「3次元再構成・逆投影」の版間の差分

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(3次元再構成法の概要)
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2.重み付き逆投影法(Weighted Backprojection) ()
 
2.重み付き逆投影法(Weighted Backprojection) ()
 
 
3.フィルター付逆投影法(Eos)
 
3.フィルター付逆投影法(Eos)
 
 投影像の投影角に基づいて、フーリエ空間でフィルタをかけます。
 
 投影像の投影角に基づいて、フーリエ空間でフィルタをかけます。
 
ローフィルタというフィルタが1軸投影(トモグラフィー)などの場合にはよく用いられます。
 
ローフィルタというフィルタが1軸投影(トモグラフィー)などの場合にはよく用いられます。
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2、3の区別は非常に難しいですが、原理的にはまったく違いがないと考えるべきでしょう.
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4.繰り返し法(Iterative Method)
 
4.繰り返し法(Iterative Method)
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演習では、重み付き逆投影法を用います。
 
演習では、重み付き逆投影法を用います。
 
  
 
== 3次元再構成の実際 ==
 
== 3次元再構成の実際 ==

2014年5月13日 (火) 06:02時点における版

3次元再構成法の概要

3次元再構成法にはいくつかの方法があります。(Eos)としたものは、Eosで対応している手法です。

1.単純逆投影法(Simple Backprojection) (Eos)  単純に逆投影を実施するものです。


2.重み付き逆投影法(Weighted Backprojection) () 3.フィルター付逆投影法(Eos)  投影像の投影角に基づいて、フーリエ空間でフィルタをかけます。 ローフィルタというフィルタが1軸投影(トモグラフィー)などの場合にはよく用いられます。 2、3の区別は非常に難しいですが、原理的にはまったく違いがないと考えるべきでしょう.


4.繰り返し法(Iterative Method)

 4.1 SIRT法(Simultaneous Iterative Reconstruction Technique)

 4.2 ART法(Algebric Iterative Reconstruction Technique)(未対応)

5.ラドン変換による方法 (Eos)

演習では、重み付き逆投影法を用います。

3次元再構成の実際

重み付き逆投影法

重み付き逆投影法による3次元再構成法をするためのプログラムです。

.3dlst.3d:
	mrc2Dto3D -I $(TARGET).3dlst -o $(TARGET).3d -InterpolationMode 2 -Double -DoubleCounter $(TARGET).3dcounter -CounterThreshold 0.5 -m 1 -WeightMode 2

$(TARGET).3dcounterが重みを表現しています。$(TARGET).3d及び$(TARGET).3dcounterがあれば、mrcImageAverageを使って、3次元画像を平均することができます。


ラドン変換による方法

ラドン変換を用いて3次元再構成を行うには以下のコマンドを使用します。

2次元画像のセット(複数枚)

↓ 各画像にmrcImageSinogramCreateにてシノグラム(2次元ラドン空間)に変換する

シノグラムのセット(複数枚)

mrcRadon2Dto3Dにて3次元ラドンにする

3次元ラドンファイル

mrcImageInverseRadonTransformにてラドン逆変換を行う

3次元ファイル(再構成完了)