「分解能解析」の版間の差分
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(ページの作成:「'''分解能解析'''は、三次元像の分解能を解析するための統合コマンドです。」) |
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+ | awk 'BEGIN {srand($(NSEED))} { printf("%10.7f %s\n", rand(), $$0); }' $*.3dlst \ | ||
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+ | | awk '{ printf("%s %s %15.6f %15.6f %15.6f %15.6f\n", $$2,$$3,$$4,$$5,$$6,$$7)}' \ | ||
+ | > $*.3dlst.sort | ||
+ | N1=`wc -l $*.3dlst.sort | awk '{print int($$1/2)}'`; echo $$N1; \ | ||
+ | N2=`wc -l $*.3dlst.sort | awk '{print $$1-int($$1/2)}'`; echo $$N2; \ | ||
+ | head -n $$N1 $*.3dlst.sort > $*.1.3dlst; \ | ||
+ | tail -n $$N2 $*.3dlst.sort > $*.2.3dlst | ||
+ | printf "%s\n%s\n" $*.1.3d $*.2.3d | xargs -L 1 -P 2 make | ||
+ | mrcImageFourierShellCorrelation -i1 $*.1.3d -i2 $*.2.3d -d $(DelR) > $*.3dFSC |
2013年5月18日 (土) 02:30時点における版
分解能解析は、三次元像の分解能を解析するための統合コマンドです。
Fourier Shell Correlation
三次元構造解析のための統合コマンド中で、XXX.3dlstが与えられていた場合には、下記の様にランダムに2つのグループに分け、FSCを求めることができます。
NSEED=0
.3dlst.3dFSC: awk 'BEGIN {srand($(NSEED))} { printf("%10.7f %s\n", rand(), $$0); }' $*.3dlst \ | sort \ | awk '{ printf("%s %s %15.6f %15.6f %15.6f %15.6f\n", $$2,$$3,$$4,$$5,$$6,$$7)}' \ > $*.3dlst.sort N1=`wc -l $*.3dlst.sort | awk '{print int($$1/2)}'`; echo $$N1; \ N2=`wc -l $*.3dlst.sort | awk '{print $$1-int($$1/2)}'`; echo $$N2; \ head -n $$N1 $*.3dlst.sort > $*.1.3dlst; \ tail -n $$N2 $*.3dlst.sort > $*.2.3dlst printf "%s\n%s\n" $*.1.3d $*.2.3d | xargs -L 1 -P 2 make mrcImageFourierShellCorrelation -i1 $*.1.3d -i2 $*.2.3d -d $(DelR) > $*.3dFSC