「電子線トモグラフィー」の版間の差分

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(ラフ・アラインメント)
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 傾斜画像の中心付近の画像の相関から、それぞれの傾斜画像の大まかな位置を合わせます。
 
 傾斜画像の中心付近の画像の相関から、それぞれの傾斜画像の大まかな位置を合わせます。
  
== アラインメント ==
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 傾斜画像の軸の位置、角度を出来る限り一致させます。
 
 傾斜画像の軸の位置、角度を出来る限り一致させます。
  
== 3次元再構成 ==
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 2次元画像のセットから3次元画像を再構成します。
 
 2次元画像のセットから3次元画像を再構成します。
  
== 画像のもつ問題点 ==
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== [[電子線トモグラフィー画像のもつ問題点]] ==
 
 全方位からの投影像を得られないために、ミッシングエリアとよばれる情報がない領域があります。そのため、方向依存でのボケを生じます。
 
 全方位からの投影像を得られないために、ミッシングエリアとよばれる情報がない領域があります。そのため、方向依存でのボケを生じます。
  
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=== セグメンテーション ===
 
=== セグメンテーション ===
  
== 画像の解釈 ====
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== [[電子線トモグラフィー画像の解釈]] ====
 
 また、多様な構造を含むため、3次元画像から興味あるセグメントを切り出すなどの作業が必要です。そのための支援ソフトウェアが必要です。
 
 また、多様な構造を含むため、3次元画像から興味あるセグメントを切り出すなどの作業が必要です。そのための支援ソフトウェアが必要です。
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== [[サブトモグラムの平均化]]==

2013年11月18日 (月) 00:40時点における版

電子線トモグラフィーとは、電子顕微鏡を用いた3次元再構成法の一つで、同一視野を様々な方向からの投影された電子顕微鏡像をコンピュータの中で三次元像に再構成し、コンピュータを使って断層像(トモグラム)を作成する手法です。

 下記にその手順を順に述べていきます。

連続傾斜像の撮影

画像の補正

 傾斜画像では、視野全体がアンダーフォーカスとなるように、通常の電子顕微鏡撮影よりも大きなデフォカース値をとる場合が多いです。その場合、LaB6などの電子銃では第一トーンリングより外側の情報がほとんど無いために、CTF補正等は必要ありませんが、電界放出銃を利用した場合には、場合によっては間違った情報を与える場合があるので注意が必要です。

ラフ・アラインメント

 傾斜画像の中心付近の画像の相関から、それぞれの傾斜画像の大まかな位置を合わせます。

ファイン・アラインメント

 傾斜画像の軸の位置、角度を出来る限り一致させます。

3次元再構成

 2次元画像のセットから3次元画像を再構成します。

電子線トモグラフィー画像のもつ問題点

 全方位からの投影像を得られないために、ミッシングエリアとよばれる情報がない領域があります。そのため、方向依存でのボケを生じます。

トモグラフに使われる画像処理

平滑化

セグメンテーション

電子線トモグラフィー画像の解釈 ==

 また、多様な構造を含むため、3次元画像から興味あるセグメントを切り出すなどの作業が必要です。そのための支援ソフトウェアが必要です。

サブトモグラムの平均化