RELION tips

マスク

円筒マスクの作成

relion_helix_toolboxを用います。

> relion_helix_toolbox --cylinder --spherical_mask --cyl_outer_diameter <円筒の直径> --angpix <ピクセルサイズ Å/pix> --o <出力ファイル名> \
      --boxdim <ボックスサイズ pix> --sphere_percentage <ボックスサイズに対する球面マスクの直径の比率> --width <コサイン型ソフトエッジの幅>

• --cylinderで円筒マスクの作成を指定。
• --spherical_maskで円筒マスクを球マスクで削り、長さを調整。