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(ネットワーク関係)
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(追記) 上記はoverlayネットワークがダウンしていたわけではなく、計算機再起動によりswarm通信用のポートが閉じていたためだった。[[DockerでcryoSPARCクラスタ#ホストマシンを再起動した後のクラスタの復旧]]
 
(追記) 上記はoverlayネットワークがダウンしていたわけではなく、計算機再起動によりswarm通信用のポートが閉じていたためだった。[[DockerでcryoSPARCクラスタ#ホストマシンを再起動した後のクラスタの復旧]]
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とあるノードにて
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と出てきてswarmに参加できない

2020年11月17日 (火) 11:44時点における版

Dockerを利用して研究、開発の環境を構築する方法を書いていきます。

用語の整理

なかなかに複雑なので用語を整理しておきます。間違っている部分もあるかもしれないので、適宜修正してください。

Docker用語の整理
用語 説明
Docker
Docker machine
Docker engine
Docker desktop
Docker CLI
Docker compose
Docker swarm 複数のホストマシン上のDockerをネットワークを介して相互接続する機能。
Kubernetes (K8s)
NVIDIA Docker
NVIDIA Container Toolkit

Dockerのネットワークについて

1つのホストマシン上のDocker上でのコンテナ間の通信や、複数のホストマシン上のDocker上でのコンテナ間の通信、自分の好みのDockerネットワークを組む方法などについて、公式ドキュメント( https://docs.docker.com/network/ )がある。

Docker swarm

複数のホストマシン上のDockerをネットワークを介して相互接続する機能。SwarmでDockerのクラスタを作った暁には、overlayと呼ばれるタイプのDockerネットワークを作成し、そのネットワークへ(複数のホストで動作している)コンテナを参加させることで、ホストをまたいでのコンテナ間の通信が可能となる。他にも色々できる。

https://docs.docker.com/network/ で、Networking overview ⇒ Bridge network tutorial ⇒ Overlay networking tutorial と読み進めると、機能やありがたみが分かりやすいのではないかと思う。

Portainer

DockerのGUI管理ツールです。https://www.portainer.io/

ウェブブラウザでアクセスして管理、確認できます。

トラブルシューティング

ネットワーク関係

コンテナのネットワークが回復していないせいでコンテナが再起動できない

計算機を再起動したあと、ユーザー定義で作成したoverlayネットワークが何やらダウンして、復旧できなかった。

で、計算機の停止前にそのoverlayネットワークに参加していたコンテナに対し、計算機の再起動後にdocker startでコンテナ再起動しようとしたところ、以下のようなエラーが出て再起動してくれなかった。

Error response from daemon: Could not attach to network asuaxn22bff1sq8pqqay2sg64: context deadline exceeded
Error: failed to start containers: <コンテナ名>

ネットワークを復活させられればstart可能となるのか、そもそも同じネットワークを復活させられるのか、よくわからなかったが、とりあえず以下のようにしてネットワークからコンテナを切り離し、そのうえでコンテナをstartとすれば、立ち上がってくれるようにはなった。(もちろんネットワークからは抜けたまま)

> docker network disconnect <死んでるoverlayネットワークの名前> <コンテナ名>
> docker start <コンテナ名>

当該コンテナがどんなネットワークに属しているかは、

> docker inspect <コンテナ名>

で、"Networks"を見ればよい。(デフォルトで参加するネットワークは"bridge"で、それ以外を見ればよい)

(追記) 上記はoverlayネットワークがダウンしていたわけではなく、計算機再起動によりswarm通信用のポートが閉じていたためだった。DockerでcryoSPARCクラスタ#ホストマシンを再起動した後のクラスタの復旧

swarmに参加できない

  • 症状

とあるノードにて

> docker swarm join --token *** 192.168.5.88:2377

すると

Error response from daemon: unlinkat /var/lib/docker/swarm/certificates: read-only file system

と出てきてswarmに参加できない