「ＰＤＢファイルの取り扱い」の版間の差分
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2013年5月5日 (日) 18:37時点における版
PDBファイルの取り扱い
原子モデルのおおざっぱな形
PDBファイルの中の原子モデルのおおざっぱな形を知りたいときがあります。そのためには、主成分分析(PCA(principal component analysis))を利用(pdbPCA)することができます。このプログラムは、要素をｘ、ｙ、ｚの３つの要素だと考え、PCAを用いて、最も分散の大きい方向の軸（第一主成分、楕円体とみなしたときの最長軸）、それに直交する２つの軸を求めるものです。このそれぞれの軸の情報を回転行列として利用すれば、最長軸をX軸に変換することができます。
