmrad）（球面収差係数やデフォーカスによる包絡関数の計算に必要）(ファイル上ではAiとして表示）

デフォーカスにより決まるもの

defocus	[A]	デフォーカス量(単位はオングストーローム、正がアンダーフォーカス）
flagAstigmatism	Integer	非点を考慮するかどうかのフラグ（０：考慮しない、１：考慮する）
defocus2D float[2]	[A]	デフォーカス量

試料（シグナル）によって決まるもの

I0		シグナル強度
Isignal		シグナル強度
Inoise		ノイズ強度
flagWhiteNoise	Integer	ホワイトノイズ（ＭＴＦにより影響を受ける成分）
WhiteNoise		ノイズ強度
flagWhiteNoiseRasing	Integer	ホワイトノイズのＭＴＦの落ちを考慮するかどうか
WhiteNoiseRasing		MTFによりノイズが崩落する成分

解析の際に利用する量

flagWin	Integer	窓関数をかけるかどうかのフラグ（０：かけない、１：かける）
CutLow	A-1	窓関数の低周波側のエッジ
CutHigh	A-1	窓関数の高周波側のエッジ

各APIの引数として使用する設定

typedef struct ctfInfo {
	float kV;      /* kV */
	float defocus; /* A : Underfocus is plus, while overfocus is minus*/
	float Cc;      /* mm */
	float dE; 
	float Cs;      /* mm */
	float Ain;     /* mrad : Illumination Angle */
	long  flagWin; /* Windowing */ 
	float CutLow;  /* Windowing: CutLow  A-1 */
	float CutHigh; /* Windowing: CutHigh A-1 */

	float I0;      /* Intensity */
	float Isignal; /* Intensity of signal */

	float ratioOfAmpToPhase; /* The ratio of amp to phase */

	float Inoise;  /* Intensity of noise : Isignal*/
	long  flagWhiteNoise;
	float WhiteNoise;  /* Affected by MTF(R) */

	long  flagWhiteNoiseRaising; 	
	float WhiteNoiseRaising; /* WhiteNoise Raising depending upon R */

	float Inoise2; /* Intensity of noise */
	long  flagWhiteNoise2;
	float WhiteNoise2; /* Not Affected by MTF(R)*/

	int   flagAstigmatism;
	float defocus2D[2];      /* A : Normally [0]: Max [1]: Min */
	float defocus0axis;      /* radian : angle of the defocus2D[0]-axis */

	long mode;
	
	long  flagMagnification;	
	float Magnification;

	/* MTF(R): Modulation Transfer Function */ 
	ctfInfoMTFMode MTFMode;
	float BofMTF;  /* Exponential: exp(-B R)   */
	float BofMTF2; /* Lorentzian : 1/(B*B+R*R) */	
	float WeightOfSecondTermForMTF; /* 0 <-> 1 */
	/*for PolynomialExpNoise*//*d = degree*/
	float BofMTFd2;
	float BofMTFd3;
	float BofMTFd4;
	float BofMTFd5;
	float BofMTFd6;

	/* Molecular Envelope: Scattering Factor */
	/* For Gaussian */
	float MolecEnv;                   /* A : */
	/* For Table */
	long  flagMolecEnvTable;
	molecularEnvelope MolecEnvTable;
	/* For Lorentzian */
	float flagElastic;
	float Elastic;
	float ElasticShift;
	float ElasticWidth;
	float ElasticRing;
	float ElasticRingPosition;
	float ElasticRingWidth;

	/* Stage Vibration */
	long  flagVibration;
	long  VibrationMode;
	float BofVibration;

	/* Aliasing and Sampling */
	long flagAliasing;
	float NyquistFrequency;
	long flagSampling; 

	/* Inelastic Signal */
	/* For Gaussian */
	long flagWithInElastic;
	float InElasticGaussian;
	/* For Table */
	long flagWithInElasticTable;
	molecularEnvelope InElasticEnvTable;	
	/* Lorentzian */	
	long flagInElastic;
	float InElastic;
	float InElasticShift;
	float InElasticWidth;
	float InElasticRing;
	float InElasticRingPosition;
	float InElasticRingWidth;
} ctfInfo;

API

スキャッタリング

シグナル(ctfSignalFunctionより)にノイズ(ctfNoiseFunctionより)を加えたときの値を返します。

extern float ctfScatteringFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);

シグナル

シグナルを出力
(ctfFunction, ctfMolecularEnvelopeFunction, ctfMolecularEnvelopeInElasticFunction, ctfVibrationFunction, ctfMTFFunctionを使用)
info->flagAliasing=trueのとき: エイリアシングを加えます。(info->NyquistFrequencyによる)

extern float ctfSignalFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);

上記のシグナルを強度で出力

extern float ctfSignalPowerFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);

分子のエンベロープを算出

info->flagMolecEnvTable=trueのときはlmolecularEnvelopeDataGetを呼び出して、テーブル(info->MolecEnvTable)を元に算出

extern float ctfMolecularEnvelopeFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
extern float ctfMolecularEnvelopeInElasticFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);

ノイズ

ホワイトノイズ(info->WhiteNoise)やMTF(ctfMTFFunctionより)などを掛け合わせて算出したノイズを出力
info->flagAliasing=trueのとき: エイリアシングを加えます。(info->NyquistFrequencyによる)

extern float ctfNoiseFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);

上記のノイズを強度で出力

extern float ctfNoisePowerFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);

ホワイトノイズにinfo->WhiteNoise2を使用して、ノイズを出力

extern float ctfNoise2Function(ctfInfo* info, float R, long mode);

上記のノイズを強度で出力

extern float ctfNoise2PowerFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);

振動関数の算出

Rによる振動関数の値を算出
info->Magnification: Rの倍率

extern float ctfVibrationFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);

info->flagVibration=trueかつinfo->VibrationMode=0のとき: 振動関数Env = exp(-B*B*R*R/2.0)を出力(それ以外の場合は1を出力)

CTFの算出

extern float ctfFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);

RによるCTFの値を算出
電子線の波長: wavelengthOfElectronより算出
コントラスト: info->modeにより算出方法を設定

info->mode(0x0fでマスク)	説明
0	位相コントラストだけ
1	強度コントラストを加える

2Dの場合

X, YからRを求めて引数としてctfFunctionを呼び出す

extern float ctfFunction2D(ctfInfo* info, float X, float Y, long mode);

Envelope関数の算出

extern float ctfEnvelopFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);

Rによるエンベロープ関数の値を算出
wavelengthOfElectronにより電子線の波長を取得
info->flagMagnification=1のとき: info->Magnification(0以外で)をRの倍率として掛ける

info->mode	マスク部分	説明
ctfInfoModeWithMTF	0x10	MTFを積算(ctfMTFFunctionを呼び出す)
ctfInfoModeWithIlluminationAngle	0x20	照射角度(info->Ain)を考慮した値を積算
ctfInfoModeWithEnergySpread	0x40	エネルギー拡散を考慮した値を積算

MTFの算出

extern float ctfMTFFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);

RによるMTFの値を算出
info->Magnification: 引数Rの倍率
info->flagSampling=1のとき: 標本化関数を積算(ctfFunctionSamplingを呼び出す: info->NyquistFrequencyを第2引数(ナイキスト)とする)

モード	値	説明	MTF算出時に使用するinfoのメンバ
ctfInfoMTFModeSingleExp	0	指数関数	BofMTF
ctfInfoMTFModeSingleLorentzian	1	ローレンツ関数	BofMTF2
ctfInfoMTFModeBoth	2	指数関数×ローレンツ関数	BofMTF, BofMTF2
ctfInfoMTFModeLinear	3	リニア	BofMTF
ctfInfoMTFModeBothSum	4	指数関数+ローレンツ関数	BofMTF, BofMTF2, WeightOfSecondTermForMTF(2つの関数を加える割合)
ctfInfoMTFModePolynomial	5	多項式	BofMTF, BofMTFd2, BofMTFd3, BofMTFd4, BofMTFd5

標本化関数の算出

Rによる標本化関数の値を算出

extern float ctfFunctionSampling(float R, float Nyquist, long mode);

電子線の波長の取得

extern float wavelengthOfElectron(float E);

トーンリングからデフォーカスを推定

extern float defocusDeterminationFromThonRing(ctfInfo* info, float R, long n, long mode);

電子線の波長: wavelengthOfElectronより算出
コントラスト: info->modeにより算出方法を設定

info->mode(0x0fでマスク)	説明
0	位相コントラストだけ
1	強度コントラストを加える

CTF補正時の重みの算出

CTF補正で使用する重みを出力

extern float ctfWeightForCorrection(ctfInfo* info, float R, long mode);

mode	説明
0	1を返す(補正無し)
1	ctf/\|ctf\| (逆位相)
2	ctf (逆位相 x CTF補正)
3	1/ctf (0.1<\|ctf\| ) (CTF補正 / 逆位相)
4	ctf/(SQR(ctf)+SQR(NS)) phase-flipping + Winner Filtering
5	SQR(ctf) x ctf/\|ctf\| phase-flipping + ctf-Weighted
6	1/\|ctf\| (0.1<\|ctf\|) No phase-flipping + ctf-divided
7	\|ctf\|/(SQR(ctf)+SQR(NS)) No phase flipping + Winner Filtering

2Dの場合

X, YからRを求めて引数としてctfWeightForCorrectionを呼び出す

extern float ctfWeightForCorrection2D(ctfInfo* info, float X, float Y, long mode);

分子のエンベロープ

ファイル読み込み

extern void lmolecularEnvelopeFileRead(FILE* fpt, molecularEnvelope* mol, int mode);

ファイル書き出し

extern void lmolecularEnvelopeFileWrite(FILE* fpt, molecularEnvelope* mol, int mode);

リサンプリング

extern void lmolecularEnvelopeResampling(molecularEnvelope* dst, molecularEnvelope* src, float dR, float RMax, int mode);

srcにおけるRのエンベロープ値を取得

extern float lmolecularEnvelopeDataGet(molecularEnvelope* src, float R, int mode);

CTF情報

ファイル読み込み

extern void ctfInfoRead(FILE* fpt, ctfInfo* ctf, char* pre, int mode);

ファイル書き出し

extern void ctfInfoWrite(FILE* fpt, ctfInfo ctf, char* pre, int mode);

PVMインストール時のみ使用可

extern void ctfInfoSendByPVM(ctfInfo* info, int tid, long mode);
extern void ctfInfoRecieveByPVM(ctfInfo* info, int tid, long mode);
extern void  ctfFunctionPVMStart(ctfInfo* info, float R, int tid, long mode);
extern float ctfFunctionPVMEnd(ctfInfo* info, float R, int tid, long mode);
extern void  ctfFunctionPVMServer();

ヘルプ

extern void ctfWeightForCorrectionUsage(FILE* fpt);

「ctfInfo(API)」の版間の差分

2015年11月18日 (水) 06:22時点における最新版

目次

定数

モード選択

マスク用

モード値の定義

コントラストモード

envelope関数のモード

構造体

ctfInfo

API

スキャッタリング

シグナル

分子のエンベロープを算出

ノイズ

振動関数の算出

CTFの算出

2Dの場合

Envelope関数の算出

MTFの算出

標本化関数の算出

電子線の波長の取得

トーンリングからデフォーカスを推定

CTF補正時の重みの算出

2Dの場合

分子のエンベロープ

CTF情報

PVMインストール時のみ使用可

ヘルプ

案内メニュー

表示

個人用ツール

案内

検索

ツール

@@ 行125: / 行125: @@
 == 構造体 ==
+分子のエンベロープ関連で使用
   typedef struct moleculrEnvelope {
   	char* filename;
@@ 行132: / 行136: @@
   	int    mode;
   } molecularEnvelope;
+=== ctfInfo ===
+ＣＴＦを計算する上で必要なパラメータになります。
+電子顕微鏡や照射条件により決まるもの
+<table border=1>
+<tr><td> kV <td> [kV] <td> 加速電圧（電子線の加速電圧、単位はkV）
+<tr><td> Cc <td> [mm] <td> 色収差係数（単位はmm）
+<tr><td> dE <td>  <td> エネルギーの揺らぎ幅（色収差を使った包絡関数の計算に必要）
+<tr><td> Cs <td> [mm] <td> 球面収差係数（単位はmm）
+<tr><td> Ain <td> [mrad] <td> 照射半角（単位はmrad）（球面収差係数やデフォーカスによる包絡関数の計算に必要）(ファイル上ではAiとして表示）
+</table>
+デフォーカスにより決まるもの
+<table border=1>
+<tr><td> defocus <td> [A] <td> デフォーカス量(単位はオングストーローム、正がアンダーフォーカス）
+<tr><td> flagAstigmatism <td> Integer <td> 非点を考慮するかどうかのフラグ（０：考慮しない、１：考慮する）
+<tr><td> defocus2D float[2]<td> [A] <td> デフォーカス量
+</table>
+試料（シグナル）によって決まるもの
+<table border=1>
+<tr><td> I0 <td> <td> シグナル強度
+<tr><td> Isignal <td> <td> シグナル強度
+<tr><td> Inoise <td> <td> ノイズ強度
+<tr><td> flagWhiteNoise <td> Integer <td> ホワイトノイズ（ＭＴＦにより影響を受ける成分）
+<tr><td> WhiteNoise <td> <td> ノイズ強度
+<tr><td> flagWhiteNoiseRasing <td> Integer <td> ホワイトノイズのＭＴＦの落ちを考慮するかどうか
+<tr><td> WhiteNoiseRasing <td> <td> MTFによりノイズが崩落する成分
+</table>
+解析の際に利用する量
+<table border=1>
+<tr> <td> flagWin <td> Integer <td> 窓関数をかけるかどうかのフラグ（０：かけない、１：かける）
+<tr> <td> CutLow <td> A-1  <td> 窓関数の低周波側のエッジ
+<tr> <td> CutHigh <td> A-1 <td> 窓関数の高周波側のエッジ
+</table>
 各APIの引数として使用する設定
@@ 行225: / 行269: @@
 == API ==
-  extern void ctfInfoSendByPVM(ctfInfo* info, int tid, long mode);
+==== スキャッタリング ====
- extern void ctfInfoRecieveByPVM(ctfInfo* info, int tid, long mode);
+シグナル(ctfSignalFunctionより)にノイズ(ctfNoiseFunctionより)を加えたときの値を返します。
+  extern float ctfScatteringFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
+==== シグナル ====
+シグナルを出力<br>
+(ctfFunction, ctfMolecularEnvelopeFunction, ctfMolecularEnvelopeInElasticFunction, ctfVibrationFunction, ctfMTFFunctionを使用)<br>
+info->flagAliasing=trueのとき: エイリアシングを加えます。(info->NyquistFrequencyによる)
   extern float ctfSignalFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
- extern float ctfNoiseFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
- extern float ctfNoise2Function(ctfInfo* info, float R, long mode);
+上記のシグナルを強度で出力
   extern float ctfSignalPowerFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
- extern float ctfNoisePowerFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
- extern float ctfNoise2PowerFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
+===== 分子のエンベロープを算出 =====
- extern float ctfScatteringFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
+info->flagMolecEnvTable=trueのときはlmolecularEnvelopeDataGetを呼び出して、テーブル(info->MolecEnvTable)を元に算出
   extern float ctfMolecularEnvelopeFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
   extern float ctfMolecularEnvelopeInElasticFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
+==== ノイズ ====
+ホワイトノイズ(info->WhiteNoise)や[[MTF]](ctfMTFFunctionより)などを掛け合わせて算出したノイズを出力<br>
+info->flagAliasing=trueのとき: エイリアシングを加えます。(info->NyquistFrequencyによる)
+ extern float ctfNoiseFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
+上記のノイズを強度で出力
+ extern float ctfNoisePowerFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
+ホワイトノイズにinfo->WhiteNoise2を使用して、ノイズを出力
+ extern float ctfNoise2Function(ctfInfo* info, float R, long mode);
+上記のノイズを強度で出力
+ extern float ctfNoise2PowerFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
 ==== 振動関数の算出 ====
-Rによる振動関数の値を算出します。<br>
+Rによる振動関数の値を算出<br>
 info->Magnification: Rの倍率
   extern float ctfVibrationFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
@@ 行246: / 行310: @@
 ==== [[CTF]]の算出 ====
   extern float ctfFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
-Rによる[[CTF]]の値を算出します。<br>
+Rによる[[CTF]]の値を算出<br>
 電子線の波長: wavelengthOfElectronより算出<br>
-コントラスト: info->modeにより算出方法を設定<br>
+コントラスト: info->modeにより算出方法を設定
-envelope: ctfEnvelopFunctionより算出
 	<table border="1">
 		<div align="left">
 			<tr>
-				<th>info->mode</th>
+				<th>info->mode(0x0fでマスク)</th>
-				<th>マスク部分</th>
 				<th>説明</th>
 			</tr>
 			<tr>
-				<td>ctfInfoModeWithAmplitudeContrast</td>
+				<td>0</td>
-				<td>0x0f</td>
+				<td>位相コントラストだけ</td>
-				<td>コントラストモード</td>
+			</tr>
+			<tr>
+				<td>1</td>
+				<td>強度コントラストを加える</td>
 			</tr>
 		</div>
@@ 行267: / 行332: @@
 ===== 2Dの場合 =====
-ctfFunctionを呼び出して2Dでの[[CTF]]を算出(X, YからRを求めて引数とする)
+X, YからRを求めて引数としてctfFunctionを呼び出す
   extern float ctfFunction2D(ctfInfo* info, float X, float Y, long mode);
-===== PVM使用時 =====
- extern void  ctfFunctionPVMStart(ctfInfo* info, float R, int tid, long mode);
- extern float ctfFunctionPVMEnd(ctfInfo* info, float R, int tid, long mode);
- extern void  ctfFunctionPVMServer();
 ==== Envelope関数の算出 ====
   extern float ctfEnvelopFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
-Rによるenvelope関数の値を算出します。<br>
+Rによるエンベロープ関数の値を算出<br>
 wavelengthOfElectronにより電子線の波長を取得<br>
 info->flagMagnification=1のとき: info->Magnification(0以外で)をRの倍率として掛ける
@@ 行308: / 行368: @@
 ==== [[MTF]]の算出 ====
   extern float ctfMTFFunction(ctfInfo* info, float R, long mode);
-Rによる[[MTF]]の値を算出します。<br>
+Rによる[[MTF]]の値を算出<br>
 info->Magnification: 引数Rの倍率<br>
 info->flagSampling=1のとき: 標本化関数を積算(ctfFunctionSamplingを呼び出す: info->NyquistFrequencyを第2引数(ナイキスト)とする)
@@ 行360: / 行420: @@
 ==== 標本化関数の算出 ====
-Rによる標本化関数の値を算出します。
+Rによる標本化関数の値を算出
   extern float ctfFunctionSampling(float R, float Nyquist, long mode);
@@ 行368: / 行428: @@
 ==== トーンリングからデフォーカスを推定 ====
   extern float defocusDeterminationFromThonRing(ctfInfo* info, float R, long n, long mode);
+電子線の波長: wavelengthOfElectronより算出<br>
+コントラスト: info->modeにより算出方法を設定
 	<table border="1">
 		<div align="left">
 			<tr>
-				<th>info->mode</th>
+				<th>info->mode(0x0fでマスク)</th>
-				<th>マスク部分</th>
 				<th>説明</th>
 			</tr>
 			<tr>
-				<td>ctfInfoModeWithAmplitudeContrast</td>
+				<td>0</td>
-				<td>0x0f</td>
+				<td>位相コントラストだけ</td>
-				<td>コントラストモード</td>
+			</tr>
+			<tr>
+				<td>1</td>
+				<td>強度コントラストを加える</td>
 			</tr>
 		</div>
@@ 行384: / 行448: @@
 <br>
- extern float ctfWeightForCorrection2D(ctfInfo* info, float X, float Y, long mode);
+==== CTF補正時の重みの算出 ====
+CTF補正で使用する重みを出力
   extern float ctfWeightForCorrection(ctfInfo* info, float R, long mode);
+	<table border="1">
+		<div align="left">
+			<tr>
+				<th>mode</th>
+				<th>説明</th>
+			</tr>
+			<tr>
+				<td>0</td>
+				<td>1を返す(補正無し)</td>
+			</tr>
+			<tr>
+				<td>1</td>
+				<td>ctf/|ctf| (逆位相)</td>
+			</tr>
+			<tr>
+				<td>2</td>
+				<td>ctf (逆位相 x CTF補正)</td>
+			</tr>
+			<tr>
+				<td>3</td>
+				<td>1/ctf    (0.1<|ctf| ) (CTF補正 / 逆位相)</td>
+			</tr>
+			<tr>
+				<td>4</td>
+				<td>ctf/(SQR(ctf)+SQR(NS))    phase-flipping + Winner Filtering</td>
+			</tr>
+			<tr>
+				<td>5</td>
+				<td>SQR(ctf) x ctf/|ctf|      phase-flipping + ctf-Weighted</td>
+			</tr>
+			<tr>
+				<td>6</td>
+				<td>1/|ctf|  (0.1<|ctf|)      No phase-flipping + ctf-divided</td>
+			</tr>
+			<tr>
+				<td>7</td>
+				<td>|ctf|/(SQR(ctf)+SQR(NS))  No phase flipping + Winner Filtering </td>
+			</tr>
+		</div>
+	</table>
+<br>
+===== 2Dの場合 =====
+X, YからRを求めて引数としてctfWeightForCorrectionを呼び出す
+ extern float ctfWeightForCorrection2D(ctfInfo* info, float X, float Y, long mode);
+==== 分子のエンベロープ ====
+ファイル読み込み
   extern void lmolecularEnvelopeFileRead(FILE* fpt, molecularEnvelope* mol, int mode);
+ファイル書き出し
   extern void lmolecularEnvelopeFileWrite(FILE* fpt, molecularEnvelope* mol, int mode);
+リサンプリング
   extern void lmolecularEnvelopeResampling(molecularEnvelope* dst, molecularEnvelope* src, float dR, float RMax, int mode);
+srcにおけるRのエンベロープ値を取得
   extern float lmolecularEnvelopeDataGet(molecularEnvelope* src, float R, int mode);
+==== CTF情報 ====
+ファイル読み込み
   extern void ctfInfoRead(FILE* fpt, ctfInfo* ctf, char* pre, int mode);
+ファイル書き出し
   extern void ctfInfoWrite(FILE* fpt, ctfInfo ctf, char* pre, int mode);
+==== PVMインストール時のみ使用可 ====
+ extern void ctfInfoSendByPVM(ctfInfo* info, int tid, long mode);
+ extern void ctfInfoRecieveByPVM(ctfInfo* info, int tid, long mode);
+ extern void  ctfFunctionPVMStart(ctfInfo* info, float R, int tid, long mode);
+ extern float ctfFunctionPVMEnd(ctfInfo* info, float R, int tid, long mode);
+ extern void  ctfFunctionPVMServer();
 ==== ヘルプ ====
   extern void ctfWeightForCorrectionUsage(FILE* fpt);