「画像フォーマット変換」の版間の差分
提供: Eospedia
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*MRCからGIFへの変換(グレースケール):[[mrc2gif]] | *MRCからGIFへの変換(グレースケール):[[mrc2gif]] |
2012年9月9日 (日) 15:00時点における版
電子顕微鏡で撮影したデータは、それぞれ異なります。Eosの中では、MRC型のフォーマットを採用して変換するために、MRC型のフォーマットに変換する必要があります。
Eosにおけるファイル変換
- TIFからMRCの変換(グレースケール):tiff2mrc
課題:提供したファイルのフォーマットをMRC型に変換してみましょう。
- MRCからTIFへの変換(グレースケール):mrc2tiff
課題:提供したファイルのフォーマットをTIFF形式に変換してみましょう。
- MRCからGIFへの変換(グレースケール):mrc2gif
- MRCからGIFへの変換(RGBによる色付):mrcImageColoring
- arra2mrc
- emData2mrc
- bin2mrc
- ip2mrc
- moi2mrc
- mrc2lattice
- mrc2viff
- mrc2fld
- mrc2pov
- pdb2ucd
- dos2unix
EosにおけるMRCファイルフォーマット
注意:同じMRC型のフォーマットでも、少しずつ違います。注意しましょう。
- Willy Wriggers:Situs, CCP4 and MRC 3D Density Map File Formats and Format Conventionsレポート
Eosの場合には、下記の点に注意しましょう。
1.Lengthの取り扱いが、通常、Voxel辺りのサンプリング間隔になっています。他のフォーマットと異なっていますので、ご注意下さい。
2.CCP4−2000(MRC2000)に少しずつ対応させています。現在、読み取り側には対応しています。書き出し側は完全には対応できていません。
3.コマンドによっては、一部の内容がきちんとなっていない場合があります。振る舞いがおかしいときは、mrcInfoで確認した後、mrcInfoSetで設定して下さい。