統合コマンド

提供: Eospedia
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統合コマンド一覧 

Eosが提供している統合コマンドの一覧を示します。現在は、ほとんどMakefileもしくはbashで書かれています。少しずつPIONEでの記述も提供します。

画像補正


CTFの補正


単粒子解析


2次元画像の分類(クラスター解析)と平均像の獲得


クラスター解析

実行例1: Media:Makefile-Cluster.zip


リファレンスがある場合の3次元再構成


参照像の作成

PCAを使った場合: Media:Makefile-Ref.zip

PDBファイルを使った場合: Media:Makefile-Ref1.zip

1軸回転: ファイル:Makefile-Reconstrucion1.zip

ファイル:Mediafile-Reconstrucion.zip

ファイル:Mediafile-Reconstrucion0.zip

ファイル:Mediafile-Reconstrucion1.zip

ファイル:Mediafile-Reconstrucion3.zip

ファイル:Mediafile-Reconstrucion4.zip

ファイル:Makefile-Reconstruction.zip

ファイル:Makefile-Radon.zip

らせん単粒子解析


電子線トモグラフィー


複数領域のROIのある電子線トモグラフィー法

ファイル:Makefile-Tomogram.zip

ファイル:Makefile-Tomogram1.zip

ファイル:Makefile-Tomogram2.zip

ファイル:Makefile-Tomogram3.zip

ファイル:Makefile-Tomogram4.zip

ファイル:Makefile-Tomogram5.zip

ファイル:Makefile-Tomogram6.zip

ファイル:Makefile-Tomogram7.zip

らせん対称性解析


らせん対称性を利用した3次元再構成


2次元画像処理


3次元画像処理


分解能解析


FRET解析


モデリング