「lpdbSurface(API)」の版間の差分
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extern void lpdbSurfaceAsTemperatureFactor(pdbFile* pdb, lpdbSurfaceInfo* info, lpdbSurfaceMode mode); | extern void lpdbSurfaceAsTemperatureFactor(pdbFile* pdb, lpdbSurfaceInfo* info, lpdbSurfaceMode mode); |
2014年10月7日 (火) 08:02時点における最新版
DataManip/pdbFile/src/lpdbSurfaceはpdbSurfaceのためのAPI です。
定数
lpdbSurfaceAsTemperatureFactorの引数modeで使用します。
typedef enum lpdbSurfaceMode { lpdbSurfaceModeSimple=0 } lpdbSurfaceMode;
構造体
typedef struct lpdbSurfaceInfo { double order; /* Angstrom */ int refine; /* mesh size is equal to order/refine */ int size; /* contour surface thickness is equal to order/refine*(2*size+1) */ double mergin; /* Search Area */ double weight; /* Weight Value */ double thresHold; /* exp(-thresHold) */ int DensityMode; } lpdbSurfaceInfo;
API
温度因子を算出し、pdb->PDB->TemperatureFactorへ格納します。
extern void lpdbSurfaceAsTemperatureFactor(pdbFile* pdb, lpdbSurfaceInfo* info, lpdbSurfaceMode mode);