ダウンロード
提供: Eospedia
Eosのダウンロード方法について
gitが利用できる方
gitがご利用できる方は、SourceForge.jpからのダウンロードが可能です。詳細は、[sourceforge]をご覧下さい。以下は、簡単にインストールに関連するコマンドをまとめておきます。
1.Eosの複製をgitを使って作製(初回)
$ cd Eosをインストールしたいディレクトリ($EOS_HOME) $ git clone --depth 1 ssh://${EOS_GIT_USER}@git.sourceforge.jp:/gitroot/eos/base.git こちらの登録は、開発者として登録できるものです or $ git clone --depth 1 git://git.sourceforge.jp/gitroot/eos/base.git こちらでダウンロードした場合には、そのままでは、Eos上で新たに開発したものを登録することができません。 開発者として登録をして下さい。 ※ --depth 1は、最新版のみを取得するためのオプション。つけない場合は、すべての履歴をコピーすることになる。
2.最新のものだけを付加する場合
$ git fetch ;# 変更があったファイルをダウンロード or $ git fetch ssh://${EOS_GIT_USER}@git.sourceforge.jp:/gitroot/eos/base.git or $ git fetch git://git.sourceforge.jp/gitroot/eos/base.git # 上記の終了後 $ git log FETCH_HEAD ;# 変更になっている部分を表示 $ git merge FETCH_HEAD ;# 変更になっているものをマージする
$EOS_HOME/Makefileが最新のものになっていれば、上記のことを下記のMakefileにて実行できます。
$ cd $EOS_HOME $ make git-fetch $ make git-merge
3. 自分自身が機能追加、修正をかけ、登録する場合
git add ; # 自分自身の複製で変更したものを加える git commit ; # 変更したモノをgitに格納する # git push ; # git serverに格納 or git push origin master or git push origin master
直接ダウンロードしたい方
下記のサイトから、バイナリtarballをダウンロードが可能です。
http://www.yasunaga-lab.bio.kyutech.ac.jp/ja/reserach/eos/eos-download-sites/
上記にアップされていないバイナリ形式に興味がある方は安永(yasunaga@bio.kyutech.ac.jp)までご連絡下さい。
作成されたディレクトリの構成(Eosの構造)は別ページにて説明しています。
※ 2013/02より、大幅にディレクトリの構成が変更になっています。ご注意下さい。目的は、ホスト依存のバイナリコードと非依存なソースコードを切り離すことが目的です。ヘテロな環境での実行を維持しながら、NFSなどでexportされた一つのディレクトリで実行するために変更しました。
動作環境
現在、手元に環境があり、動作することが確認出来ているのは、下記のものです。
LINUX 32bits/64bits OS-X 32bits/64bits Windows with Cygwin