「チュートリアル一覧」の版間の差分

2014年10月23日 (木) 01:57時点における版

チュートリアルを始める前に

まず、#TIPSと#SampleDataをダウンロードします。

チュートリアル一覧

$EOS_HOME/tutorial/におけるチュートリアルデータを示します。

2DClustering

クラスター解析用のMakefileです。
統合コマンド#クラスター解析参照。

CTFCorrection

CTF補正用のMakefileです。
統合コマンド#CTF補正参照。

SampleData

ここには共通で使用する入力画像やデータがあります。
(/tutorial/SampleData)

SingleParticle

単粒子解析用のMakefileです。
統合コマンド#単粒子解析参照。

Small Tools

Small Toolsに対応したMakefileです。対応済みのコマンドを記載しています。
使用方法は各コマンドのページをご覧下さい。この項目のリストはこちらのシェルスクリプトで作成しております。

Makefileの共通操作

入力ファイルの作成

$ make Initial

コマンドに必要な入力ファイルを作成します。

コマンド実行

$ make Exe

コマンドのサンプルを実行します。

出力ファイルの視覚化

$ make Final

コマンドの出力ファイルを画像ファイルなどの作成により視覚化します。

all

$ make all

Initial -> Exe -> Final の順にコマンドを実行します。

ヘルプ

$ make help

または

$ make

このコマンドのMakefileのヘルプを表示します。
また、使用(include)している#TIPSのヘルプは以下のようにmake help_XXXXで表示することが出来ます。

例. /tutorial/TIPS/BackImage/ のヘルプ

$ make help_BackImage

mrcImage

mrcImageFourierNeighborCorrelation	Makefile
mrcImageROI3D	Makefile

TIPS

ここには他のMakefileで共通に使用するMakefileがあります。
新たにMakefileを作成するときはこちらの一部をincludeして使用すると、作成が楽になります。
(/tutorial/TIPS)

Tomography

電子線トモグラフィー用のMakefileです。
統合コマンド#電子線トモグラフィー参照。

@@ 行32: / 行32: @@
 ==== Makefileの共通操作 ====
-===== Initial =====
+===== 入力ファイルの作成 =====
 <pre>
 $ make Initial
@@ 行38: / 行38: @@
 コマンドに必要な入力ファイルを作成します。<br>
-===== Exe =====
+===== コマンド実行 =====
 <pre>
 $ make Exe
@@ 行44: / 行44: @@
 コマンドのサンプルを実行します。<br>
-===== Final =====
+===== 出力ファイルの視覚化 =====
 <pre>
 $ make Final
 </pre>
-コマンドの出力ファイルを画像ファイルなどを作成して視覚化します。<br>
+コマンドの出力ファイルを画像ファイルなどの作成により視覚化します。<br>
 ===== all =====
@@ 行56: / 行56: @@
 Initial -> Exe -> Final の順にコマンドを実行します。<br>
-===== help =====
+===== ヘルプ =====
 <pre>
 $ make help
@@ 行65: / 行65: @@
 </pre>
 このコマンドのMakefileのヘルプを表示します。<br>
+また、使用(include)している[[#TIPS]]のヘルプは以下のように'''make help_XXXX'''で表示することが出来ます。<br>
+====== 例. /tutorial/TIPS/BackImage/ のヘルプ ======
+<pre>
+$ make help_BackImage
+</pre>
+<br>
 ==== mrcImage ====

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