「mrcImageFourierNeighborCorrelation」の版間の差分

2014年10月14日 (火) 05:22時点における版 (ソースを閲覧) Kinoshita (トーク | 投稿記録) ←古い編集		2014年10月14日 (火) 05:43時点における版 (ソースを閲覧) Kinoshita (トーク | 投稿記録) (→‎-mask のファイルの画像) 新しい編集→
行234:		行234:
	標準誤差<br></p>		標準誤差<br></p>
	</td>		</td>
−	<td><p align="left"><br>	+	<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
−	<br>	+	1 (26, 47, 12)<br>
−	<br>	+	0.284269<br>
−	<br>	+	0.451065<br>
−	<br></p>	+	0.000563832<br></p>
	</td>		</td>
	</tr>		</tr>

---

2014年10月14日 (火) 05:43時点における版

mrcImageFourierNeighborCorrelationは、フーリエ空間の冗長性を利用した分解能をチェックする為のEosのコマンドです。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage(3D)	NULL
-o	選択	出力ファイル: ASCII(FNC)	stdout
-d	選択	delta(フーリエ空間)	0.0
-C	選択	CentreMode	0
-M	選択	補間モード	0
-FSC	選択	予測したFSCの出力フラグ
-mask	選択	入力ファイル: mrcImage(3D)(Mask for FSC)	NULL
-maskBack	選択	入力ファイル: mrcImage(3D)(Mask for FSC Back)	NULL
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

-Cの詳細

モード	説明
0	中心を画像の中心とする: (Nx/2.0, Ny/2.0, Nz/2.0 )
1	中心を原点(左下端)とする: (0, 0, 0 )
2	中心を画像のStartNとする: (StartNx,StartNy,StartNz)

-Mの詳細

補間モード参照。

-mの詳細

モード	説明
0

実行例

入力ファイルの画像

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-2390.42 (77, 14, 69) 4374.62 (17, 62, 46) 72.1487 577.82 0.722275

オプション必須項目のみの場合

  0.000000   0.863711          1 
  0.012500   0.553876         18 
  0.025000   0.170684         64 
  0.037500   0.221808        146 
  0.050000   0.230874        266 
  0.062500   0.280359        382 
  0.075000   0.269777        588 
  0.087500   0.280955        746 
  0.100000   0.322332       1002 
  0.112500   0.249747       1294 

-中略-

  0.750000  -0.005313       2256 
  0.762500   0.036957       1688 
  0.775000   0.021723       1264 
  0.787500   0.010364        864 
  0.800000  -0.026498        568 
  0.812500  -0.009259        312 
  0.825000  -0.009356        144 
  0.837500   0.030291         72 
  0.850000  -0.109028          8 
  0.862500   0.000000          0 

オプション -d

d=0.025で実行

  0.000000   0.630209          7 
  0.025000   0.327491        132 
  0.050000   0.228926        498 
  0.075000   0.279077       1136 
  0.100000   0.297614       2046 
  0.125000   0.231185       3120 
  0.150000   0.177932       4574 
  0.175000   0.182045       6136 
  0.200000   0.243301       8014 
  0.225000   0.272185      10208 
  0.250000   0.237388      12690 
  0.275000   0.210439      15060 
  0.300000   0.177609      17970 
  0.325000   0.138364      21468 
  0.350000   0.118748      24602 
  0.375000   0.092290      28200 
  0.400000   0.072673      32302 
  0.425000   0.070219      36280 
  0.450000   0.060196      40758 
  0.475000   0.053160      45280 
  0.500000   0.038769      48478 
  0.525000   0.027983      45408 
  0.550000   0.020791      42404 
  0.575000   0.022048      38512 
  0.600000   0.014752      34148 
  0.625000   0.010083      29184 
  0.650000   0.002658      23676 
  0.675000   0.000445      17908 
  0.700000  -0.001615      11852 
  0.725000   0.000667       7368 
  0.750000   0.002666       4448 
  0.775000   0.030521       2512 
  0.800000  -0.017165       1112 
  0.825000   0.003291        336 
  0.850000   0.017206         32 

オプション -FSC, -mask, -maskBack

-mask のファイルの画像

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 1 (26, 47, 12) 0.284269 0.451065 0.000563832

-maskBack のファイルの画像

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

1 (0, 0, 0) 1 (0, 0, 0) 1 0 0