「チュートリアル一覧」の版間の差分
提供: Eospedia
(→Small Tools) |
(→Makefileの共通操作) |
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==== Makefileの共通操作 ==== | ==== Makefileの共通操作 ==== | ||
===== Initial ===== | ===== Initial ===== | ||
| + | <pre> | ||
| + | $ make Initial | ||
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コマンドに必要な入力ファイルを作成します。<br> | コマンドに必要な入力ファイルを作成します。<br> | ||
===== Exe ===== | ===== Exe ===== | ||
| + | <pre> | ||
| + | $ make Exe | ||
| + | </pre> | ||
コマンドのサンプルを実行します。<br> | コマンドのサンプルを実行します。<br> | ||
===== Final ===== | ===== Final ===== | ||
| + | <pre> | ||
| + | $ make Final | ||
| + | </pre> | ||
コマンドの出力ファイルを画像ファイルなどを作成して視覚化します。<br> | コマンドの出力ファイルを画像ファイルなどを作成して視覚化します。<br> | ||
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| + | ===== all ===== | ||
| + | <pre> | ||
| + | $ make all | ||
| + | </pre> | ||
| + | Initial -> Exe -> Final の順にコマンドを実行します。<br> | ||
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| + | <pre> | ||
| + | $ make help | ||
| + | </pre> | ||
| + | または | ||
| + | <pre> | ||
| + | $ make | ||
| + | </pre> | ||
| + | このコマンドのMakefileのヘルプを表示します。<br> | ||
==== mrcImage ==== | ==== mrcImage ==== | ||
2014年10月23日 (木) 01:24時点における版
目次
チュートリアルを始める前に
まず、#TIPSと#SampleDataをダウンロードします。
チュートリアル一覧
$EOS_HOME/tutorial/におけるチュートリアルデータを示します。
2DClustering
クラスター解析用のMakefileです。
統合コマンド#クラスター解析参照。
CTFCorrection
CTF補正用のMakefileです。
統合コマンド#CTF補正参照。
SampleData
ここには共通で使用する入力画像やデータがあります。
(/tutorial/SampleData)
SingleParticle
単粒子解析用のMakefileです。
統合コマンド#単粒子解析参照。
Small Tools
Small Toolsに対応したMakefileです。対応済みのコマンドを記載しています。
使用方法は各コマンドのページをご覧下さい。この項目のリストはこちらのシェルスクリプトで作成しております。
Makefileの共通操作
Initial
$ make Initial
コマンドに必要な入力ファイルを作成します。
Exe
$ make Exe
コマンドのサンプルを実行します。
Final
$ make Final
コマンドの出力ファイルを画像ファイルなどを作成して視覚化します。
all
$ make all
Initial -> Exe -> Final の順にコマンドを実行します。
help
$ make help
または
$ make
このコマンドのMakefileのヘルプを表示します。
mrcImage
| mrcImageFourierNeighborCorrelation | Makefile |
| mrcImageROI3D | Makefile |
TIPS
ここには他のMakefileで共通に使用するMakefileがあります。
新たにMakefileを作成するときはこちらの一部をincludeして使用すると、作成が楽になります。
(/tutorial/TIPS)
Tomography
電子線トモグラフィー用のMakefileです。
統合コマンド#電子線トモグラフィー参照。