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'''分解能解析'''は、三次元像の分解能を解析するための統合コマンドです。
 
'''分解能解析'''は、三次元像の分解能を解析するための統合コマンドです。
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== Fourier Shell Correlation ==
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三次元構造解析のための統合コマンド中で、XXX.3dlstが与えられていた場合には、下記の様にランダムに2つのグループに分け、FSCを求めることができます。
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NSEED=0
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.3dlst.3dFSC:
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awk 'BEGIN {srand($(NSEED))} { printf("%10.7f %s\n", rand(), $$0); }' $*.3dlst \
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| sort \ 
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| awk '{ printf("%s %s %15.6f %15.6f %15.6f %15.6f\n", $$2,$$3,$$4,$$5,$$6,$$7)}' \
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> $*.3dlst.sort
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N1=`wc -l $*.3dlst.sort | awk '{print    int($$1/2)}'`; echo $$N1; \
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N2=`wc -l $*.3dlst.sort | awk '{print $$1-int($$1/2)}'`; echo $$N2; \
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head -n $$N1 $*.3dlst.sort > $*.1.3dlst; \
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tail -n $$N2 $*.3dlst.sort > $*.2.3dlst
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printf "%s\n%s\n" $*.1.3d $*.2.3d | xargs -L 1 -P 2 make
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mrcImageFourierShellCorrelation -i1 $*.1.3d -i2 $*.2.3d -d $(DelR) > $*.3dFSC

2013年5月18日 (土) 02:30時点における版

分解能解析は、三次元像の分解能を解析するための統合コマンドです。


Fourier Shell Correlation

三次元構造解析のための統合コマンド中で、XXX.3dlstが与えられていた場合には、下記の様にランダムに2つのグループに分け、FSCを求めることができます。


NSEED=0

.3dlst.3dFSC:
	awk 'BEGIN {srand($(NSEED))} { printf("%10.7f %s\n", rand(), $$0); }' $*.3dlst \
		| sort \ 
		| awk '{ printf("%s %s %15.6f %15.6f %15.6f %15.6f\n", $$2,$$3,$$4,$$5,$$6,$$7)}' \
		> $*.3dlst.sort
	N1=`wc -l $*.3dlst.sort | awk '{print     int($$1/2)}'`; echo $$N1; \
	N2=`wc -l $*.3dlst.sort | awk '{print $$1-int($$1/2)}'`; echo $$N2; \
	head -n $$N1 $*.3dlst.sort > $*.1.3dlst; \
	tail -n $$N2 $*.3dlst.sort > $*.2.3dlst
	printf "%s\n%s\n" $*.1.3d $*.2.3d | xargs -L 1 -P 2 make 
	mrcImageFourierShellCorrelation -i1 $*.1.3d -i2 $*.2.3d -d $(DelR) > $*.3dFSC