LoGピッキングのSTARファイル
提供: Eospedia
画像ごとのSTARファイル
AutoPick/LoG_based/Movies/に、各画像ごとにピッキングした座標などを記録したSTARファイルが生成されます。
20170629_00021_frameImage_autopick.starを例にとってみます。
# RELION; version 3.0.5 data_ loop_ _rlnCoordinateX #1 _rlnCoordinateY #2 _rlnAutopickFigureOfMerit #3 _rlnClassNumber #4 _rlnAnglePsi #5 3555.794139 406.376473 0.662536 0 0.000000 3600.947080 485.394120 0.193001 0 0.000000 (以下略)
ピッキングされた単粒子の個数分だけレコードがあります。
各ラベル名の説明を以下にまとめました。
ラベル名 | 説明 |
---|---|
_rlnCoordinateX | ピッキングした座標のx座標[pixel] |
_rlnCoordinateY | ピッキングした座標のy座標[pixel] |
_rlnAutopickFigureOfMerit | 自動ピッキングのFOM値。(※要確認:FOM値とは具体的には何なのか?) |
_rlnClassNumber | クラス分類をした際に割り当てられる値。最も所属確率の高いクラスの番号が割り当てられる。LoGピッキング時点ではクラス分類を行なっていないので全て0 |
_rlnAnglePsi | 3番目のオイラー角ψ(または面内回転)の値[度]。LoGピッキングの時点では角度推定を行っていないため全て0.0 |